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用于微量DNA超低频突变检测的双分子自校验文库制备及杂交捕获的二代测序方法: 本发明公开了用于微量DNA超低频突变检测的双分子自校验文库制备及杂交捕获的二代测序方法。该方法包括如下步骤：血浆游离DNA提取，DNA化学错误修复，自校验双分子识别码发夹型接头制备，血浆游离DNA修复，DNA与接头连接，...; 师咏勇周娟沈佳薇; 文献传递

复杂疾病致病机制研究中数据分析算法的开发与应用: 复杂疾病的致病不是由于单个基因位点的显性或隐性的遗传所引起的，遗传因素在复杂疾病的发展中起着重要的作用，且其病因由多种因素组成，包括常见变异以及基因-基因、基因-环境相互作用等。目前我们对于大多数复杂疾病的病因的了解仍然...; 沈佳薇; 关键词：复杂疾病致病机制单核苷酸多态性主成分分析; 文献传递

全基因组基因-基因相互作用研究现状被引量：8: 2011年; 复杂疾病目前正在全球范围流行,极大地影响人类的健康。研究发现,复杂疾病的性状受到多个位点的相互作用影响。目前的全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)仅仅解析单个SNP位点对疾病易感性的贡献,单纯依靠这一种策略并不能在寻找复杂疾病的病因上得到根本性的突破。基因-基因相互作用可能是复杂疾病致病的主要因素之一。针对这一点,科学家已经提出了一些检验基因相互作用的算法,包括惩罚logistic回归模型、多因子降维(Multifactor dimensional reduction)、集合关联法(Set-association approach)、贝叶斯网络(Bayesian networks)、随机森林法等。文章首先对目前这些方法做了综述,并指出了其中的不足,包括计算复杂度太高、假设驱动、数据会过度拟合、对低维数据不敏感等,进而简述了一种由笔者所在实验室开发的基于GPU的研究基因相互作用的算法,该算法复杂度低,不需要任何假设,没有边际效应,有很好的稳定性,速度快,适用于进行全基因组范围内的基因-基因相互作用计算。; 沈佳薇胡晓菡师咏勇; 关键词：复杂疾病 GPU 性状易感位点

一种辅助诊断待测胎儿是否为21-三体综合征患者的试剂盒: 本发明提供了一种辅助诊断待测胎儿是否为21‑三体综合征患者的试剂盒，包括核苷酸测序工具、samtools‑0.1.19软件、21‑三体综合征筛查程序和记载如下操作规程的载体：(1)取正常对照血样本以及待测血样本，测序；(...; 师咏勇沈佳薇温祖佳; 文献传递

一种辅助诊断待测胎儿是否为21-三体综合征患者的试剂盒: 本发明提供了一种辅助诊断待测胎儿是否为21-三体综合征患者的试剂盒，包括核苷酸测序工具、samtools-0.1.19软件、21-三体综合征筛查程序和记载如下操作规程的载体：(1)取正常对照血样本以及待测血样本，测序；(...; 师咏勇沈佳薇温祖佳; 文献传递

用于微量DNA超低频突变检测的双分子自校验文库制备及杂交捕获的二代测序方法: 本发明公开了用于微量DNA超低频突变检测的双分子自校验文库制备及杂交捕获的二代测序方法。该方法包括如下步骤：血浆游离DNA提取，DNA化学错误修复，自校验双分子识别码发夹型接头制备，血浆游离DNA修复，DNA与接头连接，...; 师咏勇周娟沈佳薇

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沈佳薇