刘冬冬
- 作品数:2 被引量:0H指数:0
- 供职机构:东北农业大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家教育部博士点基金教育部科学技术研究重点项目更多>>
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- 大豆Glyma08g02580及其同源蛋白的生物信息学分析
- 2014年
- WRKY蛋白是一个植物特有的转录因子,最古老的WRKY转录因子具有2个高度保守的WRKY结构域,大概起源于15亿-20亿年前的真核生物。虽然所有的WRKY蛋白质主要通过特异地结合靶基因启动子区域的W盒序列而调控其表达,但各家族成员的生物学功能存在着各自的特异性。通过生物信息学方法,结合大豆基因组数据库、高等植物基因组注释数据库和NCBI等相关数据库,识别、筛选并获得了大豆WRKY基因家族的蛋白序列,以实验室前期克隆得到大豆基因Glyma08g02580.1为目的基因,分析其在拟南芥、水稻等高等植物中的同源蛋白,并对其进行了系统进化分析;同时利用GEO的芯片数据对大豆在碱胁迫下的根和叶基因表达谱进行了分析,通过相关分析,获得了大豆基因组中全部的WRKY蛋白及对应的分类结果,由表达谱分析结果进一步证明了WRKY基因表达的组织特异性。
- 刘冬冬王洋柏锡
- 关键词:WRKY转录因子生物信息学系统进化分析基因表达谱
- 大豆GmWRKY20基因干涉及其表达研究
- 在拟南芥中的研究发现,野生大豆GsWRKY20过量表达能提高拟南芥的耐旱性和提前开花。然而,基因的异源表达可能会导致表型出现异常,并不能正确解读基因的功能。为进一步明确GsWRKY20基因的功能,需获得GsWRKY20基...
- 刘冬冬
- 关键词:大豆
- 文献传递