郭丽茹 作品数:33 被引量:162 H指数:8 供职机构: 天津市疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 中国博士后科学基金 天津市自然科学基金 国家科技重大专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
天津市520例儿童流感样病例病原谱以及流行病学特征分析 被引量:3 2022年 目的了解2020年10月—2021年3月天津市儿童医院流感样病例的流行病学特征以及病原谱特征,为儿童流感样病例的防控以及临床诊治提供依据。方法采集哨点医院520例流感样病例患者的咽拭子标本,通过实时荧光定量PCR法对样本进行30种呼吸道病原体核酸检测,用描述性流行病学方法对病例和病原学结果进行统计学分析。结果520例样本中,共检出16种呼吸道病原体,阳性样本239份,病原体检出率为45.96%。检出率前3位的病原体依次为呼吸道合胞病毒(9.62%,50/520)、鼻病毒(9.62%,50/520)、巨细胞病毒(5.96%,31/520)。不同性别间的病原体检出率差异有统计学意义(χ2=3.919,P<0.05),男性中病原体检出率为49.67%(149/300),女性中病原体检出率为40.91%(90/220)。不同年龄组病原体检出率差异有统计学意义(χ2=6.182,P<0.05),<2岁组最高(52.91%,91/172),>4岁组最低(38.10%,40/105)。不同月份病原体检出率差异有统计学意义(χ2=15.358,P<0.05),12月(58.00%,58/100)、11月(52.50%,42/80)、1月(47.50%,38/80)检出率居于前3位。在阳性样本中,52例样本为混合感染,混合感染率为21.76%(52/239),其中鼻病毒合并其他病原体感染检出率最高(48.08%,25/52)。结论2020年10月—2021年3月天津市儿童医院流感样病例的主要病原体为呼吸道合胞病毒、鼻病毒、巨细胞病毒,混合感染率较高,易感人群为2岁以下儿童,不同月份病原体检出率不同。应加强对上述主要病原的监测及研究,为儿童呼吸道疾病的防控提供科学参考。 刘晓曼 郭丽茹 孔梅 邹明 刘小畅 李晓燕关键词:呼吸道病原体 儿童 病原谱 2010年-2013年天津市流感病原学监测分析 被引量:38 2013年 目的分析天津市近3年流感活动情况及流行株构成特点,为流感防控提供参考。方法采集哨点医院流感样病例的咽拭子标本,流感病毒核酸检测阳性标本接种MDCK细胞进行病毒分离,以红细胞凝集及凝集抑制试验对分离的病毒进行鉴定和分型。结果共采集标本1867份,分离出流感毒株436株,新甲型H1N1、A(H3N2)和B型毒株均有发现。2011年-2012年以B型为流行优势株,其它两个监测周期的主要流行株则为A型,表现为A(H3N2)亚型及新甲型H1N1亚型毒株交替流行的特点。结论天津地区2010年4月-2013年3月流感流行表现为A(H3N2)、新甲型H1N1、B型流感病毒依次先后交替流行的特点。 郭丽茹 孔梅 李晓燕 邹明 董晓春 徐文体关键词:流感病毒 病原学 天津地区2009年流感病原学监测分析 被引量:4 2010年 目的:观察2009年天津市流感流行趋势、流感样病例群体暴发和甲型H1N1重症病例病原学监测情况。方法:对2009年国家级流感样病例监测哨点医院采集的流感样病例(ILI)咽拭子标本,采用病毒分离鉴定和real-time PCR检测。对疑似甲型H1N1流感病毒感染的重症病例、集中暴发病例及散发病例的呼吸道标本进行real-time PCR检测。同时对2009年5月-7月的ILI散发病例进行RT-PCR和Real-time PCR法检测,比较两种方法检测结果。对2009年9月份国家哨点医院采集标本进行核酸检测和病毒分离两种方法进行。结果:2009年共采集国家级哨点医院流感样病例标本3264份,970份流感病毒阳性,总检出率为29.7%,其中甲型H1N1亚型占55.9%(542/970株),季节性H3占26.5%(257/970株),季节性H3占26.5%(257/970株),季节性H1占7.9%(77/970),B型占0.9%(9/970株)。10月甲型H1N1明显上升,11月达高峰(91.1%),15~岁年龄段阳性率最高(72.7%)。650份疑似甲型H1N1流感重症病例中,196例(30.2%)为阳性,25~岁年龄组阳性数最高(106例),男女比例相似。321份暴发疫情标本中,190份为流感病毒阳性(59.2%)。其中甲型H1N1占44.5%(143/190),季节性H3占12.8%(41/190),B型占1.9%(6/190),未检出季节性H1。4、5月以B型为主,9~12月以甲型H1N1为主。主要为5~25岁学生。对129例散发ILI病例同时进行RT-PCR和Real-time PCR法检测,结果完全一致,均为18例流感病毒阳性。对9月份采集的474份标本进行核酸检测和病毒分离,178份核酸检测阳性,其中107例分离出毒株。结论:2009年天津地区同时存在甲型H1N1、季节性H1、H3和B型流感病毒,甲型H1N1流感病毒为优势流行型。重症病例中30.2%是由甲型H1N1流感病毒引起。暴发疫情以甲型H1N1流感病毒为主。RT-PCR和Real-time PCR法均可用于检测流感病毒。ILI核酸检测阳性率高于病毒分离阳性率。 苏旭 孔梅 陈锦英 李晓燕 邹明 郭丽茹 丁建清 董晓春关键词:甲型H1N1流感病毒 病原学 REAL-TIME PCR 致肾盂肾炎大肠杆菌132的比较蛋白质组学研究 2008年 目的研究致肾盂。肾炎大肠杆菌(UPEC)132与UPEC J96及非致病性大肠杆菌K-12MG1655的蛋白质组表达差异。方法采用双向凝胶电泳技术(2-DE)比较UPEC 132、UPEC J96与非致病性大肠杆菌K-12MG1655的菌体蛋白表达图谱差异,差异蛋白用胰蛋白酶进行胶内酶切,肽混合物使用基质辅助激光解吸-电离飞行时间质谱仪(MALDI—TOF—MS)进行质谱分析,将肽质量指纹谱数据输入互联网上的蛋白质数据库进行检索。结果UPEC132识别蛋白点数(466±11)明显高于Ecoli K-12 MG1655(338±15),也高于UPEC J96(382±12);3菌株共有的蛋白点为298个,2株UPEC共有的蛋白点为56个,UPEC 132特有的蛋白点为89个。MALDI—TOF—MS分析获得UPEC132特异的及显著上调表达的蛋白点22个,涉及毒力因子、物质代谢转运、蛋白合成调节、生物氧化及未知功能的多种蛋白质。结论UPEC菌株与非致病性大肠杆菌间的蛋白质组存在差异,UPEC 132与J96蛋白质组间也有显著不同,为其致病机制的深入研究提供线索。 郭丽茹 陈锦英 杨东靖 董杰关键词:致肾盂肾炎大肠杆菌 比较蛋白质组学 生物氧化 2012—2017年天津市百日咳鲍特菌株抗原基因特征分析 被引量:1 2018年 目的对天津市2012—2017年百日咳临床分离株的主要抗原基因片段进行序列分析,比较与疫苗株的差异。方法采集天津2012—2017年百日咳临床诊疗患者鼻咽拭子进行百日咳鲍特菌培养,对所得菌株进行ptxS1、prn、fim2、fim3及fha B抗原基因的PCR扩增,与疫苗株CS株进行基因序列比对分析,应用MEGA7分析软件构建系统进化树。结果127份鼻咽拭子分离到19株百日咳鲍特菌,与疫苗株相比,ptxS1基因核苷酸同源性为99.6%,临床株全部为ptxS1A基因型,而疫苗株为ptxS1B型;prn基因同源性为99.7~100%,其中18株与疫苗株同为prn1基因型,1株为prn2基因型;fim2、fim3、fha B分离株与疫苗株的同源性均为100%,为fim2-1/fim3A/fha B1基因型。结论本次研究获取的天津市百日咳鲍特菌临床分离株ptxS1和prn基因与疫苗株相比存在差异,为新的疫苗研发及百日咳防治策略的改善提供依据。 郭丽茹 苏旭 黄海涛 刘勇 张维关键词:百日咳鲍特菌 疫苗株 天津地区儿童人博卡病毒感染及基因型分析 被引量:8 2011年 目的了解天津地区急性下呼吸道感染儿童中人博卡病毒(HBoV)的感染情况及病毒基因特性。方法采集2008年9月-2009年5月急性下呼吸道感染住院儿童的鼻咽吸取物标本202份,进行PCR扩增来检测HBoVNP-1基因,对VP1及VP2基因进行扩增及序列测定,与GenBank中登录的序列进行比较,分析序列特征并绘制种系发生树,同时采用多重PCR方法检测其他12种呼吸道病毒及WU多瘤病毒。结果 202份标本中,6.9%(14/202)为HBoV阳性,所有阳性患儿的年龄均≤6岁,6月~12月龄患儿感染率最高,为14.3%(6/42);所有感染者均为肺炎和喘息性支气管炎患儿,各月份均有检出;HBoV与其他病毒的混合感染率为85.7%(12/14),其中58.3%(7/12)为3种以上呼吸道病毒混合感染;VP1/VP2基因种系发生树分析表明13株HBoV均属于Ib簇,同源性分析表明,天津地区HBoV VP1基因与从GenBank下载的I型序列比较,核酸及氨基酸的同源性分别为99.0%~99.8%及99.0%~99.9%。结论天津地区存在HBoV流行,感染者多为<6岁儿童,HBoV与其他呼吸道病毒混合感染常见,HBoV病毒均属于Ib簇。 李晓燕 陈锦英 孔梅 苏旭 邹明 郭丽茹 张桦关键词:呼吸道感染 人博卡病毒 儿童 种系发生 一起天津市集体单位内新型冠状病毒肺炎聚集性疫情流行病学调查 被引量:13 2020年 目的对天津市一起新型冠状病毒肺炎(COVID-19)聚集性疫情进行详细调查和分析,旨在为COVID-19的流行病学特征提供更多证据,并对前期基于有限证据和经验实施的防控措施进行评估。方法采用描述性研究方法对一起发生在集体单位内的聚集性病例进行三间分布及其他流行病学特征描述。结果自第一例指示病例于1月15日发病后,该单位相继发现10例确诊病例,且疫情从单位传播到4个家庭内,致7人发病。17例病例年龄中位数为55(19~79)岁;其中10例职工病例全部为男性,7例家庭聚集病例中男性3例,女性4例。职工病例中,8例办公地点在CW车间,2例在行政办公楼。病例的暴露-发病间隔中位数为4 d,其中职工病例暴露-发病间隔中位数为4.5 d,家庭聚集病例为4 d。初期发病未实施隔离措施的病例发病-就诊间隔中位数为4 d,发病期间开始居家隔离的病例发病-就诊间隔中位数为2.5 d,发病前开始居家隔离的病例发病-就诊间隔中位数为0.5 d。结论COVID-19传播过程中存在单位和家庭聚集性,在疫情发生初期,准确、迅速的采取封控措施完全可以阻止COVID-19聚集性疫情的大范围扩散。 张颖 苏旭 陈伟 费春楠 郭丽茹 吴小丽 周宁 郭玉婷 董晓春 赵莹 王浩武 潘雍 左丽娟关键词:聚集性疫情 流行病学调查 天津市新型冠状病毒肺炎确诊病例病原学检测结果及影响因素分析 被引量:5 2020年 目的研究天津市新型冠状病毒肺炎确诊病例实验室检测结果特征及影响因素。方法按照标准操作流程完成患者样本采集,使用天隆自动磁珠核酸提取试剂完成核酸提取,使用4种已获得审批的新型冠状病毒核酸检测试剂盒进行实时荧光RT-PCR核酸检测,收集患者相关流行病学资料,使用SPSS25.0软件完成单因素方差分析和非参数检验进行组间差异性分析。结果共完成123例新型冠状病毒肺炎确诊病例的核酸检测,PCR检测次数共162次,11次单靶标阳性结果中有10次为核衣壳蛋白基因(nucleocapsid protein gene,N gene)单靶标阳性;同时使用2种试剂盒对19例确诊病例进行检测,结果显示不同试剂盒检测效果存在差异;采集多种样本类型对13例患者进行检测,痰样本Ct值普遍低于咽拭子样本。不同临床症状分型患者咽拭子Ct值之间差异无统计学意义(PCt-N=0.797;PCt-ORF1a/b=0.551)。根据发病日期与首次检测病毒核酸阳性日期之间的间隔时间分组,不同分组咽拭子Ct值之间差异无统计学意义(PCt-N=0.373;PCt-ORF1a/b=0.058)。结论痰液样本相比上呼吸道样本病毒核酸检测更易检出。N基因检测灵敏度更高,N基因单靶标阳性结果应重新采样检测。应根据实际需求选择合适的检测试剂盒,多时间点、多样本类型、多部位采集样本开展检测。 李晓燕 高鑫 郭丽茹 吕莉琨 雷玥 董晓春 孔梅 邹明 李闻 苏旭关键词:新型冠状病毒 RT-PCR 人偏肺病毒多表位抗原及其应用 本发明涉及人偏肺病毒多表位抗原及其应用,所述人偏肺病毒多表位抗原由B细胞表位、Th细胞表位、CTL细胞表位序列组合而成,通过串联方式,并用连接子将上述各类型表位序列连接在一起。本发明还提供所述人偏肺病毒B细胞表位、CTL... 李晓燕 孔梅 郭丽茹 苏旭 杨东靖 邹明文献传递 新型H1N1流感病毒HA基因特性分析 被引量:3 2010年 目的:了解新甲型H1N1流感病毒HA基因特性。方法:设计3对引物,对9株天津地区新甲型H1N1流感病毒阳性的咽拭子标本核酸进行RT-PCR扩增,后对产物测序,将测序结果通过软件进行拼接,得到HA基因全长,分析序列特征并绘制种系发生树。结果:9株新甲型H1N1流感病毒HA基因片段测序成功,经序列拼接后,长度为1778 bp,截取开放读码框内1702 bp核苷酸,绘制了种系发生树。新甲型H1N1流感病毒HA基因与经典的猪流感病毒亲缘关系最近,聚在一个分支上。天津地区新甲型H1N1流感病毒HA蛋白氨基酸与WHO推荐的疫苗株A/California/07/2009(H1N1)及中国的代表株A/Sichuan/1/2009(H1N1)相比,同源性很高,为98.8%~99.6%。氨基酸序列与WHO推荐的疫苗株A/California/07/2009(H1N1)相比,有4个位点发生变异,与中国的代表株A/Sichuan/1/2009(H1N1)相比,有3个位点不同。结论:新甲型H1N1流感病毒HA基因源于经典猪流感病毒,目前的新甲型H1N1流感病毒的HA蛋白变异还很小,但应密切关注该病毒的变异情况。 李晓燕 孔梅 陈锦英 苏旭 丁建清 邹明 郭丽茹