石嵘
- 作品数：84 被引量：258H指数：9
- 供职机构：南方医科大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广州市重大科技攻关项目广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- E3泛素连接酶HERC4在乳腺癌中的表达及临床意义被引量：3
- 2014年
- 目的研究HERC4在人乳腺癌组织中的表达,探讨其与乳腺癌临床特征的相关性。方法 RT-qPCR法检测67例乳腺癌组织及配对癌旁乳腺组织标本中HERC4的mRNA表达水平;Western blot和免疫组化法检测67例乳腺癌组织及配对癌旁乳腺组织标本中HERC4的蛋白表达水平。结果 RT-qPCR结果显示HERC4的mRNA的表达水平在乳腺癌组织中较癌旁乳腺组织高(P<0.05)。Western blot结果显示HERC4蛋白在乳腺癌组织中高表达(P<0.05)。免疫组化结果表明HERC4主要在细胞质中表达。乳腺癌组织中HERC4阳性表达率为61.2%,癌旁乳腺组织阳性表达率为19.4%。HERC4的表达与乳腺癌TNM分期和组织学分级密切相关(P<0.05)。结论 HERC4与乳腺癌的发生和发展存在相关关系,并有可能作为乳腺癌早期诊断标志物和治疗靶点。
- 周晖石嵘陈耀武曾文利梁桑华郑文岭马文丽
- 关键词：乳腺癌RT-QPCRWESTERNBLOT泛素
- 制备炭疽芽胞杆菌检测基因芯片的初步研究被引量：1
- 2004年
- 建立制备炭疽芽胞杆菌检测基因芯片的技术 ,并探讨研制检测炭疽芽胞杆菌基因芯片的方法。酶切炭疽芽胞杆菌的毒素质粒和荚膜质粒 ,通过建立质粒DNA文库的方法获取探针 ,并打印在经过氨基化修饰的玻片上 ,制成用于炭疽芽胞杆菌检测的基因芯片。收集了 2 90个阳性克隆探针 ,制备了检测炭疽芽胞杆菌的基因芯片。提取炭疽芽胞杆菌质粒DNA与基因芯片杂交 ,经ScanArrayLite芯片阅读仪扫描得到初步的杂交荧光图像。通过分析探针的杂交信号初步筛选出 2
- 马晓冬马文丽孙朝晖吕梁郑文岭王洪敏石嵘
- 关键词：炭疽芽胞杆菌基因芯片分子探针
- 限制性显示技术作为一种高密度长链寡核苷酸芯片样本标记方法的初步研究(英文)
- 2005年
- 目的初步研究限制性显示技术(RD-PCR)作为一种高密度长链寡核苷酸芯片样本标记方法对芯片杂交信号的影响。方法收集3个健康人外周血单核细胞,提取RNA后分为两组,采用RD-PCR进行样本双色(Cy3/Cy5)荧光标记,与3张Agilent60mer高密度(22K)人1B寡核苷酸芯片进行杂交。排除阴性和阳性对照信号值、Cy3和(或)Cy5的前景与背景间无统计显著性差异点的信号值,进一步排除两种荧光标记间存在统计显著性差异点的信号值,将3张芯片的共同信号值用于分析。SPSS软件进行常规统计分析和作图,R语言环境下的VSN统计包排除芯片间和两种不同荧光标记间的系统误差。结果3张芯片的8744个共同点用于本研究。芯片间及两种荧光标记间存在明显的可校正的系统误差。芯片间杂交信号值相关显著。RD-PCR样本标记方法对较低表达基因信号值较为敏感。结论初步的统计分析结果表明,RD-PCR是一种潜在的有用的高密度长链寡核苷酸芯片样本标记方法。
- 莫小阳马文丽李凌石嵘张宝徐秋林张海燕郑文岭
- 关键词：限制性显示技术
- DNA芯片技术检测乙型肝炎病毒及丁型肝炎病毒的初步研究被引量：11
- 2004年
- 现分别针对乙型肝炎病毒(HBV)、丁型肝炎病毒(HDV)基因保守区域设计多对聚合酶链反应(PCR)引物,打印制备成芯片,并用限制性显示(RD)技术标记样品,探索此方法制备基因芯片的可行性.
- 孙朝晖郑文岭张宝石嵘马文丽
- 关键词：丁型肝炎病毒乙型肝炎病毒DNA芯片技术HBV基因芯片
- As_2O_3处理前后K562细胞基因表达变化的基因芯片检测被引量：5
- 2002年
- 目的应用基因芯片研究三氧化二砷（As2O3）处理前后K562细胞基因表达的变化。方法提取As2O3处理前后K562细胞的总RNA,纯化为mRNA后再反转录为cDNA。cDNA经限制性内切酶Sau3AI切割后,cDNA片段分别用Cy3和Cy5标记,与自制的包含348个基因片段的胎盘库芯片杂交。结果杂交结果经扫描和软件分析,发现了11个差异表达的基因片段,其中有3个基因片段与细胞凋亡密切相关。结论 我们构建的胎盘库基因芯片可以成功地用于研究药物作用前后基因表达的变化。
- 冯春琼马文丽李凌宋艳斌石嵘吴清华郭秋野祝骥郑文岭
- 关键词：基因表达基因芯片基因芯片三氧化二砷K562细胞凋亡
- 应用PCR快速制备乙型、丁型肝炎病毒诊断基因芯片探针被引量：12
- 2003年
- 目的应用PCR技术扩增乙型、丁型肝炎病毒保守区域基因片段,并进行克隆、测序分析,制备联合诊断乙型、丁型肝炎病毒基因芯片探针。方法利用Oligo6.4软件分别针对乙型、丁型肝炎病毒基因保守区域设计PCR引物,纯化PCR扩增产物,扩增后的产物克隆至pMD18-T载体并进行快速鉴定,提取阳性克隆质粒进行测序分析及鉴定。结果获得多个乙型、丁型肝炎特异性基因片段。序列分析表明,所扩增的片段均属于乙型、丁型肝炎病毒特异基因。结论利用PCR扩增产物制备基因芯片探针是一种快速、简便的实用方法。
- 孙朝晖郑文岭毛向明张宝吕梁马晓冬石嵘马文丽
- 关键词：丁型肝炎病毒基因芯片分子探针技术聚合酶链反应
- RNAi干扰对K562细胞表达谱的影响被引量：1
- 2007年
- 目的联合运用RNAi技术和cDNA表达谱芯片研究干扰c-myc对K562细胞表达谱的影响。方法经过RT-PCR和流式细胞仪检测,筛选出干扰效果最好的siRNAs,经LipofectamineTM2000脂质体法转染K562细胞,提取总RNA,逆转录为cDNA,荧光标记后与K562表达谱芯片杂交。结果经扫描、分析杂交结果,有455个基因表达下调,有12个基因表达上调。结论基因芯片和RNAi是分析基因功能的有力工具,也是发现新的肿瘤治疗靶标的有效方法。
- 岳枫马文丽宋艳斌石嵘张宝郑文岭
- 关键词：RNA干扰K562基因
- 浸润性膀胱癌差异基因的互作网络分析及验证研究被引量：3
- 2010年
- 目的采用蛋白互作网络分析研究表达谱基因芯片数据,构建浸润性膀胱癌基因互作网络图并对筛选出的网络中心节点进行实验验证。方法将表达谱芯片筛选到的浸润性膀胱癌152个共同差异表达基因,导入STRING在线数据库进行分析,绘制差异基因互作网络图,并将互作网络数据导出到Cytoscape2.6.2软件中,筛选出网络中心节点。采用KEGG数据库等进行信号通路分类及基因功能研究,进而采用实时定量RT-PCR对其基因表达进行验证,筛选出基因表达在膀胱癌组与正常膀胱粘膜组差异最大的基因,并对浸润性膀胱癌发生的分子机制进行初步探讨。结果共有103个膀胱癌共同差异表达基因编码的蛋白经STRING筛选存在相互作用,并构成一个复杂的互作网络图;Cytoscape共筛选出26个网络中心节点,广泛参与肿瘤发生的多条信号通路;实时定量RT-PCR结果表明UBE2C、VEGF、TGFBR2、CAV1四个基因表达量在膀胱癌组与正常膀胱粘膜组的差异最大,分别为9.45、4.17、0.13、0.18倍(以GAPHD作为内参,计算2-△△Ct),与芯片检测结果的趋势一致。结论本研究构建出的浸润性膀胱癌差异基因互作网络图,尤其是其中的网络中心节点基因,对于浸润性膀胱癌发生分子机制的研究、早期诊断及分子靶向治疗研究具有较好的提示作用。
- 石嵘赵镇高洋吴清华宋艳斌姜立郑文岭马文丽
- 关键词：膀胱癌中心节点
- B型链球菌数量感应通路测定及LuxS缺失突变株的构建被引量：1
- 2005年
- 目的对GBS中可能存在的AI-2数量感应通路进行测定,构建数量感应相关分子LuxS缺失突变株并对其基因型进行确认。方法培养GBS至不同D(λ)值,利用V.harveyiBB170作为报告菌株,对GBS诱导生物发光的能力进行测定,然后寻找GBS中LuxS同源基因,通过同源重组法在GBS中构建LuxS缺失突变株,Southern杂交分析确证。结果GBS中的某种分泌成份可在报告菌株中诱导生物发光活性,提示GBS中存在AI-2数量感应通路,在GBS中发现了LuxS同源基因并成功地构建了LuxS缺失突变株。结论本研究为探索LuxS在GBS中AI-2数量感应通路中的重要性及GBS毒力研究建立了细菌模型。
- 欧阳谦马文丽刘翠华石嵘郑文岭
- K562细胞消减cDNA文库的构建及初步鉴定
- 2005年
- 背景与目的:消减杂交技术是一种寻找和克隆差异基因的方法。本研究目的是通过快速、高质量构建消减cDNA文库,筛选K562细胞中差异表达基因。方法:以用限制性显示(restriction display,RD)技术制备的K562细胞cDNA片段作为消减对象,以正常人淋巴细胞的Sau3AⅠ酶解cDNA片段对其进行消减。经过消减后的RD片段被分组扩增出来,并克隆于T载体中,挑选阳性克隆进行测序并进行初步分析。结果:构建的K562细胞消减cDNA文库,包含360个阳性克隆,插入片断大小范围在200～800bp之间,选取50个克隆进行测序分析,结果为来源于42个已知基因。结论:利用自行建立的消减杂交法,成功构建了特异性K562细胞消减cDNA文库,文库质量可靠,可用于进一步筛选及克隆K562细胞中差异表达基因。
- 宋艳斌马文丽冯春琼石嵘毛向明张宝郑文岭
- 关键词：K562细胞消减杂交CDNA文库
