范阿棋
- 作品数：9 被引量：27H指数：3
- 供职机构：甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室更多>>
- 发文基金：甘肃省科技重大专项计划国家科技支撑计划国家马铃薯产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 马铃薯StSnRK2.2基因克隆与生物信息学分析被引量：3
- 2013年
- 以马铃薯‘陇薯3号’(Solanum tuberosum)为试材,采用RT-PCR方法从马铃薯cDNA中克隆得到一个SnRK(Sucrose non-fermenting 1-related protein kinase)基因,命名为StSnRK2.2,提交GenBank注册,注册号为JX280912。通过生物信息学分析,该基因开放阅读框全长1 020 bp,编码339个氨基酸,蛋白质分子量为38.33 kDa,等电点为5.93,α-螺旋43.36%,延伸链16.22%,β-折叠6.78%,无规则卷曲33.63%,无信号肽、不跨膜,是一个膜内蛋白。亚细胞定位分析预测主要存在于细胞核中。氨基酸序列同源性比较发现,马铃薯StSnRK2.2基因与其他目前已报道的抗逆效果显著的SnRK2家族基因具有较高同源性,同烟草PK11-C5基因的同源性最高,相似性达90.56%,在系统进化树中处于同一进化分枝上。并通过分析得到该基因具有13处丝氨酸磷酸化位点、4处苏氨酸磷酸化位点和4处酪氨酸磷酸化位点,可能与植物体内Ser/Thr蛋白激酶有关,因此,推测该基因属于SnRK2基因家族成员,可能在参与逆境胁迫反应、增强植物的抗逆性中起着重要作用。
- 范阿棋毛娟刘思妍张俊莲王蒂白江平
- 关键词：马铃薯克隆生物信息学分析
- 饲用马铃薯潜在产量的分析方法被引量：5
- 2016年
- 作物实际产量与潜在产量之间存在较大的差距,潜在产量反映了作物在一个地区产量的理论上限,研究作物的潜在产量,明确作物产量的上限,进而对产量差及产量限制性因素进行研究和分析。通过对国内外马铃薯(Solanum tuberosum)潜在产量研究进行总结发现,当前马铃薯潜在产量研究存在的主要问题是马铃薯潜在产量的概念、计算分析方法以及模型之间的分析机理不一致,导致马铃薯潜在产量的分析结果存在较大的差异。在未来马铃薯潜在产量研究中,重点应该将马铃薯生长模型和遥感技术(RS)、地理信息系统(GIS)等新技术手段更好的结合起来,从单一的考虑自然因素转向自然因素与社会经济等因素相结合的研究。
- 赵锋胡开明王晓斌范阿棋张俊莲王蒂白江平
- 关键词：马铃薯作物模型
- 马铃薯StSnRK2基因功能与调控机制研究
- 白江平杨宏羽毛娟余斌高慧娟范阿棋王晓斌胡开明
- 马铃薯作为粮菜兼用型作物，在中国西部旱作农业区占据着有非常重要的地位，但是该地区干旱等不利生态条件严重制约着马铃薯产业的高效发展。马铃薯对干旱、高温等非生物性胁迫的响应遗传分子机理与种质改良的研究还处于初始阶段，主要原因...
- 关键词：
- 关键词：马铃薯生物信息学
- 马铃薯StSnRK2基因家族启动子功能初步分析
- 干旱、高盐、极温以及氧化胁迫都严重制约着植物的生长发育,导致作物产量下降以及品质不佳等问题的产生。为解决此类问题,各个国家的科学研究人员都有一个共同的目标,就是明确植物在逆境环境下产生的抵抗机制以及如何提高植物自身抵抗各...
- 范阿棋
- 关键词：马铃薯启动子功能分析
- 文献传递
- 马铃薯3个StSnRK2基因启动子的克隆与序列分析被引量：2
- 2016年
- 【目的】克隆马铃薯StSnRK2.1、StSnRK2.2和StSnRK2.4基因的启动子片段,为马铃薯StSnRK2基因表达与功能研究奠定基础.【方法】以马铃薯(Solanum tuberosum L.)品种‘陇薯3号’为试材,采用PCR技术从马铃薯基因组DNA中分离得到了3个SnRK2基因启动子.通过PCR扩增,酶切鉴定,测序,利用PlantCARE和PLACE在线分析软件预测分析所得序列.【结果】获得与预期大小基本一致的目的片段,分别为StSnRK2.1基因启动子、StSnRK2.2基因启动子和StSnRK2.4基因启动子.分析软件预测分析表明,启动子调控序列中除含有典型的真核生物核心启动子外,还含有多个CAAT-box、TATA-box等启动子元件,以及相应的ABRE、DRE/CRT、LTRE等与激素应答、逆境胁迫相关的顺式作用元件.【结论】这些结果预示StSnRK2.1、StSnRK2.2和StSnRK2.4基因调控机制相对复杂,可能参与了ABA,干旱,盐等多种逆境胁迫信号的转导过程,在马铃薯逆境胁迫应答过程中具有重要的功能作用.
- 范阿棋毛娟杨宏羽张俊莲王蒂白江平
- 关键词：马铃薯启动子克隆
- 马铃薯StSnRK2.4基因的克隆及其序列特征分析被引量：1
- 2014年
- 利用RT-PCR技术从马铃薯普通栽培品种‘陇薯3号’试管苗根部扩增得到StSnRK2.4基因的cDNA序列,并对其编码蛋白进行特性和结构分析.结果表明:该基因序列全长1 083bp,编码360个氨基酸,与烟草SnRK2家族基因具有较高的同源性,达95.56%,已注册该基因到GenBank(No.JX280914);该蛋白分子量为41.49kU,理论等电点为5.52,是一个不跨膜的膜内蛋白,主要存在于细胞核中,含有依赖cAMP/cGMP蛋白激酶磷酸化、蛋白激酶C磷酸化、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化、酪氨酸蛋白激酶磷酸化和豆蔻酰化位点,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性位点信号序列和蛋白激酶ATP结合区域信号序列,推测该基因功能与植物抗逆境胁迫有关.
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- 关键词：马铃薯克隆生物信息学分析抗逆性
- 水分胁迫下马铃薯SnRK2基因的表达模式与生理响应被引量：10
- 2014年
- 以"大西洋"和"陇薯3号"两个品种盆栽苗为试验材料,研究了水分胁迫下马铃薯(Solanum tuberosum)StSnRK2基因家族的表达特征及其与植株生理指标变化的相关性。结果表明:在发生严重水分胁迫时,"陇薯3号"和"大西洋"的抗氧化酶活性、MDA含量、相对电导率和脯氨酸含量均较对照显著提高,但增长幅度在品种间存在差异;StSnRK2基因家族的8个成员的相对表达量在"大西洋"和"陇薯3号"之间也存在明显差异,StSnRK2.1、StSnRK2.2和StSnRK2.3在两个品种中均表现为水分胁迫后相对表达量显著高于对照的趋势;StSnRK2.7的相对表达量与对照无显著差异,而StSnRK2.4在"陇薯3号"的相对表达量是对照的9.5倍,是8个基因成员在受水分胁迫后相对表达量最高的一个基因;StSnRK2.1、StSnRK2.2、StSnRK2.3、StSnRK2.4和StSnRK2.6的相对表达量均与部分生理指标呈极显著正相关,StSnRK2.5和StSnRK2.8两个基因的相对表达量与部分生理指标呈极显著负相关,StSnRK2.7基因的相对表达量与生理指标无显著相关性。
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- 关键词：干旱胁迫生理响应
- 马铃薯StSnRK2.1基因克隆与生物信息学分析被引量：7
- 2013年
- SnRK2基因对植物的逆境胁迫具有重要的调节作用,以马铃薯‘陇薯3号’(Solanum tuberosum)为试材,采用RT-PCR方法从马铃薯试管苗中克隆得到1个SnRK2.1基因cDNA,命名为StSnRK2.1,提交GenBank注册,注册号为JX280911。通过生物信息学分析,该基因开放阅读框全长1 008 bp,编码335个氨基酸。预测蛋白质分子量约为37.77 kD,等电点为5.37,蛋白质二级结构预测α-螺旋42.39%,延伸链16.42%,β-折叠7.46%,无规卷曲33.73%,具有疏水性,为膜内蛋白。亚细胞定位显示该基因出现在细胞质及微体中的可能性较大。肽链可能有7处丝氨酸磷酸化位点,2处苏氨酸磷酸化位点,以及3处酪氨酸磷酸化位点,因此推测该基因在植物抗逆中有重要的作用。
- 刘思妍毛娟范阿棋张俊莲王蒂白江平
- 关键词：马铃薯抗旱基因克隆生物信息学分析
- 马铃薯3个StSnRK2基因启动子的克隆与序列分析
- 目的：克隆马铃薯StSnRK2.1、StSnRK2.2和StSnRK2.4基因的启动子片段,为马铃薯StSnRK2基因表达与功能研究奠定基础.
方法：以马铃薯(Solanum tuberosum L.)品种'陇...
- 范阿棋毛娟杨宏羽张俊莲王蒂白江平
- 关键词：马铃薯基因克隆逆境胁迫
