何涛 作品数:42 被引量:391 H指数:13 供职机构: 中国科学院成都生物研究所 更多>> 发文基金: 国家科技支撑计划 四川省科技支撑计划 四川省“十一五”农作物及畜禽育种攻关项目 更多>> 相关领域: 农业科学 医药卫生 生物学 轻工技术与工程 更多>>
用SSR标记检测同源四倍体与二倍体水稻的遗传差异 被引量:25 2004年 随机选用分布于水稻 (OryzastativaL .) 12条染色体上的 15对SSR(simplesequencerepeats)引物 ,对 18种中科院成都生物所培育的四倍体水稻和 9种大面积种植的二倍体水稻进行了SSR多态性分析 .11对具多态性的引物共检测到 33条多态性条带 ,平均每对引物检测到 3个等位基因 .研究结果发现 ,所用同源四倍体水稻的基因组与二倍体水稻基因组大部分相同 ,只是在某些位点上具有差异 ,并筛选出部分SSR标记来区分二倍体与其同源四倍体 .本研究还对二倍体与同源四倍体之间遗传差异的原因进行了初步的探讨 .图 2表 2参 栾丽 孔繁伦 何涛 刘刚 涂升斌关键词:SSR 水稻 同源四倍体 基于叶绿体psbA-trnH和核糖体5S rRNA基因间隔区序列的石斛种间和种内鉴别 被引量:12 2015年 采用直接测序法对12种石斛叶绿体psb A-trn H基因间隔区序列和核糖体5S r RNA基因间隔区序列进行测序,用克隆测序法对叠鞘石斛dq-2品种和dq-5品系(各20份样品)psb A-trn H基因间隔区序列进行测序,所得序列采用Squencher4.14拼接后,采用Bioedit 7.0软件对获得的psb A-trn H基因间隔区序列和5S r RNA基因间隔区序列进行序列比对和排序,用Dnasp5.0软件分析序列核苷酸多态性,用MEGA 5.2计算种内和种间kimura2-parameter(K2P)遗传距离,并构建系统发育树(NJ树).结果显示,石斛叶绿体psb A-trn H基因间隔区序列平均长度为742.3 bp,有72个变异位点,其中信息位点33个;核糖体5S r RNA基因间隔区序列平均长度为336.4 bp,存在213个变异位点,其中信息位点139个;以上两个基因片段的组合序列,能对叠鞘石斛、铁皮石斛、球花石斛、细叶石斛、细茎石斛、齿瓣石斛、鼓槌石斛、尖刀唇石斛和金钗石斛等9种石斛进行有效鉴别,可揭示铁皮石斛不同居群间的差异,而且可根据该组合序列中存在的一个单核苷酸多态性位点(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)对叠鞘石斛dq-2品种和dq-5品系进行区分.本研究表明,psb A-trn H基因间隔区序列和5S r RNA基因间隔区序列组合后显示出多序列组合策略在石斛种间和种内的分子鉴别中的优势,可为石斛属植物及药材鉴别提供分子依据. 彭小凤 何涛 淳泽 胡亚东 万闰兰关键词:石斛 分子鉴别 单核苷酸多态性位点 铁皮石斛尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(UGP)的密码子偏好性分析 被引量:17 2014年 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UDP-Glucose pyrophosphorylase,UGPase)是糖代谢的主要酶类之一.为了解铁皮石斛(Dendrobium officinale)尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(UGP)的密码子使用特性,运用CHIPS、CUSP和CodonW在线程序分析自主克隆的铁皮石斛UGP基因(GenBank登录号:KF711982.1)的密码子偏好性,并与其他物种的UGP基因以及基因组进行比较.结果显示,铁皮石斛UGP基因偏好使用A/T结尾的密码子,27种偏好密码子(RSCU>1)中偏好性较强的有TAA和CCU(RSCU≥2).与其他物种的UGP基因密码子使用对比后,发现不同物种UGP基因密码子使用偏好性存在一定差异.在9个所选物种的聚类分析中,发现基于UGP基因CDS序列聚类的进化树比基于RSCU的聚类更与传统的系统发育观点接近.与3种生物基因组密码子使用频率比较发现,与大肠杆菌基因组密码子使用频率差值较大的有23个,与酵母和拟南芥基因组差值较大的均有13个,这预示着铁皮石斛UGP基因在酵母和拟南芥中的表达效率较高.本研究结果为铁皮石斛UGP基因选择最佳的外源表达系统以及提高其表达水平奠定了前期的研究基础. 孙晶 何涛 万闰兰 彭小凤 淳泽关键词:铁皮石斛 密码子偏好性 聚类分析 超声波辅助热回流技术提取马鞭石斛多糖的工艺研究 被引量:9 2009年 目的优选超声波辅助热回流法提取马鞭石斛多糖工艺。方法以多糖的提取率作为指标,通过单因素及正交实验对提取工艺进行优化,主要考察因素为提取时间、温度和次数。结果超声波辅助热回流提取马鞭石斛多糖的最优工艺条件:温度95℃,时间16 m in,提取4次,采用此工艺提取的马鞭石斛多糖提取率为(18.64±0.396)%,显著高于传统热回流法的提取率。结论该工艺具有良好的精密度和稳定性,重复性好,适用于马鞭石斛多糖的提取。 罗傲雪 何兴金 范益军 何涛 刘静 淳泽关键词:超声波辅助提取 多糖 同源四倍体与二倍体水稻Wx基因位点的遗传差异 被引量:7 2005年 测定了中国科学院成都生物所培育出的14种同源四倍体水稻及8种大面积推广的二倍体水稻的直链淀粉含量,并利用微卫星标记484/485,Wxup2/485及PCR-AccⅠ分子标记对同源四倍体及二倍体水稻进行扩增.发现直链淀粉含量发生变化的部分同源四倍体水稻Wx基因位点发生变异,表明微卫星标记与同源四倍体水稻直链淀粉含量之间存在相关性,并初步探讨了同源四倍体水稻Wx基因位点遗传变异的原因. 栾丽 涂升斌 孔繁伦 何涛关键词:直链淀粉含量 微卫星标记 WX基因 同源四倍体 不同提取方法对石斛多糖含量测定的影响 被引量:16 2010年 目的:研究不同提取方法对石斛多糖含量测定的影响。方法:分别采用回流提取、改进回流提取、超声波提取与超声辅助热回流提取法对石斛多糖进行提取,通过苯酚-硫酸法检测其多糖含量。结果:4种提取方法所测得的多糖含量分别为(13.473±0.634)%、(15.692±0.743)%、(11.87±0.536)%、(16.29±0.407)%。结论:不同提取方法对石斛多糖含量测定影响较大,采用超声辅助热回流提取法所得含量最高,而且提取时间短、提取较为彻底,适合于石斛多糖含量测定的样品前处理。 罗傲雪 范益军 罗傲霜 何涛 淳泽关键词:石斛 多糖 苯酚-硫酸法 超声波辅助提取 药用石斛的叶绿体matK基因序列分析及鉴别 被引量:46 2009年 比较22份(包括待检材料4份)共计12种药用石斛及密花石豆兰(1份)的叶绿体DNA matK基因序列差异,从分子水平对药用石斛进行鉴定。采用改良的CTAB法提取石斛基因组DNA,PCR扩增,克隆测序法对叶绿体DNA matK基因全序列进行测定,运用BioEdit、MEGA4.0等软件分析序列,构建分子系统树。测得石斛属12种植物的叶绿体matK基因长1410bp,变异位点51个,信息位点11个。除了存在碱基替换的遗传变异外,还存在碱基的插入和缺失。石斛种间以及种内不同居群(品种)间均能在NJ树中明显分化开来,种间平均遗传距离为0.008,种间最大遗传距离为0.014,最小遗传距离为0.003,碱基相差8~20个。种内不同居群(品种)遗传距离为0.001,相差1~5个碱基。并成功地对4种待检种进行了鉴定。利用12种石斛的matK基因全序列数据库及遗传分析软件,通过对待检种的matK基因全序列进行测定,可以在分子水平对石斛不同种及种内不同居群(品种)进行鉴别,为石斛的分子鉴定提供依据。 刘静 何涛 淳泽关键词:石斛 分子鉴定 石斛不同极性成分的提取及其对肺癌细胞的抑制作用 被引量:6 2018年 为探究石斛(Dendrobium)的不同极性成分对人肺癌细胞抑制作用的差异,寻找到石斛抗癌活性成分高效提取的方法,采用极性不同的溶剂和方法对金钗石斛(D.nobile)、迭鞘石斛(D.denneanum)的药用成分分别进行提取以及层析柱纯化,以CCK-8实验检测不同极性提取物对人肺癌细胞和正常细胞的抑制作用,同时采用傅里叶变换红外光谱仪分别对石斛的乙醚和乙醇提取物成分进行检测和比较.结果显示,石斛的不同极性成分抑癌作用差异显著,石斛的抑癌成分极性较小,易溶于乙醚.经石油醚预洗后的石斛乙醚提取物对肺癌细胞的抑制作用较强,100μg/mL的金钗石斛与迭鞘石斛提取物对肺癌A549细胞的24 h抑制率分别为45%和40%.而传统中药成分提取中常用的水和乙醇对石斛抗癌成分的提取效率较低.红外光谱分析亦显示石斛的乙醚提取物与乙醇提取物化学成分上存在较大差别,因此对于石斛抗癌成分的提取应采用极性较小的乙醚等溶剂.此外,发现金钗石斛的特定极性组分C具有较强的抑制肺癌细胞作用,其100μg/mL的浓度对肺癌A549细胞的24 h抑制率达到97%,可作为石斛抗癌新药筛选的来源.因此,金钗石斛和迭鞘石斛的抑癌成分具有特定的极性,结果可为石斛抗癌成分及抗癌作用的进一步研究和利用提供参考. 李莹 刘静 刘静 何涛 何涛 淳泽关键词:金钗石斛 迭鞘石斛 抑癌作用 乙醚提取物 肺癌细胞 早熟高产杂交水稻新组合-六优105 郭学兴 何涛 韩思怀 罗科 杂交稻早熟高产新组合“六优105”,属早熟、大穗、高产新组合,生育期比汕窄8号长2-4天,一般亩产500公斤左右,示范最高单产达665公斤。穗平着粒150-200粒,结实率85%左右,千粒重30克左右。该组合耐肥抗倒,穗...关键词:关键词:杂交水稻 早熟品种 迭鞘石斛中性多糖DDP1-1的体内免疫活性 被引量:17 2010年 建立S180肉瘤模型,考察了迭鞘石斛中性多糖的体内免疫活性.以不同浓度的多糖作为药物组,环磷酰胺为阳性对照,生理盐水为阴性对照.给药14d后处死并解剖小鼠,眼眶取血,计算抑瘤率和免疫指数,检测血清中TNF-α、IL-2和IFN-γ含量.结果显示不同浓度的多糖表现出不同的免疫活性,其中多糖低浓度组(1.25mg/mL)有较高的肿瘤抑制率和免疫指数(P<0.01),并促进和调节IL-2、IFN-γ、TNF-α在机体内分泌(P<0.01),协调改善机体免疫系统功能,达到治疗肿瘤的目的. 范益军 淳泽 罗傲雪 罗傲霜 何涛 何兴金关键词:迭鞘石斛 体内免疫 细胞因子