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FMRP蛋白6种异构体与FXR1蛋白间的相互作用被引量：4: 1998年; 脆性Ｘ综合征是最常见的遗传性智力低下疾病，其致病基因ＦＭＲ１存在复杂的选择剪接．ＦＭＲ１基因的功能及其选择剪接的生物学意义尚未阐明．ＦＭＲ１蛋白（ＦＭＲＰ）与脆性Ｘ相关蛋白１（ＦＸＲ１）可形成异源二聚体．采用酵母双杂交体系研究了由ＦＭＲ１第１２、１４、１５外显子不同选择剪接方式产生的６种ＦＭＲＰ异构体与ＦＸＲ１蛋白的相互作用，以期从蛋白质相互作用的角度探讨ＦＭＲ１基因选择剪接表达的生物学意义．结果表明各种异构体与ＦＸＲ１相互作用的强度随异构体蛋白肽链长度的增长而减弱．外显子１２、１４、１５的选择剪接虽然不能开关式控制ＦＭＲＰ与ＦＸＲ１的相互作用，但其Ｃ端亲水区在一定程度上影响相互作用的强弱．提示选择剪接对ＦＭＲＰ与ＦＸＲ１异源二聚体的稳定性产生影响．; 陈雨亭A.Sittler余珉吴冠芸J-L.Mandel沈岩; 关键词：异构体酵母双杂交体系

Dnm t3b cDNA及其在小鼠胚胎组织中选择剪接异构体的克隆被引量：1: 1999年; 目的　克隆与小鼠胚胎发育相关的新的全长cDNA。方法　从小鼠胚胎cDNA文库中筛选出一个新的EST,以8～9d龄小鼠胚胎组织mRNA为模板进行RACE(rapidamplificationofcDNAends),结合PCR筛选cDNA文库,获得其全长cDNA序列后进行序列同源检索、结构分析和功能预测。根据整合后的cDNA两端序列设计引物进行RT-PCR,克隆PCR产物,并对产物进行全序列测定,验证整合序列的客观性。结果　(1)克隆的序列为小鼠DNAC5胞嘧啶特异的重新甲基转移酶(denovoDNAcytosine5′-specificmethyltransferase,Dnmt)基因cDNA,发现该基因比已报道的Dnmt3bcDNA序列在5′方向延伸了152bp,其起始密码子上游存在一个新的选择剪接区域。(3)从小鼠胚胎组织中克隆出8种Dnmt3bcDNA选择剪接异构体,并均已获得Genbank序列接收号。结论　获得了Dnmt3bcDNA的4kb全长序列,发现Dnmt3b基因上游存在新的5′选择剪接序列,可能通过选择剪接形成上游终止密码子的切换;Dnmt3b在小鼠胚胎发育过程中存在着复杂的选择剪接表达。; 尹斌陈雨亭朱敏罗一菁朱宁徐世才吴冠芸沈岩; 关键词：DNA 胚胎组织 CDNA 克隆异构体

酵母双杂交体系(Yeast Two-Hybrid System):一种研究蛋白一蛋白相互作用的强有力方法被引量：2: 1997年; 双杂交体系是研究蛋白一蛋白相互作用的一种有效方法。将相互作用的两个蛋白分别与转录因子的DNA结合结构域和转录激活结构域融合成两个杂交体，在酵母细胞内，通过报告基因的表达情况反映两蛋白之间的相互作用。其主要特点是操作简单，可以研究蛋白间弱相互作用，通过筛库可直接得到与目的蛋白相互作用蛋白的DNA序列。用双杂交体系筛库时最值得注意的是假阳性问题。; 沈岩吴冠芸陈雨亭; 关键词：酵母蛋白相互作用

用酵母双杂交体系筛选与FMRP相作用蛋白的cDNA被引量：4: 1998年; 目的采用酵母双杂交体系寻找与脆性X智力低下蛋白(Fragile X men-tal retadation protein,FMRP)相互作用的蛋白,探讨FMRP的生物医学功能。方法以编码FMRP_(Pro327-Thr518)肽段的cDNA序列与pBTM116质粒DNA结合结构域重组作为"钓饵",从小鼠胚胎cDNA文库中筛选与之相互作用蛋白的cDNA。结果筛选出13个与FMRP_(Pro327-Thr518)肽段特异性地相互作用的克隆,其中12个为小鼠泛素转运酶9(UBC9),1个是在GenBank中无高同源序列的未知cDNA序列。结论小鼠UBC9与人UBC9的氨基酸序列完全相同,且FMRP与UBC9蛋白表达的时空特征相似,因此认为人UBC9是与FMRP相互作用的蛋白,其相互作用的生物学意义有待进一步研究。本工作表明酵母双杂交体系是研究蛋白质相互作用的有效方法。; 陈雨亭Anne Sittler余珉Barbara Bardoni吴冠芸Jean Louis Mandel沈岩; 关键词：蛋白酵母双杂交体系 CDNA

功能基因组学研究被引量：4: 1997年; 当前人类基因组研究的重心正在由“结构”向“功能”转移。一个以基因组功能研究为主要内容的所谓“后基因组时代”(post-genomics),即功能基因组学(functional genomics)时代即将到来。功能基因组学主要研究基因的识别及其功能信息的提取、鉴定和开发利用,涉及生物信息学、计算机生物学和生物医学研究等领域。其成果将深化对基因组遗传语言,基因结构与功能的关系,生命的起源与进化,细胞发育、生长、分化,以及疾病发生、发展的分子机理等问题的理解。功能基因组学的研究还将促进生命科学与数学、物理、化学、信息科学、计算机科学以及自动化技术等学科的交叉融汇,刺激相关学科技术领域的发展。; 余珉陈雨亭沈岩; 关键词：基因组生物信息功能基因组学; 全文增补中

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陈雨亭