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周燕菊
作品数:
1
被引量:2
H指数:1
供职机构:
昆山市第一人民医院
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发文基金:
昆山市科技计划项目
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相关领域:
医药卫生
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合作作者
沙霞
昆山市第一人民医院
王建军
昆山市第一人民医院
孙王伟
昆山市第一人民医院
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作者
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孙王伟
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周燕菊
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沙霞
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海南医学
年份
1篇
2014
共
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PCR直接测序法在脓肿分枝杆菌鉴定中的应用
被引量:2
2014年
目的探讨聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)与DNA测序技术鉴定脓肿分枝杆菌的效果。方法利用细菌16S r RNA基因通用引物PCR扩增疑似分枝杆菌的16S r RNA基因的DNA片段并进行DNA测序分析。DNA测序获得序列经生物信息学比对分析获得相关分枝杆菌的信息;针对相关分枝杆菌分别设计非同源区域特异性引物对1 500 bp的克隆DNA片段扩增验证。结果细菌16S r RNA基因通用引物扩增获得约1 500 bp的DNA片段,但DNA测序仅获得其中部分DNA序列约296 bp;部分DNA序列经生物信息学比对分析后获得四种同源性高达98%的分枝杆菌信息,并且四种分枝杆菌的特异性引物对1 500 bp的克隆产物进行扩增后仅在脓肿分枝杆菌中获得特异性PCR产物。结论疑似结核患者体内的抗酸染色阳性菌为非结核分枝杆菌中的脓肿结核分枝杆菌,并且PCR直接测序法可快速鉴定细菌的种属。
孙王伟
周燕菊
谢怡萍
沙霞
王建军
关键词:
聚合酶链式反应
DNA测序
RRNA
生物信息学
脓肿分枝杆菌
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