张云霄
- 作品数：3 被引量：34H指数：3
- 供职机构：西北农林科技大学农学院更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项陕西省教育厅科研计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 抗病基因同源序列的克隆及其在作物中的应用研究进展被引量：7
- 2017年
- 抗病基因同源序列克隆法即RGA法是克隆抗病基因快速有效的途径。它是根据已克隆植物抗病基因的保守结构域设计简并引物,扩增获得RGAs,通过分析RGAs与抗病基因的关系,确定候选基因,最终获得抗病基因。目前克隆的RGAs主要是根据NBS-LRR和STK两种保守结构域获得。本综述介绍了抗病基因的分类、特征及作用,论述了抗病基因同源序列的克隆及其在遗传图谱构建,基因定位、克隆,植物起源进化及多样性方面的应用及研究进展,为进一步克隆抗病基因、揭示抗病信号途径及抗病机制奠定基础。
- 张晓娟刘梦昕张云霄王佳州赵辉
- 关键词：抗病基因同源序列NBS抗病基因
- 甘蓝型油菜MADS-box基因家族的鉴定与系统进化分析被引量：14
- 2017年
- MADS-box基因家族参与调控开花时间、花器官分化、根系生长、分生组织分化、子房和配子发育、果实膨大及衰老等植物生长发育的重要过程。基于甘蓝型油菜(Brassica napus)基因组测序数据,利用生物信息学方法对甘蓝型油菜MADS-box基因家族进行鉴定和注释及基因结构与系统进化分析。结果显示,在甘蓝型油菜中鉴定出307个MADS-box基因家族成员,根据进化关系可将其分为两大类型,I型(M-type)包含α、β、γ三个亚家族,II型(MIKC-type)包括MIKCC和MIKC*两个亚家族,MIKCC可进一步分为13个小类;甘蓝型油菜A基因组染色体上分布的MADS-box基因多于C基因组。在基因结构上,MIKC-type亚家族基因序列普遍比M-type长且含有较多的外显子;M-type亚家族蛋白序列中的motif数量为2–5个,MIKC-type亚家族蛋白序列中平均含有7个motif。拟南芥(Arabidopsis thaliana)与甘蓝型油菜MADS-box基因共线性分析结果显示,全基因组复制事件对MADS-box基因家族尤其是MIKC亚家族的扩张起重要作用;MIKC亚家族基因在进化过程中受到的选择压力约为M-type的2倍,这表明MIKC-type亚家族在进化过程中被选择性保留。
- 高虎虎张云霄胡胜武郭媛
- 关键词：甘蓝型油菜MADS-BOX基因结构进化共线性
- 利用SSR和SRAP标记分析油菜骨干亲本的遗传多样性被引量：13
- 2019年
- 【目的】分析甘蓝型油菜骨干亲本的遗传多样性,揭示参试材料的遗传差异。【方法】利用筛选到的8对SSR引物和12对SRAP引物,对30份甘蓝型油菜骨干亲本材料及1份芥菜型油菜和1份白菜型油菜材料进行遗传多样性分析,结合聚类分析、主成分分析、群体结构分析以及分子方差分析揭示参试材料之间的遗传多样性。【结果】在参试材料中,8对SSR引物共扩增出49条多态性条带,多态性比率为96.08%,平均每对引物扩增6.1条,平均多态性信息含量(PIC)为0.43,遗传距离均值0.34;12对SRAP引物共扩增出77条多态性条带,多态性比率为98.72%,平均每对引物扩增6.4条,PIC为0.59,遗传距离均值0.46。UPGMA聚类分析表明,在遗传相似系数0.65处,大部分参试材料被分为两大类,第Ⅰ类包括19份材料,其中14份为恢复系,5份为保持系;第Ⅱ类包括9份材料,均为保持系。主成分分析、群体结构分析的结果与聚类分析结果基本一致。分子方差分析结果显示,参试甘蓝型油菜群体内变异系数为95.46%,群体间变异系数仅为4.54%。保持系与恢复系材料间差异为2.03%。【结论】参试甘蓝型油菜骨干亲本间存在一定的遗传差异,恢复系和保持系群体内部遗传变异大于群体间的遗传变异。
- 臧珊张云霄郭媛胡胜武
- 关键词：油菜骨干亲本SSR标记SRAP标记
