谭敏佳
- 作品数：4 被引量：10H指数：1
- 供职机构：中国科学院上海药物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生理学更多>>
- 组蛋白翻译后修饰无标定量方法可靠性的比较
- 2016年
- 组蛋白翻译后修饰是一种表观遗传学修饰,参与调控细胞的新陈代谢等重要生理过程。蛋白质组学发展迅速,使监控组蛋白翻译后修饰的动态变化成为可能。目前主要有3种无标定量方法(谱图计数法、峰面积积分法和信号强度法),但何种定量方法更可靠尚未见系统性的详细报道。在稳定同位素标记细胞培养技术(SILAC)基础上,对去乙酰化酶抑制剂(SAHA)调控细胞乙酰化修饰水平的定量数据进行对比,比较3种无标定量方法对组蛋白翻译后修饰进行的定量分析,利用定量结果的标准差(SD)评估定量的可靠性,最终发现基于峰面积积分法定量的结果可靠性最高。该研究对难以进行同位素标记实验的样本分析,尤其对临床样本、大样本的组蛋白修饰谱分析具有重要参考意义。
- 刘志伟朱明睿翟琳辉谭敏佳
- 关键词：可靠性
- 去泛素化酶USP14的功能及其抑制剂的研究进展被引量：1
- 2016年
- 去泛素化酶USP14(ubiquitin-specific proteases 14)属于去泛素化酶(deubiquitinating enzymes,DUBs)中的泛素特异性蛋白酶家族(ubiquitin-specific proteases,USPs),其可以切除底物的泛素链,并发挥相应的生物学效应。USP14在信号通路转导、病毒感染的调节、神经系统功能以及肿瘤发生发展进程中均起着重要作用。因其在肿瘤发展中的重要作用以及作为药靶的可行性,当前已经有很多研究将USP14的抑制剂作为抗肿瘤药物研究的新方向。主要综述了USP14在信号通路、病毒感染、神经系统、肿瘤发展中的作用以及其抑制剂的研究进展。
- 姜尚文刘彬谭敏佳
- 关键词：信号通路神经系统肿瘤抑制剂
- 赖氨酸C端内切酶/胰蛋白酶顺序酶切在蛋白质组学样本制备中的评估被引量：8
- 2017年
- 采用胰蛋白酶(Trypsin)单独酶切与不同酶量的赖氨酸C端内切酶(Lys-C/trypsin)顺序酶切两种方法,对293T细胞全蛋白样本进行酶解消化,系统评估Lys-C/trypsin顺序酶切与Trypsin单一酶切在蛋白质组学样本制备中的差别。实验结果表明,Lys-C/trypsin顺序酶切不仅能显著提高肽段和蛋白质的鉴定数目,同时降低遗漏K酶切位点的数目及比例,而且得到的肽段长度有利于质谱鉴定,蛋白质覆盖率明显提升。通过对酶的用量进行优化对比,最终确定了Lys-C/trypsin顺序酶切时酶的合理用量。本研究结果对提高蛋白质组学样本的制备质量以及蛋白质的序列鉴定覆盖度具有指导意义。
- 李倩冯钰谭敏佳翟琳辉
- 关键词：胰蛋白酶蛋白质组学
- 蛋白酪氨酸硫酸化修饰的研究进展被引量：1
- 2017年
- 无机硫酸盐与生物分子的结合在生物体系中具有重要的作用,并且与疾病的发生直接相关。蛋白酪氨酸硫酸化(protein tyrosine sulfation,PTS)是一个普遍的翻译后修饰,从其第一次被报道至今已有50余年。然而,酪氨酸硫酸化在生理条件下的意义以及与疾病的关系在最近几年才逐渐受到关注。目前,只有极少量的硫酸化蛋白质得以鉴定。现选择性地对蛋白酪氨酸硫酸化做一个简要的回顾,并总结了基本的生物化学信息,包括酪氨酸蛋白硫酸转移酶的制备、蛋白酪氨酸硫酸化的测定方法、蛋白酪氨酸硫酸化的生物学功能。这些信息是将来对蛋白酪氨酸硫酸化功能进一步探索的基础。
- 潘露露翟琳辉谭敏佳
- 关键词：蛋白质翻译后修饰生物学功能
