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IL1B rs1143623和EEF1A1P11-RPL7P9 rs10783050多态性影响中国汉族超重及肥胖2型糖尿病患者二甲双胍的降糖疗效: 目的:探索潜在的影响中国汉族超重及肥胖2型糖尿病患者二甲双胍降糖疗效的遗传因素.方法:我们进行了一项两阶段研究.在第一阶段,我们招募了84例接受二甲双胍联合格列本脲或消渴丸(中成药,每粒含0.25mg格列本脲)治疗3个月...; 肖笛张思敏李曦尹继业龚卫静周宏灏林旭韩学尧刘昭前; 关键词：二甲双胍降糖疗效 2型糖尿病

多种lncRNA可影响黑色素瘤的发生和发展被引量：4: 2017年; 目的:通过生物大数据挖掘,探讨长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)与黑色素瘤发生发展的关系。方法:从基因表达综合数据库中的黑色素瘤m RNA表达谱数据集GSE15605中提取出一些lncRNA的表达信息,并分析这些lncRNA与黑色素瘤的关联关系。结果:LINC01213,PGM5-AS1,LINC01133和LOC284578共4个lncRNA与黑色素瘤的发生和转移显著相关,其中LINC01213,LINC01133和LOC284578的表达可被BRAF基因突变影响,而PGM5-AS1的表达能被NRA S基因突变影响。利用这4个lncRNA的表达值构建的预测模型可较好地区分正常样本、初发黑色素瘤样本和转移性黑色素瘤样本。结论:Lnc RNA可能在黑色素瘤的发生和转移中起重要作用。; 颜晗谭丹谢攀刘昭前李曦; 关键词：黑色素瘤长链非编码RNA 基因表达数据提取

BCL3基因表达:一个新的胶质瘤预后预测因子被引量：3: 2017年; 目的研究B细胞淋巴瘤因子3(B-Cell CLL/Lymphoma 3,BCL3)基因表达与胶质瘤预后之间的关系。方法从公用数据库中国脑胶质瘤基因组图谱计划(Chinese Glioma Genome Atlas,CGGA)和癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中下载了包含BCL3基因表达和患者预后的胶质瘤数据集数据,采用Gene Spring GX 11.0软件进行归一化,使用Cox回归分析和Kaplan-Meier分析进行数据分析。结果在低级别胶质瘤(Low Grade Glioma,LGG)和胶质母细胞瘤(Glioblastoma,GBM)数据集中,BCL3基因的表达与胶质瘤患者的总生存期(Overall Survival,OS)和无病生存期(Disease-free Survival,DFS)均显著相关(P<0.05),在Batch1和Bactch2两个数据集中,BCL3基因表达与胶质瘤患者的OS也均显著相关(P<0.05)。以BCL3表达水平中位数为界,将各数据集分为BCL3高表达组和低表达组,分析发现BCL3高表达组的死亡风险均显著高于低表达组,而GBM数据集中BCL3高表达组的肿瘤复发风险显著高于低表达组。结论 BCL3基因表达与胶质瘤的预后显著相关,且BCL3基因的高表达预示着较差的预后。BCL3基因表达是一个新的胶质瘤预后预测因子。; 王莹李曦张隆伯伍军宋涛霍雷方加胜; 关键词：胶质瘤预后基因表达

IDH突变通过影响GNG基因表达而影响低级别脑胶质瘤患者预后被引量：2: 2016年; 脑胶质瘤是颅内最常见的肿瘤,治疗形势严峻,其治疗疗效和预后差异巨大。如何实现脑胶质瘤的个体化治疗,提高治疗成功率,是目前临床上亟待解决的问题。前期研究发现,IDH基因突变是预测低级别胶质瘤(LGG)预后的一个关键因子。IDH突变患者的预后要明显好于IDH野生型患者。然而,目前IDH突变影响LGG预后的具体机制仍不明了。通过对TCGA和GEO等公用数据库中LGG数据集的挖掘,我们发现IDH突变能够显著下调GNG基因的表达(RSEM 1247.50 vs 891.15,P=1.55×10-3)。而GNG基因则与LGG患者的总生存期和药物敏感性显著关联。GNG高表达的LGG患者的生存期要显著短于低表达的患者(P=1.73×10-4,HR=3.30)。而在LGG采用替莫唑胺治疗的疾病进展患者(PD)中,GNG的表达要显著高于非疾病进展患者(CR+PR+SD)(RSEM 1709.98 vs 1076.09,P=5.00×10-3)。进一步分析显示,IDH突变能够显著上调GNG基因启动子区域1甲基化位点的甲基化程度(Beta 0.64 vs0.78,P=4.50×10-5),而该甲基化位点的甲基化程度与GNG的m RNA表达呈负相关(P<1.00×10-6,r=-0.69)。这些结果表明IDH突变可能通过影响GNG基因启动子甲基化而影响其表达,进而改变LGG患者的化疗预后。目前,我们正进一步开展机制实验验证这一结果。本研究为阐明脑胶质瘤预后个体差异发生机制提供了一定的科学依据。; 谭丹颜晗庞凤梅谢攀尹继业刘昭前李曦; 关键词：低级别脑胶质瘤甲基化替莫唑胺

亚甲基四氢叶酸还原酶的rs1801133位点与肺部多发实性小结节显著相关: 2024年; 目的了解肺部多发实性小结节与肺癌易感基因单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP)的关系,探索肺部早期病变的风险标志物。方法2017年6月至2018年10月通过社区健康服务中心招募40~74岁深圳市常住居民入院接受肺部低剂量螺旋计算机断层扫描检查,选取有肺部多发性小结节人群为病例组(n=175),无肺部病灶者为对照组(n=187),分别检测14个与肺癌易感性相关的SNP,分析SNP在两组人群间的分布及其与肺部多发实性小结节的关联。结果基因分型结果显示,只有亚甲基四氢叶酸还原酶(methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR)基因的rs1801133位点在病例和对照组之间基因型频率分布存在显著差异(P=0.027),其中携带AA基因型人群比携带GG基因型的人群发生肺部多发实性小结节的风险低(OR=0.45,95%CI:0.23~0.57,P=0.017),且多发性小结节发生风险呈现递减趋势(P_(趋势)=0.008);此外,显性模型分析结果表明,携带AA+AG基因型的人群比携带GG基因型的人群发生肺部多发实性小结节的风险低(OR=0.59,95%CI:0.39~0.90,P=0.014)。结论MTHFR基因rs1801133位点与肺部多发实性小结节显著相关。; 莫俊銮刘晋洪雷林郑可欣戴娟秀尹继业刘昭前李曦梁雄顺洪文旭; 关键词：肺结节亚甲基四氢叶酸还原酶

基因导向的华法林个体化用药预测模型的研究进展被引量：5: 2015年; 华法林是临床上最常用的口服抗凝药,其治疗窗窄、个体差异大,因此极易发生不良反应。构建基因导向的华法林个体化用预测模型被认为是实现华法林个体化用药、降低其不良反应发生风险的一种可行的方法。然而,目前不管是模型建立的方法还是模型的临床意义均存在广泛争议。本文综述了国际上用于建立华法林个体化用药预测模型的两类方法,对比了它们的优缺点;探讨了预测模型临床意义存在争议的原因及可能的解决方案。希望能为今后针对华法林的药物基因组学研究提供新的思路。; 谭丹颜晗罗芝英刘荣张伟刘昭前刘昭前; 关键词：华法林个体化治疗

IDH突变通过影响GNG基因表达而影响低级别脑胶质瘤患者预后: 脑胶质瘤是颅内最常见的肿瘤,治疗形势严峻,其治疗疗效和预后差异巨大.如何实现脑胶质瘤的个体化治疗,提高治疗成功率,是目前临床上亟待解决的问题.前期研究发现,IDH基因突变是预测低级别胶质瘤(LGG)预后的一个关键因子.I...; 谭丹颜晗庞凤梅谢攀尹继业刘昭前李曦; 关键词：低级别脑胶质瘤甲基化替莫唑胺

一项两阶段临床研究发现PRKAG2基因变异影响中国汉族2型糖尿病患者二甲双胍的降糖疗效: 肖笛尹继业李曦刘昭前

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李曦

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