申媛媛
- 作品数：3 被引量：5H指数：2
- 供职机构：国家工程研究中心更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划上海市青年科技启明星计划更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- DNA序列分析对慢性萎缩性胃炎细胞因子基因多态性分布的研究被引量：2
- 2009年
- 目的:应用DNA测序方法精确分析几种胃癌易感性相关细胞因子基因单核苷酸多态性(single nucleotide polym orphisms,SNPs)在慢性萎缩性胃炎患者中的分布情况。方法:选择胃癌易感性相关基因SNPs位点,白细胞介素(IL)-1B、干扰素-γ(IFN-γ)、脂磷壁酸(LTA)、IL-8、IL-10、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)及巨噬细胞移动抑制因子7个基因上12个SNPs位点,设计、筛选引物。对49例慢性萎缩性胃炎患者的全血DNA,选定引物、PCR扩增,产物纯化后进行Sanger法测序检测IL-1B-31/-511位点SNPs,其中20例患者同样方法检测其余10个SNPs位点序列。结果:IL-1B-31/-511位点各等位基因的频率分别为54.1%、45.9%,各基因型百分率均为30.6%、46.9%、22.4%;其中20例患者其他10个位点各等位基因的平均频率分别为(65.3±26.0)%、(34.8±26.0)%,各基因型平均百分率分别为(49.5±33.0)%、(31.5±18.9)%、(19.0±20.9)%。结论:慢性萎缩性胃炎患者中携有多个胃癌易感性相关细胞因子基因SNPs,为进一步较为全面地研究胃癌易感性基因SNPs在胃癌发生中的分子机制提供基础。
- 王韶英吴彩云万源潘峰申媛媛盛海辉陈锡美郜恒骏
- 关键词：萎缩性多态性单核苷酸易感性
- 幽门螺杆菌耐药相关基因突变检测芯片的建立被引量：3
- 2011年
- 背景:幽门螺杆菌(H.pylori)感染与慢性胃炎、消化性溃疡、胃癌之间的相关性已得到确认。H.pyori对抗生素耐药是导致根除治疗失败的主要原因。目的:建立H.pylori耐药相关基因突变检测芯片,用于指导临床个体化治疗。方法:根据文献数据筛选出7个与根除治疗常用抗生素(克拉霉素、甲硝唑、阿莫西林、喹诺酮类、四环素、呋喃唑酮)耐药相关的基因及其单核苷酸多态性(SNP)位点,优化芯片探针设计和反应条件,采用多重PCR技术联合所建立的芯片,检测25例胃黏膜样本的H.pylori耐药相关基因突变情况。测序验证芯片检测结果。结果:25例H.pylori阳性胃黏膜样本的芯片检测结果均与测序结果相符。包括DNA抽提、多重PCR、芯片杂交、数据分析等在内的整个检测流程仅需6 h,且重复性和灵敏度十分理想。结论:H.pylori耐药相关基因突变检测芯片能快速、平行、高通量地检测H.pyori耐药相关突变位点,结果准确、可靠。
- 方静柴海娜徐磊郭一沈晓莹张小燕申媛媛李航盛海辉杨长青郜恒骏
- 关键词：抗药性突变微阵列分析
- 云南哈尼族彝族幽门螺杆菌感染人群胃癌易感基因研究
- 2009年
- 背景:胃癌的发生是生物、环境、宿主等因素共同作用的结果,宿主遗传因素与幽门螺杆菌(H.pylori)感染后的不同临床结局有关。目的:筛选云南红河州哈尼族彝族H.pylori感染人群的胃癌易感基因,探讨不同基因型和等位基因与H.pylori感染宿主胃癌发病风险的相关性。方法:通过PubMed、CNKI和HapMap数据筛选出12个中国人群胃癌易感相关单核苷酸多态性(SNP)位点,以芯片技术对哈尼族彝族H.pylori感染慢性胃炎和胃癌患者的这些SNP位点进行分型。结果:IL-1β-31C/T和IL-1β-511C/T位点存在完全连锁不平衡,其基因型(P=0.014)和等位基因频率(P=0.049)在胃癌和胃炎组中有显著差异,-511CT/-31CT(OR=2.256,95%CI:1.048～4.855)和-511TT/-31CC(OR=3.312,95%CI:1.462～7.502)基因型胃癌发病风险显著高于-511CC/-31TT基因型。COX-2-899C/G位点基因型频率在胃癌和胃炎组中有显著差异(P=0.033),GG基因型胃癌发病风险显著高于CG基因型(OR=2.796,95%CI:1.053～7.423)。TNF-α-238A/G位点基因型频率在胃癌和胃炎组中有显著差异(P=0.037),AA、AG基因型胃癌发病风险显著高于GG基因型(OR=2.600,95%CI:1.130～5.985)。结论:IL-1β-31C、IL-1β-511T等位基因和COX-2-899GG基因型可增高云南红河州哈尼族彝族H.pylori感染人群的胃癌发病风险,TNF-α-238GG基因型对上述人群的胃癌发生具有保护作用。
- 白建平郭一陈然申媛媛张鹏苏红春许金明彭旭光盛海辉张小燕郜恒骏
- 关键词：胃肿瘤疾病遗传易感性芯片分析技术
