康文斌 作品数:14 被引量:5 H指数:1 供职机构: 湖北医药学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 湖北省教育厅科学技术研究项目 国家级大学生创新创业训练计划 更多>> 相关领域: 生物学 文化科学 医药卫生 理学 更多>>
不同pH条件下基质蛋白二聚体稳定性的分子动力学模拟 2024年 位于甲型流感病毒包膜下的基质蛋白M1(Matrix protein 1,M1),可以与病毒包膜上的血凝素、神经氨酸酶和病毒遗传物质发生相互作用,在病毒生命周期的许多阶段起着关键作用。在病毒进入宿主细胞和出芽的过程中,M1多聚体的稳定性受到细胞环境的严格调控。因此,揭示基质蛋白寡聚体的热力学特征及其稳定性的主要贡献因素,对于设计以基质蛋白为靶向的抗流感药物具有重要意义。本文基于流感病毒在进入宿主细胞过程中所经历的环境条件,通过标准分子动力学、拉伸模拟和伞形采样模拟,研究不同pH条件下M1二聚体的热力学性质及其稳定性。结果表明,酸性环境对M1二聚体的热力学稳定性和解离过程有显著影响,二聚体接触面上酸性残基的质子化能够降低其结合能。这些发现揭示了流感病毒在感染过程中环境因素对基质蛋白组装调控的分子机制。 和二斌 赵炳炎 张文杰 康文斌 马庆修关键词:流感病毒 基质蛋白 PH 分子动力学 医药类高等院校生物物理课程建设的思考 2014年 医用生物物理学是研究生命物质的物理性质,生命过程的物理和物理化学规律以及物理因素对生物系统作用机制的科学,是物理学和生物学相结合而产生的一门边缘学科。在促进物理学和生命科学进步方面都显现出强大的生命力和推动力。基于医用生物物理学发展和我校学科建设发展的现实需要,本文讨论了我校建设医用生物物理学必修课或者选修课的必要性,并从本课程和学校学生特点两个方面考虑,对该课程建设的内容进行了初步的整合。旨在对教学内容进行整合、优化,增加一些新概念、新知识及前沿动态,把新旧知识联系到了一起,教会学生如何应用基础知识解决问题的方法以及缓解目前学时少、内容多这一矛盾。 康文斌 张鹏程 郭佳 朱本超 王建国关键词:生物物理 课程建设 医学院校 用Mathematica研究生物膜泡形状 究ADE模型下生物膜泡的形状,通过数值解法中的打靶法,运用Mathematica软件进行编程。通过把ADE模型中的一些参数进行限制,得到了丰富的膜泡形状包括球形、椭球形等,并且获得新的形状。结果表明:由ADE模型的总能量... 康文斌 张劭光 李树玲 穆亚荣 于云虎关键词:MATHEMATICA 数值解法 小约化体积及黏附情况膜泡形状的研究 对磷脂双层膜泡的形状的研究,目前的研究重点已由闭合泡转到对开口泡的研究,由大的约化体积转到小约化体积的膜泡的研究,由自由膜泡转到对黏附情况下膜泡的研究,以及对膜泡形成的动力学过程的研究。 第一、二章首先介绍了生物膜的背景... 康文斌文献传递 超声波提取中草药动力学模型的探究 <正>1引言中草药的提取在我国有着久远的历史,但大多数都是以传统的提取方法,有许多不足之处。超声波提取与传统提取法比较,具有提取速度快,时间短,收率高,无需加热等优点,近年来已被许多中药分析过程选为供试样处理的手段。但是 于云虎 林书玉 张鹏利 康文斌 王亚龙 孙勤明文献传递 超声波提取中草药动力学模型的探究 中草药的提取在我国有着久远的历史,但大多数都是以传统的提取方法,有许多不足之处。超声波提取与传统提取法比较,具有提取速度快,时间短,收率高,无需加热等优点,近年来已被许多中药分析过程选为供试样处理的手段。本文将再次从Fi... 于云虎 林书玉 张鹏利 康文斌 王亚龙 孙勤明关键词:超声波提取 中草药 动力学模型 文献传递 SC模型小约化体积膜泡的形状方程的研究 2013年 目前还没有相关文献报道在自发曲率模型下探究小约化体积形状方程以及边界条件。本文应用标准的变分法,在自发曲率模型下推导了旋转轴对称情况下的小约化体积膜泡的形状方程以及讨论了相应的边界条件。我们相信数值求解该模型下的形状方程和边界条件依然会得到与实验上观察一致的膜泡。 康文斌 张劭光 张鹏程 王建国 罗红 吴静关键词:膜泡 变分法 小约化体积膜泡形状的研究 2012年 目的:研究ADE模型下小约化体积膜泡的形状。方法:应用数值计算方法中的打靶法,运用Mathematica 7.0软件进行编程。结果:在ADE模型下,计算得到了一系列小约化体积的膜泡的形状,解决了已往小约化体积区域内不存在稳定膜泡的问题。结论:研究表明,在ADE模型下通过适当的边界条件把黏附双层区域的接触势能考虑进去,数值计算结果与实验上的非常相似。 康文斌 张劭光 张鹏程 王建国 罗红 吴静关键词:膜泡 数值解法 内禀无序蛋白构象与带电氨基酸残基排布关系--以精氨酸和天冬氨酸组成的随机多肽为例 被引量:1 2018年 内禀无序蛋白的结构特征与其氨基酸序列有着密切的联系.其中一个核心问题是正负带电氨基酸残基的排列如何影响无序蛋白或者多肽的构象?为了回答这一问题,本研究以天冬氨酸和精氨酸两种带电残基组成的随机多肽为研究对象,利用全原子蒙特卡罗模拟和温度副本交换采样方法,研究了随机多肽的电荷排布与结构之间的定性关系.结果表明:正负带电残基在序列上混合均匀时,由于肽链内部的静电吸引和排斥相互抵消,肽链倾向于形成无规卷曲的构象;正负带电残基分离时,由于长程静电相互吸引,多肽倾向于形成类β-发卡的形状. 康文斌 康文斌 王骏关键词:构象 分子模拟 波形生物膜泡的数值法研究 2009年 磷脂双亲分子在水溶液中会形成各种各样形状的膜泡,实验显示,存在有一维的周期性柱面膜泡。扩展的Delaunay曲面是由Ou-Yang等首次给出的Helfrich变分问题的解析特解,与Delaunay曲面不同的是它所代表的曲面为非常数平均曲率曲面,其中之一为波形周期曲面。本文用数值计算的方法探讨了波形曲面形状,并与已知的解析解进行了比较。与球形拓扑不同的是,做数值计算时所采用的欧拉-拉格朗日方程中参数不取为零,加入周期性边界条件数值求解该方程,得到了与扩展的Delaunay曲面一致的波形曲面。目前我们还没有得到扩展的Delaunay曲面之外的周期波形形状。扩展的Delaunay曲面是否给出了非常数平均曲率的波形曲面的通解,仍然是需要进一步探讨的问题。然后根据形状方程和轴对称的微分方程绘出了自发曲率取不同数值时的二维波形图,并且得出结论:随着自发曲率的增加,参数的值逐渐减小,与解析法得到的结果一致。 李树玲 张劭光 王颖 康文斌关键词:波形 数值法