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蔡晓昂
作品数:
1
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供职机构:
北京农学院园林学院
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发文基金:
北京市自然科学基金
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相关领域:
农业科学
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合作作者
张克中
北京农学院园林学院
崔金腾
北京农学院园林学院
贾月慧
北京农学院
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贾月慧
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崔金腾
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蔡晓昂
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中国农学通报
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2014
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百合未授粉成熟雌蕊转录组测序研究
2014年
本研究旨在大量发掘百合雌蕊特异表达基因,为研究百合杂交障碍的分子机制提供依据。利用Illumina高通量测序平台,进行百合未授粉成熟雌蕊转录组测序和数据组装,并对获得的Unigene进行功能注释、分类和代谢通路分析。"干柱头"雌蕊LoP1和"湿柱头"雌蕊LoP2分别获得40792条和39708条Unigene。2个样品的Unigene通过序列拼接,去冗余处理,以及同源转录本聚类,得到44175条All-Unigene。基于NR、NT、Swiss-Prot、GO、KEGG和COG等6个数据库进行相似性比对(E值≤10-5),依次分别有30343、21647、21281、19274、12964和22227个基因被注释。KEGG分析中,19274条AllUnigene被注释到128个代谢通路上。基因分析显示,百合未授粉成熟雌蕊已为授粉受精做好了物质、能量、信号转导以及抗病原等准备工作。
蔡晓昂
崔金腾
贾月慧
张克中
关键词:
百合
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