郭小勤
- 作品数：31 被引量：52H指数：5
- 供职机构：浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室更多>>
- 发文基金：浙江省自然科学基金国家自然科学基金浙江省公益性技术应用研究计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学文化科学医药卫生更多>>
- 倭竹族中14-3-3基因家族的克隆和序列分析
- 14-3-3蛋白是高度保守性的基因家族.本实验采用同源克隆的方法分别从白纹阴阳竹、摆竹、毛竹、鸡毛竹和唐竹5个竹种中克隆得到了GF14b、GF14c、GF14e、GF14f的基因全长.对5个竹种中的4个14-3-3基因序...
- 许在恩俞瑜李兵娟陈虹君郭小勤
- 关键词：基因序列生物信息学
- 文献传递
- 德清县雷竹林经营状况调查被引量：3
- 2015年
- 为了解德清县雷竹（Phyllostachys violascens）林经营状况,对雷竹重点乡镇的雷竹林经营收入情况、经营现状、生长状况、覆盖面积、施肥情况、劳动力状况、竹林结构等进行调查。结果表明,德清县雷竹笋总产值十年内增长2.37倍,达到4.53亿元,农民纯收入增长了1.83倍,达到2.45亿元;雷竹栽培覆盖面积占雷竹林总面积保持在40%左右,从事雷竹林经营的农户中有35%的农户收入占到家庭总收入的80%,雷竹林经营成本中覆盖材料占总成本的70%;覆盖雷竹林年施肥次数为3~4次;雷竹林胸径2.9~4.5 cm,立竹度为20 100~33 750株/hm2。
- 刘振勇杨晓明俞群芬邵丽霞郭小勤林新春
- 关键词：雷竹
- 温度对雷竹笋细胞壁转化酶活性的影响
- 以雷竹笋作为实验材料，测定不同温度及不同保存时间下细胞壁转化酶的活性、葡萄糖含量以及纤维素的含量，探究不同温度条件下竹笋纤维化与细胞壁转化酶的关系。
- 黄笑宇郭小勤
- 关键词：雷竹笋毛竹笋温度葡萄糖含量
- 雷竹中PvFT同源基因的克隆及表达特性分析
- 本论文通过同源克隆方法克隆了雷竹(Phyllostachys violascens)中FT的同源基因,获得了FT同源基因PvFT-2的编码区序列。基因组DNA序列与cDNA序列比对表明,该基因含4个外显子和3个内含子,该...
- 王弋关鹰郭小勤林新春方伟
- 关键词：雷竹成花机理同源基因克隆表达
- 文献传递
- 毛竹IDD基因家族启动子分析被引量：4
- 2016年
- IDD基因家族编码一种混合型的转录因子,多数参与植物的生长发育.真核基因的表达受多种因素的调控,其中启动子在转录水平上的调节作用至关重要.本研究截取毛竹IDD家族8个基因(Ph IDD1-2,Ph IDD4-8和Ph ID1)起始密码子前2 000 bp序列,顺式作用元件分析显示,这些基因启动子中均存在TATA框和CAAT框,除此之外,上游调控区域还存在光响应元件、激素响应元件、逆境胁迫元件以及其他响应元件,其中有些元件是某个基因所特有的,表现出该基因家族各基因独特的表达模式,也表明该家族基因的功能分化,参与植物发育的各个阶段.
- 陈虹君高臻毅郭小勤
- 关键词：毛竹启动子顺式元件
- 基于全基因组的毛竹同义密码子使用偏好性分析被引量：9
- 2017年
- 密码子使用偏好性是物种在遗传信息传递过程中的一个重要特点,分析物种的密码子使用偏好性对于了解该物种遗传信息的传递规律具有重要意义。应用Codon W软件对毛竹Phyllostachys edulis基因组中的26 103个蛋白质编码基因序列进行了分析,计算了位于密码子3个位置的G+C含量、有效密码子数、同义密码子的使用频率等,确定了毛竹的最优密码子。结果显示:毛竹密码子第1位和第3位的G+C含量明显高于第2位,表现出对以G或C碱基开头和结尾的密码子发生强烈偏向使用,且确定的26种最优密码子均以G/C碱基结尾。与模式动植物酵母Saccharomys cerevisiae,大肠埃希菌Escherichia coli,果蝇Drosophila melanogaster,拟南芥Arabidopsis thaliana,烟草Nicotiana tabacum,水稻Oryza sativa,玉米Zea mays,小麦Triticum aestivum等8个代表性物种进行比较,结果显示:毛竹密码子偏好性与模式动植物存在不同程度的差异,与大肠埃希菌、酵母、果蝇、拟南芥、烟草和玉米的差异较大,差异分别为8个、11个、6个、7个、6个和6个,而与小麦的差异较小(1个),与水稻完全一致。密码子偏好性差异大小在一定程度上反映物种间的进化关系。
- 黄笑宇许在恩郭小勤
- 关键词：植物学毛竹密码子偏好性
- 紫竹PPO基因的生物信息学及表达分析
- 2013年
- 以紫竹(Phyllostachys nigra)一年紫嫩叶的cDNA为材料获得一个多酚氧化酶基因(命名为PnPPO1)片段,测序显示,该序列长438 bp,该片段编码有146个氨基酸残基组成的多酚氧化酶保守区,该区域包含CuB结合区,其编码的蛋白属于酪氨酸酶(tyrosinase)。Blastp分析显示,该氨基酸序列与小麦(Triticum aestiv)、水稻(Oryza sativa)中的多酚氧化酶有很高的同源性。该蛋白片段分子量约为36.2 kD,pI为5.03。比对一年紫和台湾紫中该基因的序列发现,两者同源性为84.45%,两者间还存在明显的SNP位点会导致酶切点位发生变化和新酶切位点的产生。RT-PCR分析结果表明,PnPPO1基因在叶芽中表达最高,鞭根中微量表达,其余供试组织中未检测到其表达。
- 关鹰王弋郭小勤林新春方伟
- 关键词：多酚氧化酶单核苷酸多态性
- 孝顺竹中INDETERMINATE1同源基因的克隆及表达分析
- 本文采用同源克隆的方法从孝顺竹(Bambusa multiplex)中克隆到了ID1同源基因，并命名为BmID1。核苷酸序列分析表明：BmID1基因含有4个外显子和3个内含子。氨基酸序列显示：其具有ID-domain基因...
- 关鹰王倩郭小勤方伟
- 关键词：孝顺竹同源基因基因克隆原核表达
- 毛竹IDD基因家族的生物信息学分析
- IDD基因家族编码一种混合型的转录因子,本文通过本地Blast从毛竹(Phyllostachys heterocycla)基因组数据库获取到了9个IDD家族基因,并命名为PhID1和PhIDD1-8,其氨基酸序列均具ID...
- 陈炜郭小勤
- 关键词：毛竹磷酸化位点
- 毛竹IDD基因家族的生物信息学分析被引量：7
- 2014年
- IDD基因家族编码一种混合型的转录因子,本文通过本地Blast从毛竹（Phyllostachys heterocycla）基因组数据库获取到了9个IDD家族基因,并命名为PhID1和PhIDD1-8,其氨基酸序列均具IDDdomain结构特征,一个假定的核定位信号、2个C2H2和2个C2HC。氨基酸理化性质分析发现,PhIDD蛋白均为亲水性蛋白,含量较多是丙氨酸（Ala）、丝氨酸（Ser）和甘氨酸（Gly）,全序列等电点分布在8.8-9.7之间,仅PhIDD2蛋白的等电点为5.6。除PhIDD2外,IDD-domain的等电点与全序列等电点基本一致。PhIDD蛋白二级结构含量分析发现无规则卷曲和α-螺旋含量最多,β-转角和延伸链分布在整个蛋白中。蛋白磷酸化位点预测结果显示磷酸化位点数量在20-29个不等。三维结构分析显示,PhIDD1在63-175氨基酸处,会形成α-螺旋,β-折叠及无规则卷曲及明显的锌原子结合位点。
- 关鹰许在恩郭小勤
- 关键词：毛竹转录因子生物信息学
