李永东
- 作品数:62 被引量:191H指数:7
- 供职机构:宁波市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金安徽省自然科学基金宁波市自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学轻工技术与工程生物学更多>>
- 2008--2009年宁波地区肠道病毒71型的分离及VP1基因分析被引量:2
- 2010年
- 肠道病毒71型(EV71)病毒是引起儿童手足口病的重要病原之一。本研究通过MRC-5(人胚肺成纤维细胞)对2008—2009年宁波地区288份手足口病例标本进行病毒分离,分离鉴定后得到6株EV71病毒,分别命名为1/CHNNB/0872/CHNNB/08776/CHNNB/09787/CHNNB/09、103/CHNNB/09和107/CHNNB/09。
- 李永东倪红霞高红谢蕾许国章
- 关键词:肠道病毒71型病毒分离基因分析VP1人胚肺成纤维细胞EV71病毒
- 宁波市狂犬病病毒NB0901株核蛋白基因的序列分析
- 2011年
- 目的通过RT-PCR方法对2009年宁波市狂犬病病毒分离株(NB0901)的N基因扩增并测序,了解宁波地区狂犬病病毒的流行特点。方法运用RT-PCR方法和序列测定方法获得NB0901株的N基因序列,并在核苷酸和氨基酸水平与疫苗株(3aG和CNT-1)进行同源性比较,同时进行遗传进化分析。结果狂犬病病毒NB0901株与疫苗株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别在86.6%~90.1%和95.5%~98.8%之间。NB0901株N蛋白的抗原表位与疫苗株相比后发现在NⅠ和NⅡ抗原表位存在突变。而在Th细胞表位上,NB0901株与CNT-1株完全一致,与3aG株相比变异较大。进化结果表明NB0901株属于狂犬病病毒Ⅰ群中的A亚型。结论狂犬病病毒NB0901株和当前疫苗株虽同属于Ⅰ群,但是与疫苗株相比存在差异,从氨基酸序列水平上分析,CNT-1株较3aG株更能有效保护流行毒株感染。
- 易波倪红霞方挺李永东
- 关键词:狂犬病病毒核蛋白
- 分子伴侣辅助表达寨卡病毒E蛋白的重组多形汉逊酵母及其构建方法
- 本发明提供了一种分子伴侣辅助表达寨卡病毒E蛋白的重组多形汉逊酵母及其构建方法。首先构建重组寨卡病毒结构蛋白E与分子伴侣多形汉逊酵母钙连结蛋白的共表达载体,其中,重组寨卡病毒结构蛋白E序列如SEQ.ID.NO.1所示,多形...
- 李永东钱卫东刘昱慧焦素黎倪红霞
- 文献传递
- 多形汉逊酵母重组菌株及其在甘油生物合成中的应用
- 本发明提供一种多形汉逊酵母重组菌株及其在甘油生物合成中的应用,主要是运用低能离子注入技术介导酵母基因组总DNA转化酵母菌的方法构建能够耐高盐的甘油高产重组菌株。本发明提供的重组菌株通过底物分批补料进行生物转化生产甘油,其...
- 李永东钱卫东倪红霞刘昱慧
- 文献传递
- 基于全基因组De novo测序的异常汉逊酵母菌株792基因组重复序列的分布特征研究
- 2018年
- 重复序列是基因组的重要组成部分,对生物的进化、遗传和基因的表达调控有重要作用.本研究利用生物信息学方法,在异常汉逊酵母菌株792全基因组de novo测序的基础上,对基因组重复序列的分布特征进行了研究.结果表明,其全基因组中重复序列总长346 417bp,其中,串联重复序列238 164bp,散在重复序列108 253bp,占基因组长度的2.52%,平均每4.05Kb就有一个重复序列.微卫星DNA序列中重复单元拷贝数大多低于15次,其优势碱基类型为三核苷酸重复,重复单元基序为AAC的微卫星序列数目最多;小卫星DNA序列重复单元拷贝数小于微卫星DNA,主要分布1~3次,重复单元大于15bp的小卫星序列数目随着重复单位长度的增加呈下降趋势.散在重复序列中长末端重复序列(LTR)数目最多,滚环(RC)平均长度最长.本研究结果为汉逊酵母菌的分子定向育种和SSR分子标记的开发提供理论基础.
- 王婷张寒玉蔡长龙唐朝毛培宏钱卫东李永东
- 关键词:基因组微卫星DNA
- 宁波地区肠道病毒71型VP1基因特征分析被引量:1
- 2011年
- 目的了解宁波地区肠道病毒71型(enterovirus71,EV71)流行株VPI基因特征。方法采集手足口病患者的样本进行病毒分离和鉴定,用逆转录-聚合酶链反应对EV71流行株VPl进行扩增和测序。对流行株VPI进行进化分析,并将流行株VPl与各基因型代表株进行序列比对。同时测定EV71流行株的半数组织培养感染量(median tissue culture infectivedose,TCID30)。结果2008-2009年,宁波地区分离出23株病毒,其中6株为EV71。EV71流行株VPl进化分析显示,6株EV7l流行株与c4亚型代表株聚于同一分支,流行株VPI的核苷酸和氨基酸序列与c4亚型代表株的同源性最高,分别为92.0%~93.1%和98.9%~99.3%。6株EV71流行株的滴度为10^1.16~10^3.33TCID50/ml。结论2008-2009年宁波地区EV71流行株属于c4亚型。
- 李永东董红军许国章
- 关键词:肠道病毒属基因型
- 宁波发热伴血小板减少综合征流行病学监测结果分析被引量:5
- 2015年
- 目的了解宁波市发热伴血小板减少综合征(新布尼亚)流行状况。方法在宁波市2家县级医院和2家乡镇卫生院建立监测哨点,采用卫生部统一的诊断标准和个案调查表对发热伴血小板减少综合征病例进行调查,对监测区患者血清进行病毒分离培养和M基因序列测定分析。结果报告11例发热伴血小板减少综合征,死亡1例。156只蜱均未检测出携带新布尼亚病毒(SFTSV),检测健康人群血清265份,SFTSV抗体阳性率为6.14%;人群抗体阳性水平随着年龄的增加而增高(P<0.01)。5株宁波分离株与日本、舟山分离株亲缘关系较近,其核苷酸和氨基酸序列变异很小,序列相似性在96%以上。结论宁波市是发热伴血小板减少综合征(布尼亚病)的流行地区,应加强发热伴血小板减少综合征症状监测。
- 易波高丽孔志芳陈奕李永东
- 关键词:发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒流行病学
- 羊口疮024基因的表达、多抗制备及亚细胞定位被引量:2
- 2018年
- 目的克隆表达羊口疮病毒(Orf virus,ORFV)024基因,制备多克隆抗体,检测其免疫原性,并对其进行亚细胞定位分析。方法根据GenBank中羊口疮病毒024基因序列设计引物,进行PCR扩增。将其亚克隆至表达载体,构建原核重组质粒pGEX-6P-1-024以及真核重组质粒pEGFP-N1-024。将原核重组质粒转化Rosetta (DE3)细胞,IPTG诱导表达,SDS-PAGE鉴定024蛋白的表达情况。纯化后的024蛋白免疫BALB/c雌鼠,获得血清并制备多克隆抗体,进行Western-blot分析。将构建的真核质粒转染MDBK细胞,24h后通过免疫荧光观察其在细胞中的表达及亚细胞定位。结果 SDS-PAGE结果表明,羊口疮病毒024基因在Rosetta (DE3)细胞中正确表达,大小为59kDa。Western-blot结果表明024蛋白能与制备的多抗发生特异性反应,具有良好的反应原性。荧光显微镜下结果表明024蛋白转染MDBK细胞后主要在细胞质中表达。结论本实验为后续深入研究ORFV 024基因功能和致病机制奠定了基础。
- 苏莉俞赵荣杨侃侃王元红钟灵毓崔佣楸张高峰张谦王勇李永东
- 关键词:羊口疮病毒多克隆抗体亚细胞定位
- 羊口疮病毒安徽株VIR基因克隆与生物信息学分析被引量:3
- 2018年
- 目的获取并分析ORFV AH-F10株VIR基因序列及预测其编码蛋白的生物信息学特点。方法利用实验室保存的羊口疮AH-F10株,设计VIR基因引物并进行PCR扩增、克隆及序列测定,同时利用生物信息学方法对其编码的蛋白的理化性质、二级结构、三级结构、信号肽、磷酸化位点、跨膜结构域以及线性细胞表位进行预测。结果 AH-F10-VIR基因长552 bp,编码183个氨基酸,与Nantou株的VIR基因同源性最高,核苷酸同源性高达99.6%,氨基酸同源性为100.0%。生物信息学分析结果显示编码的蛋白相对分子量为19.88 kDa,等电点为4.83,为亲水性蛋白;α-螺旋、β-转角、无规则卷曲和延伸链分别占36.07%、3.83%、43.17%和16.94%;三级结构预测显示VIR蛋白存在较多的α-螺旋与无规则卷曲,同二级结构预测结果相符;含有17个磷酸化位点,无信号肽和跨膜结构区域,有15个潜在的B细胞优势表位,4个CTL细胞表位以及5个Th细胞表位。结论成功克隆了羊口疮安徽株VIR基因并预测了VIR蛋白的生物信息学相关信息,为进一步研究VIR蛋白奠定了基础。
- 杨侃侃俞赵荣张谦张高峰王元红张学琪鲁智敏刘自敏彭开松王勇李永东
- 关键词:羊口疮病毒克隆生物信息学分析
- 宁波市奉化区女陛宫颈人乳头瘤病毒18型感染流行变异谱系分析被引量:1
- 2018年
- 目的了解宁波市奉化地区妇女感染HPV高危亚型18相关基因E6、E7区基因变异谱系特征。方法采用整群随机抽样方法,收集宁波市奉化区778例妇女的宫颈脱落细胞样本进行HPV分型检测,并对其中HPV18阳性株进行癌相关基因E6、E7区测序和序列分析。结果HPV18检出率为1.3%(10/778),HPV18病毒株E6、E7基因序列分别成功获得11和10条,E6区有1个位点发生碱基颠换(C287G),E7区未发现突变;系统进化树分析显示,奉化地区HPV18变异株主要位于该亚型基因变异谱系A的A1亚系。结论宁波市奉化地区妇女HPV18感染率较低,HPV18病毒株癌相关基因变异较小。
- 张姝许国章倪红霞李永东
- 关键词:人乳头瘤病毒18E6E7