宋凌峰
- 作品数：2 被引量：7H指数：1
- 供职机构：中国地质大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中德合作科研项目更多>>
- 相关领域：生物学天文地球更多>>
- 古DNA单链测序文库的建立与检测被引量：1
- 2017年
- 2005年问世的第二代测序技术在古DNA领域的应用,突破了第一代测序技术在绝灭或死亡生物全基因组获取手段上的局限。借助古基因组信息,研究者能够从更为系统的实时分子证据角度,解读诸如人类起源、大型绝灭哺乳动物迁移演化、动植物家养驯化以及早期人类社会生活模式等古生物学、遗传学与演化生物学问题。引入第二代测序技术之后,传统的古DNA研究方法及流程得以改变,剔除了原有的实验流程中耗时的分子克隆步骤,引入了与第二代测序技术紧密相关的古DNA单链测序文库构建环节。古DNA单链测序文库的构建,是将古DNA双链模板变性成单链后,通过向单链古DNA两端添加人工DNA片段,将古DNA分子转变成能被测序仪识别的文库分子。针对古DNA分子微量、高度片段化以及普遍存在碱基损伤的特点,古DNA单链测序文库,能够高效获取古DNA材料中的遗传信息。本文系统介绍古DNA单链测序文库建立流程,以及对文库质量进行检测的方法,为研究者运用第二代测序技术测定绝灭或死亡生物全基因组提供方法借鉴。
- 宋凌峰盛桂莲袁俊霞
- 关键词：古DNA
- 古DNA研究35年回顾与展望被引量：7
- 2016年
- 自1980年湖南医学院学者尝试从马王堆汉代古人类遗存获取核酸分子开始,古DNA研究至今已经历了35年时间.近年来,随着高通量测序技术平台的开发应用及对小片段古DNA分子捕获能力的加强,古DNA研究走出了单纯依靠线粒体基因组及少量核基因的时代,在全基因组测序方面取得重要突破,古基因组数据在人类起源、大型绝灭哺乳动物的迁移演化、动植物家养驯化过程及其对人类社会生活模式的启示、生物与环境的相互关系等诸多方面发挥了独特作用.本文以第二代测序技术问世之后古DNA研究流程为主线,系统回顾古DNA各阶段的进展以及近年来取得的突破,阐明古DNA数据的应用领域,并基于现有研究实例对古DNA将来可能的发展前景提出展望.
- 盛桂莲赖旭龙袁俊霞侯新东宋凌峰
- 关键词：古DNA高通量测序全基因组
