孙丹 作品数:21 被引量:15 H指数:2 供职机构: 教育部 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 黑龙江省自然科学基金 上海市自然科学基金 更多>> 相关领域: 轻工技术与工程 生物学 农业科学 文化科学 更多>>
基于CRISPR/Cas9的小菜蛾ABCC3基因的敲除和应用 本发明公开了一种利用CRISPR/Cas9实现非模式生物小菜蛾ABCC3基因的敲除及其在Bt Cry1Ac杀虫蛋白抗性机制分子研究中的应用。本发明方法设计并合成小菜蛾ABCC3基因特异性sgRNA靶标序列,将sgRNA与... 郭兆将 孙丹 康师 郭乐 周君雷 龚莉君 覃舰莹 朱流红 白杨 罗亮 张友军文献传递 基于APN基因的小菜蛾对Bt杀虫蛋白Cry1Ac抗性的检测方法及其试剂盒 本发明公开了一种基于四个APN基因的小菜蛾对Bt杀虫蛋白Cry1Ac抗性的实时荧光定量PCR检测方法及其试剂盒,该试剂盒包含特异引物序列:正、反向引物如SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3所示;或如SEQ ID... 郭兆将 康师 周君雷 龚莉君 孙丹 覃舰莹 郭乐 朱流红 白杨 张竹竹 叶凡 张友军文献传递 基于ABCB1基因的小菜蛾对Bt杀虫蛋白Cry1Ac抗性的检测方法及其试剂盒 本发明公开了一种基于ABCB1基因的小菜蛾对Bt杀虫蛋白Cry1Ac抗性的实时荧光定量PCR检测方法及其试剂盒,所述试剂盒包含以下靶标基因特异引物序列:正向引物序列如SEQ ID NO.2所示,反向引物序列如SEQ ID... 郭兆将 周君雷 康师 覃舰莹 龚莉君 孙丹 郭乐 朱流红 白杨 罗亮 张友军文献传递 小菜蛾MAP4K4基因上游5′-侧翼序列克隆与结构分析 2018年 本实验室前期研究表明,小菜蛾通过有丝分裂原激活的蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号途径上游转录激活的关键基因MAP4K4反式调控多个中肠受体基因的表达,从而介导其对苏云金芽胞杆菌Bacillus thuringiensis(Bt)产生的Cry1Ac杀虫蛋白的高抗性。为进一步明确MAP4K4基因转录激活而过量表达的顺式调控机制,本文利用小菜蛾基因组数据库中MAP4K4基因序列信息,首先克隆了Bt Cry1Ac敏感小菜蛾种群MAP4K4基因上游5′-侧翼序列,得到了两种不同形式的5′-侧翼序列:MAP4K4-1和MAP4K4-2。随后,预测分析了其中的潜在功能顺式作用元件,同时发现其中核苷酸的转换会导致顺式作用元件的改变。本研究初步揭示了小菜蛾MAP4K4基因的5′-侧翼序列的遗传多样性,为后续明确MAP4K4的顺式调控机制奠定了基础。 郭乐 郭兆将 康师 孙丹 周君雷 龚莉君 张友军关键词:小菜蛾 MAPK信号途径 宏基因组学技术在水产动物病毒鉴定中的应用 被引量:2 2019年 近年来水产养殖生产中病毒性疾病的发生越来越严重,所以对水产动物病毒的深入研究成为水产研究者的一个重要课题。随着宏基因组学技术的不断发展,以及测序成本的快速下降,基于宏基因组学技术的水产动物病毒鉴定技术逐渐成为水产动物病毒鉴定的主要技术之一。本文总结了基于宏基因组学的水产动物病毒鉴定技术的主要方法,详细综述了鉴定技术的实现流程,评述了几种基于宏基因组学的水产动物病毒鉴定技术的优缺点,并对基于宏基因组学的水产动物病毒鉴定技术的未来发展方向进行了展望。 彭司华 江守文 江守文 孙丹 陈洁关键词:宏基因组学 病毒鉴定 基于CRISPR/Cas9的小菜蛾APN3a基因的敲除和应用 本发明公开了一种利用CRISPR/Cas9实现非模式生物小菜蛾APN3a基因的敲除及其在Bt Cry1Ac杀虫蛋白抗性分子机制研究中的应用。所述CRISPR/Cas9基因编辑系统主要包括:小菜蛾APN3a基因特异性sgR... 郭兆将 孙丹 康师 郭乐 周君雷 龚莉君 覃舰莹 朱流红 白杨 罗亮 张友军文献传递 基于APN基因的小菜蛾对Bt杀虫蛋白Cry1Ac抗性的检测方法及其试剂盒 本发明公开了一种基于四个APN基因的小菜蛾对Bt杀虫蛋白Cry1Ac抗性的实时荧光定量PCR检测方法及其试剂盒,该试剂盒包含特异引物序列:正、反向引物如SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3所示;或如SEQ ID... 郭兆将 康师 周君雷 龚莉君 孙丹 覃舰莹 郭乐 朱流红 白杨 张竹竹 叶凡 张友军基于ABCB1基因的小菜蛾对Bt杀虫蛋白Cry1Ac抗性的检测方法及其试剂盒 本发明公开了一种基于ABCB1基因的小菜蛾对Bt杀虫蛋白Cry1Ac抗性的实时荧光定量PCR检测方法及其试剂盒,所述试剂盒包含以下靶标基因特异引物序列:正向引物序列如SEQ ID NO.2所示,反向引物序列如SEQ ID... 郭兆将 周君雷 康师 覃舰莹 龚莉君 孙丹 郭乐 朱流红 白杨 罗亮 张友军通过宏基因组学发现生物催化剂 被引量:3 2019年 现在大多数化学合成使用对环境有害的有机溶剂.如果用酶作为生物催化剂,则可在化学合成反应中少使用或不使用有机溶剂,所以使用酶作为催化剂更环保.随着宏基因组学的发展,以及二代测序成本的持续大幅度下降,基于宏基因组学获得生物催化剂已经成为最重要的方法.本文综述基于宏基因组学发现生物催化剂的各种方法,对目前世界上采用的各种筛选方法进行归纳,共总结出两大类方法:一是基于宏基因组文库的筛选方法,另一种是基于序列的遗传筛选方法.进一步对这两类方法细分为具体的7种筛选方法,并对各种方法的优缺点逐一进行回顾和评述.同时,对各种基于宏基因组学筛选生物催化剂的方法得到的结果进行统计分析,指出表型选择法筛选是采用最多的方法,有很大的实用价值.认为直接二代测序进行生物信息学筛选的方法也是有潜力的一种筛选方法,三代测序技术将在基于宏基因组学的生物催化剂筛选中发挥重要作用.(图2表8参92) 彭司华 孙丹 袁文亮 孙丹关键词:宏基因组学 生物催化剂 微生物 植物Prohibitins基因(PHBs)的研究进展 被引量:2 2016年 Prohibitins(PHBs,抗增殖蛋白基因),又称抑制素基因。为了了解植物PHBs基因分类、结构与定位,从而进一步了解PHBs基因的功能。本研究从PHBs基因的分类与结构,PHB蛋白的结构与大小,亚细胞定位,以及从PHB蛋白控制植物的生长发育、与线粒体形成相关的功能,PHB蛋白与逆境相关的功能研究方面,对植物PHB,基因的研究进展进行简单的总结。从而得出植物PHBs基因不仅控制植物的生长发育,还是一类参与各种胁迫响应的重要基因。尽管国内外学者对PHB蛋白能提高生物对逆境的抗性等方面做了一些的工作,为抗性育种奠定了基础,但仍然有大量工作需要进一步开展。 夏梦 徐畅 王吉 王玲 孙丹关键词:线粒体 发育 逆境