仇雨晨 作品数:2 被引量:5 H指数:1 供职机构: 郑州轻工业学院食品与生物工程学院 更多>> 发文基金: 国家重点实验室开放基金 河南省科技攻关计划 更多>> 相关领域: 农业科学 医药卫生 更多>>
软腐白菜根系土壤中湖生代夫特菌的分离和鉴定 被引量:1 2014年 目的筛选并鉴定软腐白菜根系土壤中分离出的细菌。方法从河南省大白菜田成熟白菜病株根系土壤采集样品,利用模拟原环境的培养基成分和条件,对样品中的细菌进行分离和培养。对菌株进行形态学观察、生理生化特征鉴定以及16S r RNA基因序列测定、比对分析和系统发育树构建,对菌株进行初步分类鉴定。结果分离到的一株编号为Q2S2-18A2的菌株16Sr DNA与代夫特菌属内的Delftia lacustris 332 T(EU888303)具有最高的相似性,相似值为98.60%。结论模拟原环境培养基,结合经典分类学方法和16S r RNA基因序列比对分析、构建系统发育树,可分离并鉴定软腐白菜根系土壤中的机会致病菌湖生代夫特菌。 杜迅 王亚南 何蔚荭 仇雨晨 安明理关键词:土壤 RNA 软腐白菜细菌群落结构多样性与生长环境的相关性 被引量:4 2011年 【目的】通过对比分析不同生境白菜软腐病变组织与根系土壤相关细菌的群落结构,探讨白菜软腐细菌种群的多样性,以及与生境土壤细菌种群的相关性。【方法】样品采自河南省2个不同生态型白菜田,以成熟白菜软腐组织及病株根系土壤为目标,利用模拟原环境的培养基成分和条件,对样品中的细菌进行高通量分离培养和细胞16S rRNA基因序列比对分析,获得各样品细菌种群结构及其丰度,进而对各样品的优势菌群进行对比分析。【结果】两种不同生境白菜软腐组织细菌总量M05T为4.0×108 cell/g、Q2T为1.2×1011 cell/g,分别获得纯菌56株和85株。M05T优势菌为萎蔫短小杆菌萎蔫亚种(Curtobacteriumflaccumfaciens pv.Flaccumfaciens);Q2T优势菌为假单胞菌(Pseudomonas spp.)(栖木槿假单胞菌(P.hibiscicola)、台湾假单胞菌(P.taiwanensis)、托木尔假单胞菌(P.tuomuerensis)、莫塞尔假单胞菌(P.mosselii))。根系土壤细菌总量M05S为2.7×105 cell/g、Q2S为6.2×107 cell/g,分别获得纯菌36株和70株。M05S优势菌为巨大芽胞杆菌(Bacillus megatherium);Q2S优势菌为假单胞菌(Pseudomonas spp.)(香鱼假单胞菌(P.plecoglossicida)、栖木槿假单胞菌(P.hibiscicola)、类黄色假单胞菌(P.parafulva)、蒙氏假单胞菌(P.monteilii)、膝形假单胞菌(P.geniculata))。【结论】依据不同生境的白菜软腐组织和根系土壤细菌群落结构对比分析,认为白菜软腐菌可能具有多样性和多种致病来源,本研究为软腐病多种防治措施的制定提供基础研究和菌种资源。 杜迅 胡宜亮 何蔚荭 陈国参 王腾飞 仇雨晨 王亚南关键词:根系土壤 RRNA基因序列 优势菌群