刘慧泉
- 作品数：17 被引量：8H指数：1
- 供职机构：西北农林科技大学植物保护学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金陕西省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学理学化学工程更多>>
- 基于链特异性RNA-seq的禾谷镰刀菌全生活史转录组分析被引量：1
- 2021年
- 为明确植物病原真菌禾谷镰刀菌Fusarium graminearum全生活史的转录组特征和基因表达模式,采用生物信息学技术对其生活史不同阶段15个时期或组织的链特异性RNA-seq数据进行分析。结果表明,共有8106个基因在所有时期均有表达,为禾谷镰刀菌生活史核心基因,占总基因数的47.2%;有性生殖和侵染过程中表达的基因数相对较多,其中有性生殖后期表达的基因数最多,达15221个;无性产孢和侵染小麦穗过程中基因表达水平整体较高,而分生孢子中基因表达水平最低。在燕麦培养基上禾谷镰刀菌气生菌丝的基因表达模式与侵染过程中的基因表达模式较为相似,而与营养生长菌丝的基因表达模式差异较大。该菌次生代谢物合成特征酶基因和分泌蛋白基因的表达模式均分成3类,即分别在侵染、营养生长和有性生殖过程上调表达,暗示其在生活史不同阶段的特异性功能。
- 曹心雨李东翱路平王秦虎江聪刘慧泉
- 关键词：禾谷镰刀菌赤霉病转录组RNA-SEQ
- 真菌细胞壁降解酶组的比较基因组学分析
- 真菌能够分泌多种细胞壁降解酶，这些降解酶能够破坏植物细胞壁，释放各种单体，这一过程不但能软化植物细胞壁利于病原真菌入侵植物体，也能为真菌提供生长发育的营养物质。大多数腐生真菌通过分泌细胞壁降解酶降解植物生物质(plant...
- 赵中涛刘慧泉安琳王晨芳许金荣
- 关键词：真菌果胶酶纤维素酶半纤维素酶
- 3'→5'核酸外切酶ERI-1调控多种RNA代谢的机制
- 2023年
- ERI-1是一种3’→5’核糖核酸外切酶,具有一个类ERI-1_3’h Exo结构域和一个SAP结构域,在真核生物中保守存在。ERI-1最初是在筛选秀丽隐杆线虫ds RNA敏感性增强突变体时发现的,是RNAi的重要调节因子。ERI-1通过与外源性RNAi组分竞争Dicer协调内源RNAi和外源性RNAi,并促进特定内源性si RNA的生成,且该功能为线虫特有。其还通过核酸外切酶活性降解si RNA及mi RNA,负向调控RNAi。裂殖酵母ERI-1通过降解异染色质相关si RNA的水平,参与调控异染色质的形成。ERI-1在r RNA的加工和成熟中发挥重要作用。此外哺乳动物ERI-1在细胞周期S期末期降解组蛋白m RNA,从而推动细胞进入G2期。本文从结构、功能等方面概述了ERI-1调控多种RNA代谢的机制,探讨了其进化丢失问题和应用前景并对后续研究提出了建议。
- 张怡然刘慧泉唐喆金巧军
- 关键词：RNA干扰小干扰RNA
- 禾谷镰孢毒力因子Cos2功能的初步分析
- 由禾谷镰孢(Fusarium graminearum)等真菌引起的赤霉病是小麦的主要病害之一,对作物生产和食品安全造成严重威胁。长期生产实践表明,培育并利用抗病品种是进行绿色防控的关键。然而,由于当前小麦与禾谷镰孢互作的...
- 孙逸坤谷丽花李帆刘慧泉王秦虎
- 关键词：禾谷镰孢细胞死亡植物免疫
- 组学分析揭示外寄生菌进化途径
- 真菌通过腐生、寄生、共生等方式获取营养。真菌在进化过程中，从水生到陆生，从腐生到寄生，从基质外部获取营养的腐生方式，逐渐进化为通过进入植物内部摄取营养的寄生方式。本研究通过对果生月盾霉的基因组和转录组分析发现，该菌为了在...
- 徐超陈欢Mark L.Gleason许金荣刘慧泉张荣孙广宇
- 关键词：比较基因组学基因组进化致病相关基因
- 必要的复杂性：真菌A-to-I mRNA编辑的重要功能和适应性优势
- 分子生物学中心法则强调遗传信息传递的忠实性,但该法则受到RNA编辑现象的挑战。RNA编辑通过核苷酸插入、删除、取代等转录后加工过程改变RNA序列,导致遗传信息发生改变。目前已在多种真核生物世系中发现了各种类型的RNA编辑...
- 齐朝妹辛凯芸杜雁飞冯婵婧曹心雨王秦虎江聪刘慧泉
- 关键词：RNA编辑有性生殖禾谷镰孢
- 小麦响应禾谷镰刀菌侵染的转录组学研究进展
- 2021年
- 由禾谷镰刀菌引起的小麦赤霉病直接为害作物穗部,不仅严重影响小麦产量,还可因为毒素污染问题威胁人畜健康。近年来对小麦与禾谷镰刀菌互作的转录组学研究带来了很多新见解,概述了小麦响应禾谷镰刀菌侵染的转录组学研究进展,主要比较了不同抗性品种、不同器官、不同籽粒发育时期的小麦穗部在禾谷镰刀菌侵染时的基因表达特征,总结了赤霉病感染时小麦的激素响应、信号传导、转录调控和防卫相关基因的表达规律,以期促进研究者对小麦响应禾谷镰刀菌侵染规律的理解。
- 李东翱刘慧泉王秦虎
- 关键词：小麦赤霉病小麦禾谷镰刀菌转录组
- 六妹羊肚菌PacBio基因组测序和DNA 6mA甲基化分析被引量：6
- 2021年
- 羊肚菌属于子囊门真菌,是世界范围内最受欢迎的食用菌之一。本研究通过PacBio单分子实时高质量核基因组组装,大小为53.57Mb,重复序列含量为17.03]%,e"包含42条重叠群(contigs),重叠群N50高达1.82Mb,其中13条重叠群两端均含有端粒重复序列,为完整的染色体。通过链特异性RNA-seq测序和转录本拼接,并结合多种基因预测策略,预测到13182个蛋白编码基因,包括267个碳水化合物活性酶,11个次生代谢产物合成基因簇。通过与内蒙古地区栽培的六妹羊肚菌菌株NZTD180501373基因组比较发现,六妹羊肚菌进化过程中可能发生过染色体重组事件,二者具有33055个SNP和48726个InDel位点差异,并且各自拥有超过6Mb的特有序列。此外,相比于梯棱羊肚菌M.importuna,六妹羊肚菌SCLS菌株中与逆转录转座酶有关的orthogroup发生了扩张,并且拥有5个成员数超过100的特有逆转录转座酶基因家族。对SCLS菌株中的DNA N6腺嘌呤甲基化(6mA)修饰进行了鉴定,发现SCLS菌株基因组中0.42%的腺嘌呤被6mA甲基化,其含量显著高于已报道的6种双核亚界(Dikarya)真菌。6mA甲基化位点在逆转录转座子上显著富集,表明六妹羊肚菌中6mA甲基化可能调控逆转录转座子的活性,这也是首次在真菌中报道6mA甲基化与转座子相关。
- 王昊明范立刚董永镕郑晓慧刘慧泉
- 真菌中存在一种依赖RID的新基因组防御机制
- 丝状子囊真菌中主要存在3种基因组防御机制用于限制转座子扩增:第一种是发生在无性阶段由多拷贝串联重复引起的RNA沉默(quelling),第二种是发生在有性阶段由同源染色体DNA不配对导致的减数分裂RNA沉默(MSUD),...
- 侯孟德倪亚甲尹锦蓉王秦虎江聪刘慧泉
- 关键词：禾谷镰孢有性生殖RNA沉默RIP
- 聚孢霉属真菌研究进展、应用现状及展望被引量：1
- 2024年
- 聚孢霉属真菌是一类具有丰富形态学和生态学特征的生物类群,广泛分布于多种环境条件中,尤其是在土壤中。聚孢霉属真菌有着巨大的生防潜力,可通过拮抗、重寄生、促生以及诱导植物抗性等多种机制防控植物病害,因而受到广泛关注。本文概述了聚孢霉属真菌的系统分类学进展,并对聚孢霉-植物病原菌以及聚孢霉-植物寄主之间的互作机制进行了综述。随后对聚孢霉的应用现状进行了总结,并对其应用前景进行了展望。从聚孢霉属真菌中挖掘具有优良生防特性的菌株,将推动其在农业应用上的商品化。
- 王光辉范君刘慧泉
- 关键词：生物防治系统发育
