蔡振锋 作品数:7 被引量:27 H指数:3 供职机构: 遵义医学院 更多>> 发文基金: 贵州省优秀科技教育人才省长资金项目 贵州省中药现代化科技产业研究开发专项项目 更多>> 相关领域: 生物学 医药卫生 更多>>
千里光肌动蛋白基因(Actin)的生物信息学及功能分析 被引量:2 2012年 肌动蛋白(Actin)是广泛存在于高等植物中的组成型表达蛋白质,与细胞分裂、细胞运动、细胞信号转导等功能密切相关。为明确肌动蛋白性质与功能的关系,本研究从千里光全长cDNA文库中分离得到Actin基因。序列分析结果表明:该基因长度为1 481 bp,编码360个氨基酸残基的多肽,与甘草Actin基因编码的氨基酸序列(GenBank登录号:ABW71681.1)的同源性最高,达96%;预测蛋白质的分子量为40.02 kDa,理论等电点为5.85;结构分析发现,螺旋结构和无规则卷曲构成Actin二级结构的主要组分;三级结构预测发现,Actin具有4个结构域;蛋白系统发生树发现,与甘草和鹰嘴豆的亲缘关系较近。本研究认为,高等植物Actin可能参与基因的转录调控,其氨基酸突变位点未对功能结构域产生影响。 张珍 平军娇 蔡振锋 汤贤春 钱刚关键词:千里光 ACTIN基因 金钗石斛种子萌发率提高及可诱导愈伤组织培养基的研究 被引量:4 2014年 目的提高金钗石斛种子的萌发率,探索诱导愈伤组织的培养基。方法以金钗石斛种子为材料,研究其种子的萌发和愈伤组织的诱导条件。结果金钗石斛种子在MS+土豆块10 g/L+琼脂7 g/L+蔗糖30 g/L的培养基中萌发最快,时间为9 d,萌发率最高达92.5%;培养基(MS+0.2 g/L碳颗粒+琼脂7 g/L+蔗糖30 g/L)能够诱导金钗石斛原球茎形成愈伤组织。结论在MS培养基中单独添加土豆时能提高金钗石斛成熟种子的萌发率;碳粉能有效促进金钗石斛愈伤组织的形成。 徐德林 蔡振锋 张林 储士润 祝飞 钱刚关键词:金钗石斛 种子萌发率 愈伤组织 一种赤水金钗石斛原生质体分离、纯化方法及专用试剂 一种赤水金钗石斛原生质体分离、纯化方法及专用试剂。包括试剂A和试剂B。试剂A由MES、KCl、Mannitol、Cellulase R10、Pectolyase Y‑23、BSA、CaCl<Sub>2</Sub>和ddH... 徐德林 钱刚 蔡振锋 杨璐萍 张林 储士润文献传递 千里光热激蛋白90-3(Hsp90-3)的生物信息学与功能分析 被引量:2 2012年 Hsp90是真核细胞重要的一类分子伴侣,与植物的生长发育、抗逆性、信号转导及生物进化等功能密切相关。为了深入理解高等植物Hsp90结构与功能的关系,该研究从千里光(Senecio scandens)全长cDNA文库中分离到Hsp90-3基因。序列分析结果表明,该基因编码699个氨基酸的多肽,与拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtHsp90-3(登录号:NP_200412.1)的同源性最高,为93.71%;预测蛋白质的分子量为79.78 kD,理论等电点为5.08。信号序列分析结果发现,该蛋白主要定位于细胞的细胞核、过氧化物酶体、叶绿体类囊体膜及叶绿体基质中,提示作为分子伴侣,高等植物Hsp90-3参与细胞内膜系统蛋白质的转运。结构与功能分析发现,该蛋白有3个结构域及1个连接区,推测Hsp90-3在真核细胞的信号转导、转录调控及胁迫表达等过程中发挥重要功能。 平军娇 张珍 蔡振锋 汤贤春 钱刚关键词:千里光 千里光泛素(Ubiquitin)基因生物信息学与功能分析 被引量:3 2012年 为阐明泛素(Ubiquitin)在高等植物中结构与功能的关系,从千里光全长cDNA文库中分离到泛素基因,采用生物信息学方法对其进行系统分析。碱基序列和系统进化树结果显示,千里光泛素基因与果子蔓泛素基因的核苷酸序列(GenBank登录号:GQ890686.1)的同源性最高(87%);尽管碱基位点出现较大的变异,但高度保守氨基酸序列结果提示,泛素的保守位点对维持蛋白质结构和功能发挥关键作用;蛋白质的理化性质、三维结构预测与亚细胞定位结果表明,作为辅酶,泛素主要参与高等植物细胞的信号转导、转录调控和物质转运等功能。 蔡振锋 平军娇 张珍 汤贤春 白威峰 钱刚关键词:千里光 泛素基因 一种赤水金钗石斛原生质体分离、纯化方法及专用试剂 一种赤水金钗石斛原生质体分离、纯化方法及专用试剂。包括试剂A和试剂B。试剂A由MES、KCl、Mannitol、CellulaseR10、PectolyaseY-23、BSA、CaCl<Sub>2</Sub>和ddH<S... 徐德林 钱刚 蔡振锋 杨璐萍 张林 储士润文献传递 千里光全长cDNA文库的构建及分析 被引量:16 2012年 目的构建千里光全长cDNA文库,以期研究千里光的功能基因组学信息,为克隆药理学性状相关的功能基因提供数据资源。方法 Trizol法提取千里光叶片总RNA,通过SMART(switching mechanism at 5’end of RNA transcript)构建全长cDNA文库,随机挑取600个单克隆测序分析文库滴度、全长率及冗余率,得到的EST序列进行Blast分析(NR、NT、Swiss-Prot、KEGG)及COG功能分类。结果文库的库容为4.3×106cfu/mL,插入片段大小平均1.7 kb,文库重组率96.35%,全长率58.24%,冗余率10.88%;获得524条全长EST序列,含有467条独立基因(unigenes),其中5条序列与千里光次生代谢产物的合成、运输与代谢有关。结论经检测,SMART技术成功构建了千里光全长cDNA文库,该文库可用于千里光功能基因组鉴定、新基因筛选及次生代谢产物生物合成的表达调控研究。 平军娇 张珍 蔡振锋 汤贤春 钱刚关键词:千里光 全长CDNA文库 SMART EST 基因组学