谢冬
- 作品数:4 被引量:0H指数:0
- 供职机构:大连理工大学计算机科学与技术学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术更多>>
- 生物医学文献蛋白质关系抽取——从实体识别到网络构建
- 本文介绍了一个从实体识别到PPI网络构建的生物医学文献蛋白质关系抽取系统。该系统采用特征耦合泛化策略进行蛋白质实体识别;采用基于扩展语义相似度的方法进行蛋白质名均一化;融合了基于特征的核、树核以及图核进行蛋白质关系抽取;...
- 杨志豪赵哲焕李彦鹏胡运翠谢冬林鸿飞
- 关键词:文本挖掘信息抽取蛋白质关系抽取支撑向量机多核学习
- 文献传递
- 蛋白质关系网络复合物发现与可视化研究
- 随着生物学科技的不断发展,大量的蛋白质相互作用关系被发现。这些蛋白质关系构成的蛋白质关系网络为生物学家研究蛋白质的功能以及发现蛋白质复合物提供了数据来源。蛋白质复合物是由一组功能相近、关系密切的蛋白质构成的,因此在蛋白质...
- 谢冬
- 关键词:蛋白质复合物
- 文献传递
- 蛋白质关系网络可视化系统的研究与实现
- 2011年
- 蛋白质关系网络的研究在生物医学领域中已成为一个热点。研究者通过对蛋白质关系网络进行分析和聚类,能够发现其中的复合体,进一步理解细胞组织原理。在对关系网络进行分析的过程中,将网络拓扑显示为图形,以直观地表示出关系网络的结构,便于对比聚类方法,辅助关系网络的研究。利用网络建模与可视化工具包JUNG设计并实现了一个蛋白质关系网络可视化系统,它能够解析多种格式的蛋白质关系网络数据,集成了几种有效的图聚类算法,并实现了一种基于蛋白质功能标注的发现复合体的聚类算法。用户能够通过二维网络视图方便地观察原始网络和聚类后的结果。
- 王健谢冬杨志豪林鸿飞
- 关键词:网络可视化
- 蛋白质关系网络可视化系统的研究与实现
- 质关系网络的研究在生物医学领域中已成为一个热点.研究者通过对蛋白质关系网络进行分析和聚类,能够发现其中的复合体,进一步理解细胞组织原理.在对关系网络进行分析的过程中,将网络拓扑显示为图形,能够直观地表示出关系网络的结构,...
- 王健谢冬杨志豪林鸿飞