杨露露
- 作品数：9 被引量：11H指数：2
- 供职机构：桂林理工大学化学与生物工程学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广西壮族自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：环境科学与工程理学化学工程医药卫生更多>>
- 基于光谱和MD模拟技术研究PBDEs与HSA的作用机制
- 自从多溴二苯醚(Polybrominated Diphenyl Ethers,PBDEs）被列为POPs会议上的一大议题时,PBDEs在中国范围内的检测研究也如火如荼的进行着.
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- 溶菌酶与羟基多溴联苯醚的相互作用研究
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- 关键词：溶菌酶分子模拟
- 计算模拟与光谱法研究4-羟基-2,2’,3,4’-四溴二苯醚与人血清白蛋白的相互作用被引量：2
- 2017年
- 利用分子模拟、荧光光谱、紫外吸收光谱等方法,研究了4-羟基-2,2’,3,4’-四溴二苯醚(4-OHBDE-42)与人血清白蛋白(HSA)的相互作用。三维荧光分析表明,4-OH-BDE-42的存在降低了HSA的荧光强度,且使HSA的微环境和构象发生变化。荧光光谱和紫外吸收光谱显示,4-OH-BDE-42与HSA结合后显著猝灭了HSA的内源性荧光,猝灭机制为静态猝灭与非辐射能量转移。结合常数Ka>106L·mol-1,表明两者的结合作用较强,结合距离r为3.66nm。根据热力学参数分析,ΔH>0,ΔS>0,即4-OH-BDE-42与HSA之间结合的主要作用力为疏水作用,这与分子对接、结合自由能分析结论一致。结合自由能贡献分析表明,LYS199、GLU292、ARG257、ARG218、ALA291、HIS242为4-OH-BDE-42与HSA结合的关键氨基酸残基。
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- 关键词：人血清白蛋白光谱法相互作用
- 计算模拟与分子对接研究人血清白蛋白与羟基多溴二苯醚相互作用
- 多溴二苯醚(Polybrominated diphenyl ethers,PBDEs）是一种溴代阻燃剂,同时也是一种的新型环境污染物,因其具有特有的毒理性引起人们越来越多的关注.
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- 5'-羟基-2,2',4,4',5-五溴二苯醚与人血清白蛋白结合特征研究被引量：3
- 2016年
- 在模拟生理环境下,通过稳态荧光光谱、时间分辨荧光光谱、傅立叶变换红外光谱和三维荧光光谱等方法研究了5'-羟基-2,2',4,4',5-五溴二苯醚(5'-OH-BDE-99)与人血清白蛋白的结合特征,并结合分子对接与分子动力学模拟技术对其作用机制进行了分析。荧光光谱实验、非辐射能量转移理论及动力学模拟研究表明,5'-OH-BDE-99能使HSA发生猝灭作用,且猝灭机制为静态猝灭。傅立叶变换红外光谱、三维荧光光谱及动力学模拟研究表明,5'-OH-BDE-99可诱导HSA构象和周围环境发生变化。此外,分子对接和热力学方法研究表明,二者间的主要作用力为疏水作用力。
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- 关键词：多溴二苯醚人血清白蛋白分子对接动力学模拟
- 模拟和光谱相互验证2＇-OH-BDE-28对HSA构象的影响被引量：2
- 2016年
- 利用分子对接、分子动力学模拟(molecular dynamics simulation,MD)和光谱法研究2'-羟基-2,4,4'-三溴二苯醚(2'-OHBDE-28)与人血清白蛋白(HSA)的作用机制。MD模拟研究表明2'-OH-BDE-28诱导HSA的内部疏水性增强,结构松散膨胀,致使其二级结构发生改变;圆二色光谱实验与MD模拟结果相吻合,验证2'-OH-BDE-28可诱导HSA的构象变化。荧光光谱实验表明,2'-OH-BDE-28能通过静态猝灭和非辐射能量转移机制引起HSA荧光猝灭。分子对接推断2'-OH-BDE-28以氢键和疏水作用力键合在HSA的位点I处;热力学分析和竞争实验结果一致验证分子对接结果。本文将计算模拟和光谱实验相结合,从模拟和实验2个角度共同探讨2'-OH-BDE-28与HSA的作用机制,结果高度吻合。
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- 关键词：人血清白蛋白分子动力学模拟光谱法
- 小分子与人血清白蛋白相互作用研究方法的进展被引量：3
- 2016年
- 对1958年至2015年期间应用光谱法、亲和色谱法、毛细管电泳法、等温滴定量热法、分子对接和动力学模拟法等方法研究小分子与人血清白蛋白相互作用的进展作了评述,并对其发展方向作了展望。
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- 关键词：人血清白蛋白光谱法毛细管电泳法
- 羟基多溴二苯醚与甲状腺转运蛋白结合的光谱与计算模拟研究
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- 关键词：圆二色光谱
- 四溴联苯醚(BDE47)与溶菌酶的相互作用研究被引量：2
- 2019年
- 在模拟人体生理条件下,采用分子模拟结合三维荧光、圆二色谱、荧光光谱、时间分辨荧光等光谱方法,研究了四溴联苯醚(BDE47)与溶菌酶的相互作用机制。结果表明:BDE47能有效地猝灭溶菌酶的内源性荧光,猝灭机制为静态猝灭。分子对接显示,BDE47与溶菌酶分子中的TRP62,TRP63,ARG61,ASN59,ALA107和ILE98等氨基酸残基具有相互作用,且BDE47分子中的醚键O原子与TRP63形成了氢键,氢键距离为2.2A。三维荧光的实验结果表明,BDE47的加入导致了溶菌酶的荧光强度降低,峰位置发生略微红移,BDE47与溶菌酶之间的结合作用改变了溶菌酶的微环境。圆二色谱分析则进一步证明,BDE47的存在引起了溶菌酶的构象发生改变,导致α-螺旋结构的含量减少。根据Foster非辐射能量转移理论计算得出,供体(溶菌酶)与受体(BDE47)的结合距离r为3.31nm,满足非辐射能量的条件。分析四个温度下的热力学参数发现,BDE47与溶菌酶之间的结合是一个自发放热的过程,主要驱动力为氢键和范德华力,与分子对接、结合自由能分析结论一致。
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- 关键词：四溴联苯醚溶菌酶分子模拟光谱
