谢夏青
- 作品数：4 被引量：32H指数：2
- 供职机构：南京农业大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：河北省自然科学基金国家自然科学基金北京市自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学环境科学与工程农业科学更多>>
- 邯郸、保定番茄黄化曲叶病毒检测及其DNA-A全序列分析被引量：6
- 2011年
- 2009年河北保定和邯郸地区番茄受到一种毁灭性的新病毒危害,对两地5个病样检测,结果均为番茄黄化曲叶病毒,但未检测到卫星DNAβ分子。对保定和邯郸分离物DNA-A全长进行克隆测序,两分离物DNA-A全长均为2 781 bp,这两个分离物DNA-A全长与其他地区番茄黄化曲叶病毒分离物同源性为98.6%～99.8%,发现其基因间隔区变异稍大,与其他地区番茄黄化曲叶病毒分离物同源性为96.2%～99.7%。邯郸分离物与山东分离物(SD-2)亲缘关系最近,保定分离物与南京分离物(JSNJ1)亲缘关系最近。聚类分析表明,中国几个省市分离物有很高的同源性,但可以分为两个分支,邯郸和保定的分离物分别在两个分支内。
- 李志勇谢夏青李兴红董志平
- 关键词：番茄黄化曲叶病毒分子检测DNA-A
- 标准样品在环境监测应用中几点问题的探讨被引量：22
- 2011年
- 环境(有证)标准样品(CERM)已成为环境监测及其质量保证/质量控制(QA/QC)重要工具和常用方法,科学理解和合理使用CERM越来越重要。文章将CERM在环境监测应用中的有关问题归结为"泛标样"倾向和对CERM特性值误区两个方面,结合典型案例,通过不确定度评定分析相关误区或偏颇,并提出选择性使用CERM、按规定条件使用CERM、全面了解掌握CERM特性值、合理运用CERM特性值范围和慎重评价CERM特性值范围内测定结果的差异等具体对策和建议。
- 宋国强谢夏青
- 关键词：环境标准样品环境监测
- 谷子弯孢菌海藻糖酶基因(ClTRE)及其启动子的克隆和序列分析被引量：2
- 2011年
- 海藻糖代谢调控真菌生长、发育及致病性,为了进一步研究海藻糖代谢在谷子弯孢病菌中的功能,对海藻糖酶基因及其启动子进行了克隆。根据植物病原真菌海藻糖酶基因的保守序列设计简并引物,扩增得到海藻糖酶基因同源序列。通过RACE技术,首次在谷子弯孢病菌中克隆得到了海藻糖酶基因(ClTRE)全长cDNA序列。序列分析表明,该基因最大开放阅读框为2 037 bp,编码679个氨基酸;二级结构预测表明,该蛋白含约40.48%的α螺旋,12.99%的延伸串,6.5%的β转角,40.03%的不规则卷曲;蛋白保守结构域分析发现其含有海藻糖酶特有的保守位点,与其他植物病原真菌中海藻糖酶基因有51%-86%同源性;利用SignalP3.0软件预测谷子弯孢海藻糖酶蛋白具有信号肽。通过染色体步移技术克隆得到其上游启动子序列,利用TFSEARCH软件分析含有多个与逆境胁迫相关的顺式作用元件,初步推测该基因与逆境胁迫相关。谷子弯孢病菌ClTRE基因及其启动子的克隆,为进一步研究该基因在病菌致病中作用以及以该基因为靶位点的化学防控奠定基础。
- 谢夏青李志勇马继芳刘磊董志平董金皋
- 关键词：海藻糖酶染色体步移生物信息学
- 谷子弯孢病菌Clgα-1基因克隆及特征分析被引量：2
- 2011年
- 谷子弯孢病菌(Cochliobolus lunatus)引起的谷子叶斑病是谷子生产上的重要病害之一,常造成严重经济损失。本研究利用候选基因法和RACE技术克隆了谷子弯孢病菌中的1个Gα基因,命名为Clgα-1,在GeneBank登陆号为HQ699081。Clgα-1基因开放阅读框为1 062 bp,编码353个氨基酸多肽,该开放阅读框被3个大小分别为57,49,59 bp的内含子隔开。聚类分析结果表明,谷子弯孢病菌Clgα-1基因与其他植物病原真菌Gα基因的同源性很高,Southern杂交结果表明该基因以单拷贝形式存在。Clgα-1基因具有其他病原真菌Gα基因具有的保守结构,如在氮端有豆蔻酰化位点,碳端具有ADP核糖基化位点。谷子弯孢病菌Clgα-1基因的克隆,为进一步研究Clgα-1基因在该菌致病过程中的功能奠定基础。
- 李志勇谢夏青董金皋董志平
- 关键词：异三聚体G蛋白RACE
