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基于ISSR与ITS-RFLP的花生白绢病菌遗传多样性分析
2021年
本研究利用简单重复序列区间(Inter Simple Sequence Repeat,ISSR)和ITS-RFLP技术,对采自我国12个省市的39个花生白绢病菌菌株进行遗传多样性分析。结果表明:从筛选出的17条ISSR引物共扩增出269条DNA谱带,其中多态性谱带266条,平均多态性百分率为98.9%,UPGMA聚类分析将这些菌株分为4个类群。限制性内切酶AluⅠ、RsaⅠ、HpaⅡ和MboⅠ作用内部转录间隔区(Internal Transcribed Spacer,ITS)PCR扩增产物产生的谱带,利用ITS-RFLP分析遗传多样性,将39个菌株划分为7个组群。ISSR和ITS-RFLP的结果均表明花生白绢病菌存在较高的遗传变异,但其遗传相似性与地理来源无明显相关。
宋万朵晏立英雷永淮东欣康彦平王志慧姜慧芳廖伯寿
关键词:花生白绢病ISSRITS-RFLP
Dermatophytes Species Isolated of HIV-Infected Patients Identified by ITS-RFLP and ITS Region Sequencing from Triangulo Mineiro, Minas Gerais State of Brazil
2019年
Dermatomycoses are a group of diseases worldwide distributed and affect skin, hair and nails. Several fungal species can be envolved and keratinophilic fungi belonging to the genera Trichophyton, Microsporum and Epidermophyton are very common. These infections are globally distributed and their incidence has progressively increased. Despite their high incidence, few studies have been carried out in HIV-infected patients, regarding frequency, clinical presentations, and species identification. This study aimed to evaluate some epidemiological and clinical aspects of dermatophytosis in HIV-infected patients and to attempt phenotypical and molecular characteristics of their agents. Of 398 patients included, 306 were HIV-infected. Clinical data and samples of skin, hair and nail lesions were simultaneously obtained. The dermatophytes yielded in culture were phenotypically identified and evaluated by ITS-RFLP and ITS (Internal Transcribed Space) sequencing. Dermatophytes frequency in HIV-infected patients with cutaneous lesions was 11.76% similar to the 15.22% observed in non-HIV individuals. Trichophyton rubrum was the most common isolated species in both groups. Throught ITS-RFLP, 29/32 (90.63%) of dermatophytes isolates were identified at the species level. From the 10 isolates randomly selected for ITS sequencing, seven confirmed the ITS-RFLP results while three Trichophyton sp. were not identified as dermatophytes. The identification of these species in HIV-infected patients is highly desirable in order to improve the knowledge of their frequency, geographical distribution and relation to clinical presentation.
Thatiana Bragine-FerreiraLuiz Sérgio de Lima-JúniorLarissa Beatriz SilvaLeonardo Eurípedes Andrade-SilvaDelio JoséMoraBruno Siqueira PrudenteKennio Ferreira-PaimFabiana Almeida Araújo SantosLuiz Ricardo GoulartMario León Silva-Vergara
关键词:DERMATOPHYTOSISDERMATOPHYTESITS-RFLPHIV-INFECTEDTRICHOPHYTON
白灵菇和杏鲍菇菌种真实性鉴定 ITS-RFLP
本标准规定了日光温室西葫芦基质栽培的产地环境、茬口安排、栽培槽、栽培基质、育苗、定植管理、病虫害防治、采收和生产档案等。本标准适用于山东省日光温室西葫芦的基质栽培。
琯溪蜜柚亚洲柑橘叶点霉与首都叶点霉ITS-RFLP快速鉴定被引量:3
2018年
亚洲柑橘叶点霉Phyllosticta citriasiana是引起琯溪蜜柚黑斑病的病原菌。首都叶点霉Phyllosticta capitalensis是分离自琯溪蜜柚的一种腐生真菌。在本研究建立2种叶点霉属真菌的ITS-RFLP快速鉴定方法。首先采集平和县琯溪蜜柚样品,分离纯化获得目的菌P.citriasiana和P.capitalensis,提取这2种病菌的菌丝体总DNA,使用ITS1和ITS4引物对扩增rDNA-ITS基因片段,再用限制性内切酶Acc I酶切扩增产物。结果表明,P.citriasiana和P.capitalensis这2种菌的rDNA-ITS基因酶切分别产生了2个和3个特异条带。通过条带的数量和大小使这两种真菌得以区分,该方法快速、简便。
罗金水郑域茹卢松茂林智明林艺华
关键词:琯溪蜜柚黑斑病
利用ITS-RFLP标记辅助筛选白灵侧耳与杏鲍菇杂交菌株被引量:3
2017年
为提高白灵侧耳菌株、杏鲍菇菌株及其杂交菌株筛选效率及鉴定的准确性,利用ITS-RFLP标记辅助单核杂交技术对白灵侧耳与杏鲍菇的杂交菌株进行了筛选.对5份白灵菇菌株和4份杏鲍菇菌株进行了种间配对杂交,根据亲本菌株交配型将其分成7个组合进行杂交.结果表明:9份亲本材料共具有6个A因子和7个B因子.利用该技术对杂交处理后的菌株样品进行筛选,获得了3份杂交菌株11D、53D、70D,其中杂交菌株11D与53D的菌丝生长速度与亲本菌株相比较差异显著;杂交菌株70D的菌丝生长速度与亲本菌株XB130DB相比较差异显著,而与亲本菌株BL130DB在菌丝生长速度上差异不显著.
谭笑滕立平滕星凤鹏杨大海李启云温嘉伟
关键词:分子标记杂交菌株交配型
一种棉花主要病原真菌ITS-RFLP快速鉴定方法
本发明公开了一种棉花主要病原真菌ITS-RFLP快速鉴定方法,主要包括以下步骤:1)棉花主要病原真菌菌丝基因组DNA提取,包括大丽轮枝菌、黑白轮枝菌、立枯丝核菌、串珠镰刀菌、粉红单端孢和尖孢镰刀菌;2)核糖体内部转录间隔...
李志芳朱荷琴冯自力赵丽红师勇强
文献传递
板栗实腐病菌rDNA-ITSRFLP和测序分析被引量:6
2014年
为了明确孝感本地板栗实腐病菌的种类及其多样性,对分离自孝感的11株板栗实腐病菌的ITS进行了测序和RFLP分析。用通用引物ITS4和ITS5扩增病原菌的ITS1-5.8S-ITS2区域,PCR扩增产物经EcoRⅠ、HaeⅢ和TaqⅠ分别酶切,酶切结果用软件NTSYSpc2.1作聚类图。经ITS-RFLP分析得到了11条多态性DNA条带,在遗传相似系数0.72水平分为4个类群。并对PCR产物进行测序和BLAST分析,相似序列用MEGA5.1构建系统发育树。经形态学和ITS双向测序和比对分析,病原菌主要来源于3个属:Botryosphaeria(无性态Diplodia)、Neofusicoccum和Fusarium(有性态Gibberella),其中Neofusicoccum为引起板栗实腐病菌的新报道属。
傅本重王立华李国元徐东生王有宁章爱群邹礼平
关键词:板栗实腐病
山东及河南濮阳禾谷孢囊线虫分布调查与rDNA-ITS-RFLP分析被引量:3
2014年
为进一步明确山东省和临近山东的河南濮阳地区禾谷孢囊线虫病(Cereal cyst nematode,CCN)的发生状况及种类组成,于2013年6-8月,对山东省12个地级市124个点及河南省濮阳市19个点麦茬田采集的土样进行检测,分离孢囊,并通过rDNA-ITS-RFLP分析技术研究了山东省和河南省共15个禾谷孢囊线虫群体核糖体DNA(rDNA)内转录间隔区(ITS)的遗传变异。结果表明,山东省各县(市)的孢囊平均检出率为66.13%,河南省濮阳市的孢囊检出率为80.95%,其中山东聊城市和河南濮阳市发病相对较重;rDNAITS-RFLP鉴定结果表明,山东和河南两省的CCN为Heterodera avenae,不同地区CCN同源性高达99.8%以上,8种限制性内切酶AluⅠ、AvaⅠ、HaeⅢ、HindⅢ、HinfⅠ、RsaⅠ、PstⅠ、TaqⅠ共产生18个酶切片段,其中,AvaⅠ和HindⅢ不能酶切。酶切结果稳定,所有地区鉴定结果一致。
张文娟宋晓磊任玉鹏齐浩亮魏岩慕卫刘峰
关键词:禾谷孢囊线虫
一种棉花主要病原真菌ITS-RFLP快速鉴定方法
本发明公开了一种棉花主要病原真菌ITS-RFLP快速鉴定方法,主要包括以下步骤:1)棉花主要病原真菌菌丝基因组DNA提取,包括大丽轮枝菌、黑白轮枝菌、立枯丝核菌、串珠镰刀菌、粉红单端孢和尖孢镰刀菌;2)核糖体内部转录间隔...
李志芳朱荷琴冯自力赵丽红师勇强
文献传递
ITS-RFLP在白灵菇种质资源鉴定中的应用被引量:2
2013年
为快速鉴别白灵菇种质资源的真伪,对58个供试菌株进行ITS特异性扩增,根据遗传差异选择菌株进行ITS克隆测序,经ITS-RFLP分析和ITS序列分析得知:58个供试菌株中,Pl.n0010、Pl.n0020、Pl.n0025、Pl.n0041这4个菌株为杏鲍菇;菌株Pl.n0037是糙皮侧耳;余下53个菌株为白灵菇。结果表明:ITS-RFLP可应用于白灵菇与杏鲍菇菌株间的鉴定。
刘新锐何仲辉谢宝贵熊芳朱坚
关键词:白灵菇ITS-RFLP种质资源

相关作者

顾建锋
作品数:106被引量:295H指数:8
供职机构:南京农业大学
研究主题:松材线虫 伞滑刃线虫 根结线虫 线虫 ITS-RFLP
郑炜
作品数:38被引量:76H指数:5
供职机构:北仑出入境检验检疫局
研究主题:ITS-RFLP 线虫 伞滑刃线虫 松材线虫 螺旋线虫
冯自力
作品数:147被引量:434H指数:13
供职机构:中国农业科学院棉花研究所
研究主题:棉花黄萎病 棉花 棉花黄萎病菌 黄萎病 内生真菌
李志芳
作品数:90被引量:351H指数:12
供职机构:中国农业科学院棉花研究所
研究主题:棉花黄萎病 棉花黄萎病菌 棉花 内生真菌 CEF
赵丽红
作品数:125被引量:343H指数:12
供职机构:中国农业科学院棉花研究所
研究主题:棉花黄萎病 棉花 棉花黄萎病菌 黄萎病 内生真菌