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徐俊: 作品数：30 被引量：123H指数：6; 供职机构：上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室更多>>; 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划更多>>; 相关领域：生物学天文地球医药卫生水利工程更多>>

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基于流场、声源场、声场精细分析的水动力声学研究: 水动力噪声是由不定常、不均匀水流场引起的水中传播的声压脉动，由流体流动过程中的相互作用和流体与固体边界的相互作用而产生。水动力噪声是舰船等水中航行体的水下辐射噪声和自噪声的主要来源之一。降低水动力噪声对水域声学环境保护，...; 徐俊

康氏菌科海洋细菌的系统发育与代谢潜能研究进展: 2021年; 康氏菌科(Kangillaceae)是海洋螺杆菌目(Oceanosprillales)下的科级分类单元,包含康氏菌属(Kangiella)、异康氏菌属(Aliikangiella)和Pleionea三个属。在康氏菌属高度精简的基因组中存在异常丰富的胞外蛋白酶编码基因,暗示此类海洋细菌对海洋颗粒有机物中的蛋白质成分降解具有重要贡献。鉴于已分离鉴定的康氏菌属模式菌株专一性利用蛋白类营养物质,我们建议将该属译为"食朊菌属"。本文将结合本实验室的研究进展,对康氏菌科细菌的分离培养过程、系统发育关系、代谢特点和潜在生态功能进行综述,为研究此类海洋细菌的生理生态功能提供思路。; 王佳华弋伊徐俊; 关键词：胞外蛋白酶海洋细菌

南海北部陆坡真光层海水中古菌的多样性被引量：2: 2017年; 选取中国南海北部陆坡真光层水柱中3个不同深度海水样本,采用荧光实时定量PCR技术、16S rRNA基因克隆文库方法以及系统发育分析,对近表层(SCS-S,水深30 m)、叶绿素最大层(SCS-M,水深65 m)、真光层和暮光层分界点(SCS-B,水深200 m)水层中古菌的多样性组成进行调查.结果表明,3个水层中的古菌16S r RNA基因拷贝数的数量关系为SCS-M层>SCS-B层>SCS-S层,分别为(4.49±0.01)×10~5、(3.37±0.02)×10~4、(9.70±0.10)×10~3copies/L.3个水层中的古菌由广古菌门(Euryarchaeota)和奇古菌门(Thaumarchaeota)两个门构成.在30 m水层和65 m水层中,广古菌门的古菌占大多数;在200 m水层,奇古菌门约占85%.30 m和65 m水层中的广古菌门以Marine GroupⅡ为主,200 m水层中的奇古菌门以Marine GroupⅠ为主.南海北部陆坡真光层海水中不同深度古菌的丰度相差较大,群落组成略有差异,这种差异可能是由深度不同所引起的.其中比例较高的奇古菌门Marine GroupⅠ类群多为氨氧化古菌,可能参与南海中的氮循环.丰度较高的广古菌门Marine GroupⅡ则在系统发育树中表现出和Thermoplasmata有较近的亲缘关系.本研究以南海北部陆坡真光层水柱中16S rRNA基因的丰度及其系统发育关系确定其中古菌的多样性,可为进一步评估古菌参与该海区真光层中碳氮元素循环的作用提供基础数据.; 谢丽飒徐蕾何莹张宇王佳华徐俊; 关键词：真光层 RRNA基因古菌多样性氨氧化古菌

抗性基因报告系统辅助选育厦门霉素A高产菌株: 2022年; 【背景】厦门霉素A是厦门链霉菌(Streptomyces xiamenensis)318菌株的主要次级代谢产物,具有显著的抗纤维化活性及药用潜力。但野生型菌株中厦门霉素A的产量仅有14 mg/L,其生产水平亟待提升。【目的】通过随机诱变-抗性标记筛选获得高产菌株并进行培养基优化,以提高厦门霉素A的产量。【方法】在厦门霉素A的生物合成基因簇后融合一个抗性基因,用于报告整个基因簇的表达水平。对构建的基因工程菌株进行常压室温等离子体(atmospheric and room temperature plasma,ARTP)诱变,从抗性水平高的突变菌株中筛选高产菌株,并通过培养基优化,使厦门霉素A产量显著提升。【结果】构建携带卡那霉素抗性标记的产厦门霉素A的工程菌MT-XN作为出发菌株,对该菌株进行一轮ARTP诱变,使用90 mg/L卡那霉素筛选,得到了厦门霉素A产量为101.7 mg/L的突变菌株MA-8。进一步通过响应面法优化培养基配方,在最佳培养基中MA-8菌株产生的厦门霉素A达到134.2 mg/L,较野生型菌株提高了845.1%。【结论】采用随机诱变-报告基因筛选系统,可快速筛选出厦门霉素A产量大幅提升的高产菌株,为后续的药物开发奠定良好的基础。; 李嘉欣步绪亮张贵振江向海徐俊徐岷涓; 关键词：响应面法优化抗纤维化

海洋放线菌多样性及其生物活性物质的研究: 海洋是生命的摇篮,也孕育了地球上80％的物种;海洋占整个地球面积的3/4;广袤的大洋里不仅蕴藏着丰富的物质资源,还有蕴藏着可持续利用的独特生物资源。我国海岸线绵长,跨越热带、亚热带到温带的辽阔海域。红树林是热带或亚热带海...; 徐俊; 关键词：海洋放线菌生物活性微生物资源红树林生物合成基因

基于数值模拟的孔腔水动噪声机理及其控制研究被引量：8: 2014年; 孔腔水动噪声是水下航行体的主要噪声源之一。该文基于计算流体动力声学(CHA)的多步骤混合方法,对方形孔腔周围涡流场及其等效声源场和声场做了精细数值模拟和分析。文章对孔腔流动噪声源进行了细致空间定位,从而把孔腔流动声源区划分成对应不同发生机理的子区域;然后分别计算了各子声源区对声辐射的贡献,从而区分真假、主次声源;最后针对主要声源的发生机理提出了腔内加隔板的降噪方案。文中的流场计算采用CFD软件FLUENT和大涡模拟(LES)方法,声源场和声场计算采用声学软件ACTRAN,相关数值模拟方法和手段用经典实验数据进行了对比验证。该文所提出的孔腔内加隔板的降噪方案,由数值模拟可知其有显著降噪效果。; 徐俊唐科范张旭; 关键词：大涡模拟降噪

生命的本质和特例--“极端微生物专刊”序言: 2017年; 所谓极端微生物（extremophile）是站在人类的角度,对栖居于地球上所有＂非宜居＂空间中的微生物的统称。这些微生物包括嗜热、嗜冷、嗜酸、嗜碱、嗜盐、嗜压,以及仍然有待发现的其他嗜＂极＂微生物。沧海桑田,大千世界,微生物一直在地球和生命的协同演化过程中扮演着重要角色。; 徐俊; 关键词：极端微生物地球深部深部探测微生物资源热泉嗜盐菌

海洋共附生微生物天然产物生物合成基因研究进展被引量：9: 2008年; 对海洋无脊椎动物天然产物的研究表明,很多种活性物质的真正生产者是与其共生或附生的未培养微生物。克隆这些未培养微生物中特定活性物质的生物合成基因,不仅为活性物质的来源提供遗传学证据,也使通过异源表达相关生物合成基因来大量获取目标化合物成为可能。本文综述了来源于海绵、海鞘、苔藓虫、深海管状蠕虫和深海沉积物中共附生微生物天然产物生物合成基因簇的研究进展。; 许静徐俊; 关键词：生物合成基因簇宏基因组文库

恩拉霉素新产生菌及其高产突变株: 本发明涉及一种恩拉霉素新产生菌及其高产突变株。本发明利用针对肽类抗生素合成基因保守区域设计的引物筛选海洋环境分离得到的链霉菌，通过同源性比对获得肽类抗生素恩拉霉素的新产生菌。本发明还利用核糖体工程技术选育出恩拉霉素产量提...; 徐俊肖静马光辉

超嗜热古菌整合性遗传元件的研究进展: 2017年; 细菌中整合性遗传元件与DNA修饰和防御、毒力因子传播以及次级代谢等生理功能存在关联,而相关研究在超嗜热古菌中尚处于起步阶段。本文综述了超嗜热古菌中整合性病毒、质粒及基因组岛等整合性遗传元件的分类、整合及维持机制。展示了整合性遗传元件参与的水平基因转移过程在超嗜热古菌基因组演化中扮演的重要角色。整合性遗传元件相关功能基因组学研究为理解超嗜热古菌的多样性及其环境适应性机制提供了新的视角。; 李臻宋庆浩徐俊; 关键词：超嗜热古菌基因组进化环境适应

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