刘颖
- 作品数：13 被引量：42H指数：4
- 供职机构：北京市房山区疾病预防控制中心更多>>
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- 2015年北京市房山区乙型Yamagata系流感病毒HA基因特性分析被引量：1
- 2017年
- 目的了解北京市房山区2015年乙型Yamagata系流感病毒HA1基因变异情况。方法选取2015年流感病原学监测中分离到的乙型Yamaga／a系毒株共13株，采用RT-PCR法扩增病毒HA基因片段后进行序列测定，与WHO推荐的疫苗株进行比对并构建进化树。采用MEGA6软件对测序结果进行分析。结果2015年房山区乙型Yamagata系流感病毒HA1基因片段序列测定拼接后核苷酸长度为1059bp，编码氨基酸为353个，与2014—2015年的疫苗株B／Massachusetts／02／2012比较，13株毒株的氨基酸均在第123、131、165、180、187、196、211、217、244、313、327位点有变异；与2012-2013年的疫苗株B／Wiseonsin／01／2010比较，13株毒株的氨基酸在第187、313、327均有变异。做进化树分析，房山区2015年分离到的乙型Yamagata系流感病毒与疫苗株B／Wiseonsin/1／2010在同一个分支上，距离较近，与B／Massachusctts／2／2012不在一个分支上，距离较远。结论2015年北京市房山区乙型Yamagata系流感病毒HA1基因在抗原决定簇区已发生变异，但疫苗株B／Wiseonsin/01／2010有保护作用，应继续关注氨基酸的替换。
- 阚震刘海波刘颖史文凤黄少平
- 关键词：乙型流感病毒HA1基因进化树
- 2014—2015年北京市房山区H3N2亚型流感病毒基因特性
- 2017年
- 目的了解北京市房山区2014—2015年H3N2亚型流感病毒HA1基因变异情况。方法随机分别选择2014—2015年流感病原学监测中分离到的H3N2型毒株共26株,采用RT-PCR法扩增病毒目的基因片段后进行序列测定,与WHO推荐的北半球疫苗株及常见H3N2毒株进行比对并构建进化树。采用MEGA6软件对测序结果进行分析,同源性计算使用BLAST网站,利用NetNGlyc 1.0软件进行糖基化位点预测。结果 2014—2015年房山区H3N2亚型流感病毒HA1目的基因片段序列测定拼接后最长核苷酸片段为703 bp最短核苷酸片段为696 bp,没有核苷酸的丢失,编码氨基酸为232-234个;抗原表位A抗原表位和D抗原表位有变异;受体结合位点第228位由丙氨酸变为丝氨酸,第130位由丝氨酸变为苏氨酸;做进化树分析,发现该分析中的H3N2亚型流感病毒位于2个分支上,分别为A/Switzerland/9 715 293/2013和A/HongKong/5 738/2014,大部分与前者在一个分支。结论北京市房山区2014—2015年H3N2流感病毒的血凝素重链区HA1基因特性有部分变化,抗原表位A抗原表位和D抗原表位有变异,且在基因进化上与当年的疫苗株分属不同分支,具有一定的进化距离,相似度较低,可能导致H3N2流行。
- 刘海波刘颖史文凤黄少平阚震王云霞
- 关键词：基因测序进化树
- 北京市房山区腹泻病例分离副溶血性弧菌的分子流行病学特征被引量：8
- 2018年
- 目的了解2016年北京市房山区腹泻病例副溶血性弧菌分离株的血清型、毒力基因、耐药性及PFGE分子分型特征。方法依照GB 4789.7-2013《食品安全国家标准食品微生物学检验副容血性弧菌检验》进行副溶血性弧菌生化鉴定,使用玻片血清凝集法进行血清分型,实时荧光聚合酶链式反应(PCR)测定毒力基因,微量肉汤稀释法进行药敏试验,脉冲场凝胶电泳进行分子分型及聚类分析。结果在检出的20株副溶血性弧菌中,O3:K6血清型占60%。所有菌株均携带tlh、tdh基因,trh基因的携带率为10%,tdh^+trh^-为优势基因型。抗生素敏感性结果显示,90%的菌株对至少1种抗生素耐药,其中多重耐药菌株5株。耐药率高的前3种抗生素分别是:头孢唑林(85%)、庆大霉素(75%)、氨苄西林(30%)。PFGE分型共得到10种带型,5株菌的PFGE带型一致,为优势带型。副溶血弧菌的血清型和PFGE带型之间具有高度的一致性。结论本地区副溶血性弧菌以tdh^+,trh^-的O3:K6型别为主,对头孢唑林、庆大霉素、氨苄西林等早期用药耐药率高,应慎重使用。
- 王云霞刘颖刘海波张晓嫒史文凤
- 关键词：副溶血性弧菌毒力基因耐药分析脉冲场凝胶电泳
- 北京市房山区腹泻患者空肠弯曲菌感染及菌株分型耐药特征被引量：6
- 2019年
- 目的了解北京市房山区感染性腹泻患者空肠弯曲菌感染及分离株的病原学特征。方法2017年5—12月,收集2家医院腹泻患者的粪便标本,进行弯曲菌的分离、培养及鉴定。对分离的空肠弯曲菌进行11种抗生素的敏感性检测,并对菌株进行多位点序列分型。结果共检测标本286份,分离到弯曲菌31份,检出率为10.80%;经质谱鉴定28株为空肠弯曲菌,3株为结肠弯曲菌。空肠弯曲菌可分为23种不同的ST型,其中4株为ST22,2株为ST760,2株为ST6500,其他20株分别属于20种ST型别;研究发现3个新的ST型,分别为ST9253、ST9254和ST9255。28株空肠弯曲菌对萘啶酸、环丙沙星、四环素的耐药率达100.00%,对氟苯尼考的耐药率为39.29%,对红霉素、阿奇霉素、泰利霉素、克林霉素敏感。结论北京市房山区腹泻患者空肠弯曲菌感染率较高,对喹诺酮、氟喹诺酮类、四环素类药物耐药严重,对大环内酯类、酮内酯类和林可酰胺类药物敏感;菌株的ST型呈多样性分布。
- 刘海波刘颖王云霞张晓嫒史文凤
- 关键词：空肠弯曲菌腹泻抗生素敏感性多位点序列分型
- 1起农村自备井水源诺如病毒污染的调查
- 2025年
- 目的对北京市房山区某村发生的1起腹泻疫情进行流行病学调查,查明病因并采取有效的应对措施,及时阻断疫情扩散。方法采用描述性流行病学方法分析判断可疑传染源,对采集的样本进行实验室检测。结果通过流行病学调查,搜索到急性胃肠炎病例96例,症状主要为腹泻(70例,占72.92%)、腹痛(29例,占30.21%)、恶心(25例,占26.04%)、呕吐(38例,占39.58%),均出现呕吐或腹泻3次及以上;实验室初次检测10份肛拭子,9份诺如病毒Ⅱ型阳性,1件判定为混合感染;7份泵房环境涂抹均为阴性。第二次检测粪便样本6份,2份诺如病毒Ⅱ型阳性,1份为混合感染;涂抹样本9份,2份诺如病毒Ⅱ型阳性;水源样本5份,4份判定为混合感染。结论本次疫情是由于居民自备井水源受到诺如病毒污染而引发的腹泻疫情暴发。
- 王云霞董梅史文凤刘海波刘颖
- 关键词：腹泻疫情诺如病毒生活用水自备井
- 2016年北京市房山区B型Victoria系流感病毒基因特性分析
- 2017年
- 目的了解北京市房山区2016年B型Victoria系流感病毒HA1基因变异情况。方法随机选择2016年流感病原学监测中分离到的B型Victoria系毒株共13株,采用反转录PCR(RT-PCR)法扩增病毒目的基因片段后进行序列测定,与WHO推荐的疫苗株进行比对并构建进化树。采用MEGA6软件对测序结果进行分析,同源性计算使用BLAST网站。结果 2016年房山区B型Victoria系流感病毒HA1目的基因片段序列测定拼接后最长核苷酸片段为1 081 bp,编码氨基酸为360个,与2015—2016年的疫苗株B/Brisbane/60/2008比较,13株流行株的氨基酸在第132、144位点有变异,其他位点的氨基酸变异呈散在性;与2008—2009年的疫苗株B/Florida/4/2006比较,13株流行株的氨基酸部分位点的变异具有普遍性。做进化树分析,房山区2016年分离到的B型Victoria系流感病毒与疫苗株B/Brisbane/60/2008在同一个分支上,距离较近。结论 2016年北京市房山区B型Victoria系流感病毒HA1基因在抗原决定簇区有一定的变异,但疫苗株B/Brisbane/60/2008有保护作用,应继续关注氨基酸的替换。
- 史文凤刘海波刘颖黄少平阚震
- 关键词：乙型流感病毒HA1基因进化树
- 2018年北京市房山区弯曲菌监测结果及耐药性分析被引量：7
- 2020年
- 目的了解2018年北京市房山区哨点医院腹泻患者和生禽鸡的弯曲菌感染情况及药物敏感情况,为弯曲菌防治工作提供依据。方法2018年1-12月在北京市房山区2家哨点医院收集未用抗生素的腹泻患者粪便标本进行弯曲菌、沙门菌、副溶血弧菌、志贺菌、5种致泻性大肠埃希菌及轮状病毒和诺如病毒的分离培养和鉴定;对生禽鸡进行弯曲菌、沙门菌和单增李斯特菌的分离、培养、鉴定;对分离到的空肠弯曲菌开展药物敏感试验。结果收集395例腹泻患者的粪便标本,男性212例,女性183例,其中16~45岁患者占66.08%。其中病原菌阳性的患者160例,阳性率为40.51%,检出病原菌共176株。弯曲菌检出53株,阳性率为13.41%;致泻大肠菌检出34株,阳性率为8.61%;沙门菌检出20株,阳性率为5.06%;副溶血性弧菌检出20株,阳性率为5.06%;志贺菌检出0株,阳性率为0%;轮状病毒检出26株,阳性率为6.58%;诺如病毒检出23株,阳性率为5.82%。人粪便标本检出弯曲菌的病例中37名男性和16名女性感染比较,差异有统计学意义(17.45%vs8.74%,χ^2=6.413,P<0.05)。40只生禽鸡中,共31只检出病原菌(77.5%),检出病原菌36株,其中沙门菌13株,弯曲菌23株。人粪便标本和生禽鸡检出的空肠弯曲菌对萘啶酸、环丙沙星、四环素的耐药率均大于80%,生禽鸡中的空肠弯曲菌对氟苯尼考的耐药率为90%,而人粪便标本中的空肠弯曲菌对氟苯尼考的耐药率为53.33%;红霉素、阿奇霉素、泰利霉素、克林霉素、链霉素和庆大霉素的敏感性大于80%。结论北京市房山区腹泻患者弯曲菌感染率高,空肠弯曲菌对萘啶酸、环丙沙星和四环素耐药严重;腹泻患者病原菌种类多,在继续加强监测的同时开展宣传教育。
- 刘海波刘颖王云霞史文凤黄少平阚震
- 关键词：腹泻空肠弯曲菌耐药性
- 新冠肺炎疫情常态化下房山区腹泻病例肠道病原体感染情况分析
- 2023年
- 目的了解新冠肺炎疫情常态化防控背景下,北京市房山区腹泻病例肠道病原体的感染情况,为肠道传染病的防治工作提供依据。方法2021年1月1日至2021年12月31日,收集北京市房山区某2家二级医院未使用抗生素治疗的腹泻病例的粪便标本,进行志贺菌、沙门菌、副溶血性弧菌、大肠埃希菌、弯曲菌、轮状病毒、诺如病毒、星状病毒、扎如病毒和腺病毒的分离培养鉴定。结果392例腹泻病例,男性219例,女性173例,以青年为主。至少一项病原体阳性的腹泻病例84例,检出肠道病原菌89株,检出率为22.70%,弯曲菌35株,诺如病毒18株,致泻性大肠埃希菌14株,沙门菌10株,副溶血性弧菌4株,轮状病毒4株,扎如病毒2株,肠道腺病毒2株。病原体检出高峰为4~10月。其可疑暴露食品主要为熟食冷荤31例,水果蔬菜9例和凉拌菜8例;食用方式主要为直接食用43例;食用地点主要为居家53例。结论2021年新冠肺炎疫情常态化防控背景下,北京市房山区腹泻病例病原体检出率有所下降,种类多样,以弯曲菌为主,应继续监测并开展多形式的宣传教育,以提升当地居民的食品安全意识。
- 董梅刘海波王云霞史文凤刘颖张冬然郭新慧张晓嫒
- 关键词：弯曲菌致泻性大肠埃希菌副溶血弧菌诺如病毒星状病毒
- 2015～2018年北京市房山区食源性疾病病原学特征分析被引量：3
- 2019年
- 目的分析北京市房山区2015~2018年间食源性疾病监测数据,掌握房山区引起食源性患者腹泻病原菌及其流行病学特征。方法对2015~2018年1~12月哨点医院采集的腹泻患者标本进行病原菌分离、鉴定。结果1447件样本中,分离出病原菌362株,检出率为25.0%(362/1447);其中2015年副溶血性弧菌检出最多,检出率为6.47%(24/371);2016和2017年致泻性大肠杆菌检出较多,检出率分别为8.31%(30/361)和11.80%(44/373);2018年弯曲菌检出最多,检出率为14.62%(50/342);房山区食源性疾病主要集中在6~10月,峰值出现在8月。结论基本掌握了房山区食源性疾病的流行病学特征;未来仍要不断完善健全食源性疾病主动监测体系,持续关注细菌性食源性疾病。
- 王云霞史文凤刘海波刘颖
- 关键词：食源性疾病
- 基于PCR循环阈值的SARS-CoV-2奥密克戎变异株的实验室分析
- 2024年
- 目的分析新型冠状病毒感染人群的鼻拭子和咽拭子标本的循环阈(Ct)值,为流行病学调查和临床预测等提供一定的理论依据。方法对2022年4月1日至7月31日本实验室接收的SARS-CoV-2核酸阳性人群的鼻拭子和咽拭子标本,运用磁珠法进行核酸提取,用实时荧光定量PCR检测SARS-CoV-2核酸的ORF1ab基因和N基因两个靶标,分析两类标本中两个靶标的Ct值。Ct值差异用独立样本t检验,以P<0.05为差异有统计学意义。结果SARS-CoV-2核酸阳性标本401例,男性243例、女性158例(男女比例1.54∶1);SARS-CoV-2核酸阳性人员年龄分布为7个月~91岁,中位数为39岁;临床分型为普通型31例,轻型281例,无症状感染者89例。同时采鼻拭子和咽拭子的106例,两类标本ORF1ab基因(t=7.728,P<0.001)和N基因(t=7.504,P<0.001)Ct值差异均有统计学意义。在同一人不同时间送检鼻拭子或咽拭子的73例标本中,采样时间间隔≤48h的标本26例,两次Ct值差值的绝对值>2的标本占61.54%(16/26),末次Ct值≤30的标本占61.5%(16/26);采样时间间隔>48h的标本56件,两次Ct值差值的绝对值>2的标本占82.1%(46/56),末次Ct值>30的标本占98.2%(55/56)。结论SARS-CoV-2奥密克戎变异株感染者的临床分型以轻型为主;鼻拭子标本的病毒载量高于咽拭子;采样时间间隔≤48h的标本,若Ct值快速下降且末次Ct值≤30,大多为新发感染人员;若末次Ct值>30则大多为复阳人员。Ct值仅有一定的提示作用,对于COVID-19人群的临床情况预测、感染者当下状态及何时参与社会活动,要根据其临床情况连同实验室结果进行评估。
- 刘海波于海柱高舒王云霞刘颖史文凤赵耀潘阳
- 关键词：CT值咽拭子新型冠状病毒
