石秋艳
- 作品数:3 被引量:8H指数:1
- 供职机构:广西师范大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术生物学更多>>
- 基于线段提取的数学表达式粗分割
- 2004年
- 在数学表达式识别的符号分割过程中,根号和分数线都存在一条可变长度的近似水平方向的线段,已有的符号分割算法很难处理包含根号或分数线的表达式。本文提出了一种对根号和分数线进行处理的有效算法。本文利用Hough变换提取表达式图像中的近似水平方向的线段,并确定它们在表达式中的位置,用有效特征来区分该线段属于根号还是属于分数线。实验结果表明了本文算法是有效的。将本文粗分割的结果再用目前常见的分割算法可得到数学表达式的最终的精确分割结果。因此,本文算法可以作为识别数学表达式的预处理过程。
- 陈洪波王强石秋艳徐晓蓉
- 关键词:数学表达式线段HOUGH变换
- 基于蛋白质网络功能模块的蛋白质功能预测被引量:8
- 2006年
- 在破译了基因序列的后基因组时代,随着系统生物学实验的快速发展,产生了大量的蛋白质相互作用数据,利用这些数据寻找功能模块及预测蛋白质功能在功能基因组研究中具有重要意义.打破了传统的基于蛋白质间相似度的聚类模式,直接从蛋白质功能团的角度出发,考虑功能团间的一阶和二阶相互作用,提出了模块化聚类方法(MCM),对实验数据进行聚类分析,来预测模块内未知蛋白质的功能.通过超几何分布P值法和增、删、改相互作用的方法对聚类结果进行预测能力分析和稳定性分析.结果表明,模块化聚类方法具有较高的预测准确度和覆盖率,有很好的容错性和稳定性.此外,模块化聚类分析得到了一些具有高预测准确度的未知蛋白质的预测结果,将会对生物实验有指导意义,其算法对其他具有相似结构的网络也具有普遍意义.
- 卢宏超石秋艳石宝晨张治华赵屹唐素勤熊磊王强陈润生
- 关键词:蛋白质相互作用网络蛋白质功能预测聚类
- 蛋白网络聚类研究及其可视化软件开发
- 本文对网络中的聚类算法进行了研究,提出了一种能满足蛋白相互作用网络“块内紧密,块间稀疏”的模块化特点且简单易行的新的基于蛋白功能团的拓扑层次聚类方法――MCM算法。该算法打破了传统的基于蛋白间相似度的聚类模式,直接从蛋白...
- 石秋艳
- 关键词:计算机网络信息聚类聚类算法
- 文献传递