黄笑宇
- 作品数：5 被引量：9H指数：1
- 供职机构：浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室更多>>
- 发文基金：浙江省大学生科技创新活动计划(新苗人才计划)项目浙江省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学轻工技术与工程自动化与计算机技术更多>>
- 基于全基因组的毛竹同义密码子使用偏好性分析
- 密码子使用偏好性是物种在遗传信息传递过程中的一个重要特点,分析物种的密码子使用偏好性对于了解该物种遗传信息的传递规律具有重要意义。应用CodonW软件对毛竹Phyllostachys heterocycla基因组中的26...
- 黄笑宇许在恩郭小勤
- 关键词：毛竹密码子偏好性
- 基于全基因组的毛竹同义密码子使用偏好性分析被引量：9
- 2017年
- 密码子使用偏好性是物种在遗传信息传递过程中的一个重要特点,分析物种的密码子使用偏好性对于了解该物种遗传信息的传递规律具有重要意义。应用Codon W软件对毛竹Phyllostachys edulis基因组中的26 103个蛋白质编码基因序列进行了分析,计算了位于密码子3个位置的G+C含量、有效密码子数、同义密码子的使用频率等,确定了毛竹的最优密码子。结果显示:毛竹密码子第1位和第3位的G+C含量明显高于第2位,表现出对以G或C碱基开头和结尾的密码子发生强烈偏向使用,且确定的26种最优密码子均以G/C碱基结尾。与模式动植物酵母Saccharomys cerevisiae,大肠埃希菌Escherichia coli,果蝇Drosophila melanogaster,拟南芥Arabidopsis thaliana,烟草Nicotiana tabacum,水稻Oryza sativa,玉米Zea mays,小麦Triticum aestivum等8个代表性物种进行比较,结果显示:毛竹密码子偏好性与模式动植物存在不同程度的差异,与大肠埃希菌、酵母、果蝇、拟南芥、烟草和玉米的差异较大,差异分别为8个、11个、6个、7个、6个和6个,而与小麦的差异较小(1个),与水稻完全一致。密码子偏好性差异大小在一定程度上反映物种间的进化关系。
- 黄笑宇许在恩郭小勤
- 关键词：植物学毛竹密码子偏好性
- 温度对雷竹笋细胞壁转化酶活性的影响
- 以雷竹笋作为实验材料，测定不同温度及不同保存时间下细胞壁转化酶的活性、葡萄糖含量以及纤维素的含量，探究不同温度条件下竹笋纤维化与细胞壁转化酶的关系。
- 黄笑宇郭小勤
- 关键词：雷竹笋毛竹笋温度葡萄糖含量
- 温度对雷竹笋细胞壁转化酶活性的影响
- 以雷竹笋作为实验材料,测定不同温度及不同保存时间下细胞壁转化酶的活性、葡萄糖含量以及纤维素的含量,探究不同温度条件下竹笋纤维化与细胞壁转化酶的关系。研究结果发现,温度对细胞壁转化酶活性有显著影响,20℃条件下的细胞壁转化...
- 黄笑宇郭小勤
- 关键词：雷竹笋毛竹笋温度葡萄糖含量
- 基于全基因组的毛竹同义密码子使用偏好性分析
- 密码子使用偏好性是物种在遗传信息传递过程中的一个重要特点,分析物种的密码子使用偏好性对于了解该物种遗传信息的传递规律具有重要意义。应用CodonW 软件对毛竹Phyllostachys heterocycla 基因组中的...
- 黄笑宇许在恩郭小勤
- 关键词：毛竹密码子偏好性
