刘超群
- 作品数:5 被引量:12H指数:2
- 供职机构:沈阳医学院公共卫生学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家级大学生创新创业训练计划更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- hsa-miR-192-3p的靶基因预测及功能分析被引量:2
- 2018年
- 通过生物信息学方法预测hsa-miR-192-3p的靶基因及其靶基因的可能功能。首先通过miRbase在线数据库对hsamiR-192-3p的碱基序列及序列在各物种间的保守性进行分析,再通过miRGator v3. 0在线数据库查看hsa-miR-192-3p在各个组织器官中的表达丰富度情况;其次,应用Target Scan和miRanda在线数据库预测hsa-miR-192-3p的靶基因;最后,将预测得到的两个数据库的靶基因交集用DAVID在线数据库进行功能富集分析和信号转导通路富集分析。结果表明:hsa-miR-192-3p在人、家鼠、猕猴等生物中存在高度保守性; hsa-miR-192-3p在胃肠道、肾脏、肝胆系统、干细胞、鼻、脾、胸腺中表达丰富度较高;通过两个靶基因预测软件预测的靶基因取交集后共有190个;功能富集分析发现hsa-miR-192-3p靶基因富集在细胞质、细胞核、质膜、高尔基体等15个细胞组件(p<0. 05),参与蛋白结合、GTP酶活性、锌离子跨膜转运蛋白活性等7个分子功能(p<0. 05),涉及金属离子运输、RNA聚合酶II启动子的转录阳性调控、基因表达调节、钙离子跨膜运输、胚胎发育等18个生物过程(p<0. 05);预测靶基因集合显著富集于癌症通路与催乳素信号通路中(p<0. 05)。得出结论:hsa-miR-192-3p预测的靶基因集合富集于多个生物过程,与肿瘤密切相关,生物信息预测为今后的研究奠定了一定的理论基础,为后续实验验证提供了研究方向。
- 刘超群张新生张越
- 关键词:信号转导通路癌症
- 阿霉素对H9C2心肌细胞活力和miRNA表达水平影响被引量:1
- 2019年
- 目的阿霉素(doxorubicin,DOX)是一种抗肿瘤广谱抗生素,可抑制RNA和DNA合成,对心肌细胞有剂量依赖性毒性,miRNAs与心血管疾病有着重要联系。本研究分析DOX对H9C2心肌细胞活力和miRNA表达水平影响。方法用3μmol/L、5μmol/L浓度的DOX处理H9C2心肌细胞48h,先用PBS配置DOX储备液,再将储备液滴入含有血清的正常培养基中,使DOX终浓度调到所需浓度,建立心肌细胞损伤模型,并设置正常对照组,CellTiter 96○R AQueous增殖试剂盒测定细胞活力;再用对细胞活力有显著影响的DOX处理细胞48h,然后用实时荧光定量方法检测DOX处理的H9C2心肌细胞中miR-187-3p表达情况。结果 3μmol/L和5μmol/L DOX处理细胞后,与对照组相比细胞活力均下降,产生明显细胞毒性,F=135.627,P<0.001;实时荧光定量结果显示,5μmol/L组与对照组相比,miR-187-3p表达量出现上调,t=-21.68,P<0.001。结论 DOX能降低心肌细胞活性,对H9C2心肌细胞造成损伤,影响miRNA表达量。
- 刘超群张新生许何丽窦文静腾松张越
- 关键词:阿霉素H9C2心肌细胞
- hsa-miR-367-3p靶基因预测及功能分析被引量:2
- 2019年
- 目的通过生物信息学方法预测hsa-miR-367-3p的靶基因及其靶基因的功能。方法运用miRbase在线数据库、miRGator v3.0在线数据库TargetScan、miRDB在线数据库和DAVID在线数据库进行预测和分析。结果 hsa-miR-367-3p在多个物种之间具有高度保守性;在干细胞中表达丰富度较高;功能富集分析发现,hsa-miR-367-3p的靶基因涉及心室发育、转录调节等38个生物过程(P <0.05),富集在神经元等21个细胞组分(P <0.05)。结论 hsa-miR-367-3p个别预测出来的靶基因与通路已经被证实,更多的预测结果需要进一步的研究加以验证。本研究为将来验证hsa-miR-367-3p的靶基因和可能调控的通路指明了方向。
- 张新生郭琳琳刘超群许何丽窦文静刘梦瑶张越
- 关键词:靶基因
- 慢性阻塞性肺疾病患者贫血的发生率及其临床意义被引量:4
- 2015年
- 目的:了解贫血在不同肺功能参数的慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者中的发生率。方法:回顾性分析2009年1月至2012年12月收治的398例COPD急性期(acute exacerbation of chronic obstructive pulmonary disease,AECOPD)患者和182例支气管哮喘患者的临床资料。将COPD患者按肺功能分为4组:G1组13例:1 s呼出气体体积(forced expiratory volume in one second,FEV1)/最大肺活量(forced vital capacity,FVC)<70%,FEV1%pred≥80%;G2组128例:FEV1/FVC<70%,50%≤FEV1%pred<80%;G3组198例:FEV1/FVC<70%,30%≤FEV1%pred<50%;G4组59例:FEV1/FVC<70%,FEV1%pred<30%。按血红蛋白值将COPD患者分为贫血组和非贫血组。结果:(1)398例AECOPD患者中,贫血者100例(25.13%),均为正细胞正色素贫血;在182例支气管哮喘中,贫血者为10.43%,差异有统计学意义(P<0.01)。(2)G4组患者平均血红蛋白明显高于G1组、G2组和G3组(P<0.05或0.01),G4组贫血发生率低于G1组、G2组(P<0.01)。(3)398例AECOPD患者血红蛋白与体重指数呈正相关(r=0.187,P<0.01),与Pa O2呈负相关(r=-0.127,P<0.05)。与性别、吸烟、血肌酐、Pa CO2无关。结论:在AECOPD患者中贫血发生率高,是其常见的症状,其贫血为正细胞正色素贫血。COPD贫血的发生决定低氧对红细胞生成素产生的刺激效应和全身炎症对红细胞生成素产生的抑制效应之间的平衡。
- 加慧桂方中刘超群夏书月
- 关键词:贫血肺功能
- miR-885-5p对人心肌成纤维细胞增殖和基质金属蛋白酶2和特异性蛋白1基因表达的影响被引量:3
- 2019年
- 目的探讨转染miR-885-5p 48 h后对人心肌成纤维细胞(HEH2)增殖的调控作用以及对基质金属蛋白酶2(MMP2)基因和特异性蛋白1(SP1)基因的表达的影响,为临床心血管疾病研究提供研究线索。方法培养HEH2细胞待细胞长到60%时通过脂质体转染方法对细胞转染miR-885-5p和阴性对照(NC),48h后用CCK8细胞活力试剂盒来检查细胞增殖情况。实时荧光定量PCR法检查miR-885-5p对MMP2和SP1的RNA表达的影响。结果CCK8结果表明转染48 h后阴性对照组细胞活率为(100±8)%,miR-885-5p组细胞活率为(139±16)%,提示miR-885-5p促进HEH2细胞的增殖(n=6,P<0.05),HEH2细胞转染miR-885-5p后,心肌重构相关基因MMP2和SP1的miRNA表达增高(P<0.05)。结论miR-885-5p能够促进人心肌成纤维细胞的增殖,同时促进细胞中MMP2和SP1基因的表达,提示miR-885-5p抑制剂可能是心肌纤维化相关疾病的新策略。
- 张新生刘超群刘梦瑶滕松许何丽窦文静王喜燕王玉华张越
- 关键词:增殖基质金属蛋白酶2