杨威 作品数:4 被引量:10 H指数:3 供职机构: 吉林农业大学动物科学技术学院 更多>> 发文基金: 国家级星火计划 更多>> 相关领域: 农业科学 更多>>
利用转录组测序分析GRB2和SOS基因在籽鹅等级前卵泡中的mRNA表达 被引量:3 2017年 为研究生长因子受体结合蛋白2(Growth factor receptor-bound protein 2,GRB2)和SOS(Son of sevenless)基因组在籽鹅等级前卵泡中的表达情况,本研究采用高通量测序技术对籽鹅等级前卵泡进行转录组测序分析,之后通过荧光定量PCR进行验证。通过FPKM值进行分析,GRB2和SOS在籽鹅等级前卵泡中均有表达。随着卵泡的发育,GRB2在小白卵泡中表达量最低,在初级卵泡中表达量最高;SOS在大白卵泡和中白卵泡中的表达量最低,在初级卵泡中的表达量最高。荧光定量PCR结果与转录组测序结果基本一致。 孙永峰 李书哲 王子遒 路洪涛 杨威 隋玉健关键词:籽鹅 转录组测序 鹅等级前卵泡组织转录组测序分析 被引量:2 2017年 为研究鹅等级前卵泡组织的转录组差异,丰富鹅卵泡转录组数据信息,实验选用3只经产处于高峰期的籽鹅等级前卵泡,通过Illumina Hi Seq 2500测序平台进行测序,并进行序列分析和注释。经测序质检后共得到224 929214条序列,31 722 729 162 bp碱基,且质量大于20的碱基比例高于95%,从头拼装后得到114 486条Unigenes序列和145 020条Transcripts序列,通过比对分析共有42 453条序列注释到NR数据库,并进行物种同源性比对,发现绿头鸭与其同源性最高,通过GO数据库比对,发现共有1 045条Unigenes注释到GO数据上,主要涉及生物过程、分子功能和细胞组分。结果表明,共有11 949条Unigenes比对到KEGG数据库,共涉及到341条通路,其中癌症通路、PI3K-AKT信号通路和MAPK信号通路显著富集。为验证基因表达差异,以FPKM值作为基因的表达量,FDR<0.05,︱log FC︱≥1为标准筛选差异基因,其中以SY等级卵泡为参考,在PE等级卵泡组织间中得到15 516条差异基因,其中上调基因8 293条,下调基因7 223条。并对筛选得到的所有差异基因进行GO和KEGG比对。本实验条件下,测得各等级卵泡之间基因表达差异较大,且癌症通路、PI3K-AKT信号通路和MAPK信号通路较为活跃,可间接证明这3条通路对鹅等级卵泡发育影响较大,这对进一步分析鹅等级前卵泡发育机制提供基础。 孙永峰 武惠岩 王子遒 路洪涛 李书哲 杨威 隋玉健关键词:转录组测序 差异表达基因 A型流感病毒非结构蛋白NS1的研究进展 被引量:3 2016年 A型流感病毒是引发人类和其他动物的高度接触性呼吸道感染的一种重要病原体,对公共健康是造成了持续性威胁。由于其分段RNA的快速变化,导致了新的、未知的亚型出现,其中部分亚型可能造成流感大流行,给人类和畜禽造成巨大损失。A型流感病毒属正黏病毒科,血清学上可分为18个血凝素(HA,H1-H18)亚型和11个神经氨酸酶(NA,N1-N11)亚型[1],其基因组由8个单链负股RNA片段构成, 杨威 王春凤关键词:A型流感病毒 非结构蛋白 呼吸道感染 神经氨酸酶 公共健康 病原体 鹅等级前卵泡中TGF-βⅠ和TGF-βRⅡ基因mRNA的表达分析 被引量:3 2017年 为了探究两种可能引起卵泡闭锁的基因转化生长因子βⅠ(TGF-βⅠ)、转化生长因子受体βⅡ(TGF-βRⅡ)在鹅等级前卵泡内是否表达,试验选择处于产蛋高分期的籽鹅,采集其等级前卵泡并提取总RNA,采用荧光定量PCR的方法计算目的基因在等级前卵泡中的相对表达量。结果表明:目的基因在鹅的各个等级前卵泡中均有表达,且在M等级卵泡中表达量相对最高,在pe等级卵泡中表达量相对最低。提示TGF-βⅠ、TGF-βRⅡ对鹅的卵泡闭锁现象可能起到一定作用。 王子遒 路洪涛 李书哲 杨威 隋玉健 孙永峰关键词:转化生长因子Β 籽鹅