丁秀云
- 作品数：17 被引量：69H指数：6
- 供职机构：东北农业大学食品学院乳品科学教育部重点实验室更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金公益性行业(农业)科研专项更多>>
- 相关领域：轻工技术与工程生物学医药卫生更多>>
- 基于基因组学分析嗜热链球菌KLDS SM的蛋白质水解系统和氨基酸合成途径被引量：5
- 2018年
- 为从遗传水平上探究嗜热链球菌KLDS SM蛋白质水解和氨基酸合成的能力,首先基于Illumina Hiseq 2500与Pacbio RSII测序平台对嗜热链球菌KLDS SM进行全基因组测序并绘制基因组图谱;随后从胞外蛋白酶、转运系统、胞内肽酶以及氨基酸合成等方面所涉及的基因进行生物信息学分析;最后对15株已完成全基因组测序的嗜热链球菌的氨基酸合成能力进行比较基因组学研究。结果表明:菌株KLDS SM的基因组由一个1 856 787 bp环状染色体组成,GC含量为39.08%,含有1 732个蛋白质编码基因;菌株KLDS SM具有完整的蛋白水解系统和8种氨基酸的合成能力;15株嗜热链球菌在氨基酸合成方面上相对保守,仅在组氨酸合成途径存在较大的差异。本研究为该菌株氮代谢能力的挖掘提供了理论依据,并在将其开发为发酵剂方面上具有一定指导意义。
- 李柏良丁秀云靳妲刘飞刘飞李娜李娜赵莉
- 关键词：嗜热链球菌基因组生物信息分析蛋白质水解
- 产细菌素乳酸菌的筛选及相关基因分析被引量：1
- 2016年
- 以Escherichia coli为指示菌,采用双层平板法从7株乳酸菌中筛选出一株高产细菌素的优良菌株KLDS 4.0325;通过菌体形态观察及16S r RNA序列分析鉴定菌株KLDS 4.0325为乳酸乳球菌,通过分析该菌株全基因组序列,预测其细菌素合成基因簇有AOI_1和AOI_2,并分别做了简要介绍,在细菌素数据库中比对,均属于二类细菌素中的Lactococcin_B_(LCN-B)型细菌素;最后通过向指示菌菌液中添加无细胞发酵上清液进一步证明了该菌株所产细菌素对指示菌的作用方式是杀菌。
- 王娜娜梁宏彰李婉李柏良丁秀云霍贵成
- 关键词：细菌素
- 具有抑制大肠杆菌作用的乳酸菌的初步筛选及其益生潜能的研究被引量：9
- 2016年
- 为了筛选出具有抑制致病性大肠杆菌作用的乳酸菌,本实验以大肠杆菌ATCC25922作为指示菌,抑菌实验采用牛津杯法。通过发酵上清液对大肠杆菌ATCC25922的抑菌实验,初步筛选出三株乳酸菌发酵上清液对大肠杆菌ATCC25922具有抑制作用,经过对16S rRNA基因进行系统发育分析,发现这三株乳杆菌均为嗜酸乳杆菌。随后又对这三株嗜酸乳杆菌进行了耐酸、耐胆盐及抗生素敏感性实验。结果表明:KLDS1.0901酸耐受性最强,而KLDS1.0902和KLDS1.1003与Lactobacillus acidophilus NCFM酸耐受性接近;对照菌株Lactobacillus acidophilus NCFM胆盐耐受能力最强,KLDS1.0901和KLDS1.1003与Lactobacillus acidophilus NCFM胆盐耐受能力差异不显著,KLDS1.0902胆盐耐受能力最弱;对于抗生素敏感性,三株嗜酸乳杆菌展现出类似的结果,对氨基糖苷类的抗生素展现出耐受;相比于KLDS1.0902,KLDS1.0901和KLDS1.1003有着更好的益生作用潜能,因此随后将对这两株菌在细胞和动物模型中对抗病原菌的作用进行进一步的研究。
- 杜金城徐敏李柏良丁秀云霍贵成
- 关键词：嗜酸乳杆菌
- 嗜热链球菌KLDSSM胞外多糖生物合成途径的分析被引量：3
- 2017年
- 为了从遗传水平上探究嗜热链球菌KLDS SM合成胞外多糖(EPS)的能力,本研究从糖被转运进入胞内、糖核苷酸合成及EPS基因簇三方面所涉及的基因进行了相关分析。结果发现,该菌能够转运葡萄糖、乳糖、蔗糖、海藻糖及甘露糖5种糖,具有代谢葡萄糖、乳糖、果糖、蔗糖、海藻糖与甘露糖形成糖酵解中间代谢产物的酶类,拥有合成EPS前体物质UDP-葡萄糖、UDP-半乳糖、UDP-N-乙酰基葡糖胺、UDP-呋喃半乳糖与d TDP-鼠李糖的潜力。同时序列比对分析发现该菌具有一个与高产EPS的菌株ASCC 1275一致性极高的EPS基因簇,且EPS初步产量测定约为331 mg/m L,表明该菌是一株高产EPS潜力菌株,具有较大的应用潜能。
- 丁秀云蒙月月李柏良霍贵成
- 关键词：生物信息分析
- 嗜热链球菌KLDS3.1012胞外多糖合成途径的基因组学及表型特征分析被引量：2
- 2019年
- 在分子水平上挖掘嗜热链球菌KLDS3.1012合成胞外多糖的途径并且通过表型特征进行验证。首先,基于Illumina HiSeq与Illumina MiSeq测序平台对菌株KLDS3.1012进行基因组测序并构建基因组图谱;随后,从糖代谢、糖核苷酸合成、胞外多糖基因簇等方面进行生物信息学分析;最后,利用API 50CH测定菌株KLDS3.1012的糖发酵情况及采用高效离子交换色谱法测定胞外多糖的单糖组成。生物信息学分析结果表明菌株KLDS3.1012具有半乳糖、葡萄糖、果糖、甘露糖、乳糖和蔗糖转运系统和4种糖核苷酸(UDP-葡萄糖、dTDP-鼠李糖、UDP-半乳糖和UDP-N-乙酰葡糖胺)合成的相关基因及1个胞外多糖合成基因簇。表型特征分析结果表明菌株KLDS3.1012可以利用以上6种碳源并能形成由鼠李糖、半乳糖和葡萄糖组成的胞外多糖。本研究为分析该菌株合成胞外多糖的遗传基础与胞外多糖结构的关系提供理论依据,并对将其开发为发酵剂具有一定指导意义。
- 李柏良赵莉王成凤靳妲丁秀云刘飞刘飞
- 关键词：嗜热链球菌基因组测序生物信息分析糖代谢胞外多糖
- 乳酸菌联合酵母菌发酵制备一种新型沙棘酒被引量：10
- 2016年
- 该试验采用生物降酸的方式,利用乳酸菌联合酵母的发酵方法,克服传统果酒发酵时间长、发酵不易控制、风味较差等缺点,制备一种新型的适合大众饮用的沙棘酒。通过单因素及正交试验研究接菌量(乳酸菌/酵母菌)、发酵温度及发酵时间对沙棘酒品质的影响。结果表明,当接菌比例(乳酸菌/酵母菌)为3%∶5%,发酵温度为30℃,发酵时间为96 h时,所制的沙棘酒感官评分为93分。
- 徐敏杜金城丁秀云于上富霍贵成
- 关键词：乳酸菌酵母沙棘酒发酵
- 德氏乳杆菌吸附铅离子的机制研究被引量：2
- 2016年
- 该研究以具有较高去除铅离子能力的德氏乳杆菌(Lactobacillus delbrueckii)KLDS1.0207为研究对象,利用热力学模型及动力学模型对Lactobacillus delbrueckii KLDS1.0207结合铅离子的过程进行模拟分析,同时结合扫描电镜-能谱及傅里叶红外光谱对其结合铅离子的状态进行分析,最后得出,Langmuir-Freundlich模型比Langmuir模型和Freundlich模型更适合其结合铅离子的过程,R^2达0.9820,准二级动力学模型的R^2为0.9916,比准一级动力学模型更适合,说明该菌与铅的作用的机制为化学吸附,而不是物理吸附。由扫描电镜和能谱分析可以看出菌体表面不完全分布着铅的颗粒,推断出参与吸附过程中其主要作用的是含C、O的基团和傅里叶红外光谱,可以推测出参与铅离子结合的基团有羧基、氨基、酰胺基、羟基,推测菌与铅的作用机制可能为化学吸附、离子交换、化学沉淀等的共同作用的结果。
- 于上富靳妲丁秀云窦明理霍贵成
- 关键词：乳酸菌热力学模型动力学模型铅离子
- 多菌种共固定化发酵制备枸杞红枣乳酸饮料被引量：4
- 2015年
- 该研究以枸杞汁和红枣汁为主要原料,采用海藻酸钠包埋乳酸菌的发酵方式,采用多菌种共固定化发酵制备枸杞红枣乳酸饮料。结果表明,最佳条件为枸杞汁、红枣汁体积比1∶2,氯化钙物质的量浓度0.05 mol/L,海藻酸钠质量分数7%,接种量10%,发酵时间35 h,蔗糖添加量9%,添加甜味剂、乳酸钙等辅料,可调配成酸甜可口、营养丰富的枸杞红枣乳酸饮料;该研究为工业化生产品质优良的乳酸饮料提供理论依据,并且对提高水果产业的附加值具有十分重要的现实意义。
- 徐敏田辉杜金城丁秀云于上富霍贵成
- 关键词：固定化枸杞红枣乳酸饮料
- 一株乳酸菌吸附Pb^(2+)的条件优化被引量：11
- 2016年
- 该研究以具有良好去除铅离子能力的德氏乳杆菌(Lactobacillus delbrueckii)KLDS1.0207为研究对象,以铅离子去除率为评价指标,利用Plackett-Burman设计法对影响铅离子去除率的主要几个因素进行筛选,确定主要影响因素为pH值、菌种添加量、初始铅离子质量浓度,并采用响应面对3个因素进行优化。结果表明:当pH值为6、菌种添加量4.2 g/L、初始铅离子质量浓度9.6 mg/L时,铅离子去除率最高为95.17%。同时验证了该模型拟合良好,理论值与实际值基本符合。
- 于上富徐敏丁秀云王娜娜霍贵成
- 关键词：铅离子生物吸附响应面法
- 乳酸菌中移动基因元件的预测与分析
- 2017年
- CRISPR-Cas系统作为获得性免疫系统能够保护乳酸菌免受噬菌体等外源基因元件的入侵,旨在对乳酸菌中CRISPR-Cas系统的活性与近期发生水平基因转移的程度是否呈负相关进行检验。预测了乳酸菌中的CRISPR-Cas系统、前噬菌体及基因岛,并分别分析乳酸菌中CRISPR与前噬菌体及与基因岛在数量上的相关性。研究发现CRISPR序列的长度(能反映该免疫系统的活性)与预测的近期发生的水平基因转移事件的数目之间没有明显的相关性。结果表明乳酸菌中的CRISPR-Cas系统并不抑制水平基因转移事件的发生。
- 李婉于上富丁秀云杜金城徐敏霍贵成
- 关键词：乳酸菌水平基因转移
