郑文强
- 作品数:2 被引量:4H指数:2
- 供职机构:江西师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金江西省教育厅科学技术研究项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 杜仲愈伤组织中类胡萝卜素合成相关基因的表达分析被引量:2
- 2017年
- 通过对杜仲愈伤组织转录组高通量测序结果进行KEGG通路深入分析发现,强光(光强为12 000 Lx,16 h光照,8 h黑暗)培养杜仲愈伤组织18 d,黑暗培养作为对照,与类胡萝卜素合成相关的七种酶(九个基因)上调表达,七种酶分别为9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(EC 1.13.11.51,9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase),脱落酸8-羟化酶(EC 1.14.13.93,(+)-abscisic acid 8'-hydroxylase),紫黄质脱环氧化酶(EC 1.10.99.3,violaxanthin de-epoxidase),15-顺式-八氢番茄红素合成酶(EC 2.5.1.32,15-cis-phytoene synthase),番茄红素环化酶(Cru A),β-胡萝卜素羟化酶(Crt R-b),八氢番茄红素脱饱和酶(Crtl-e)。qRT-PCR分析表明,杜仲愈伤组织中与类胡萝卜素合成相关的九个基因的表达与其转录组高通量测序结果一致,均上调表达。由此推断,强光促进杜仲愈伤组织中类胡萝卜素的积累。本研究可以为获取高产类胡萝卜素资源和杜仲遗传分析提供有价值的资料。
- 张俊娥郑文强
- 关键词:愈伤组织类胡萝卜素实时荧光定量PCR
- 基于转录组高通量测序分析白光对杜仲愈伤组织中绿原酸含量的影响被引量:3
- 2015年
- 利用Illumina Hi SeqTM2500平台对光暗培养的杜仲愈伤组织进行了转录组高通量测序,利用BLAST软件进行差异表达基因的功能注释和富集分析,就白光(光强为12 000 lux,16 h光照,8 h黑暗)对杜仲愈伤组织中绿原酸含量的影响进行了研究.结果表明:通过Trinity软件合并组装后共获得62 030个Unigenes,通过BLASTX比对,共获得25 417(40.98%)个有注释信息的Unigenes.通过对KEGG通路进行深入分析表明,白光(光强为12 000 lux,16 h光照,8 h黑暗)培养杜仲愈伤组织18 d,与绿原酸合成相关的3种酶基因上调表达,它们分别为苯丙氨酸解氨酶(EC 4.3.1.24,phenylalanine ammonia-lyase,PAL)、肉桂酸-4-羟基化酶(EC 1.14.13.11,trans-cinnamate 4-monooxygenase,C4H)、奎宁酸羟基肉桂酰转移酶(EC 2.3.1.133,Shikimate o-hydroxyl-cinnamoyltransferase,HCT).由此推断,白光能促进杜仲愈伤组织中绿原酸的积累.研究结果为获取高产绿原酸资源和杜仲遗传分析提供有价值的资料.
- 张俊娥邓华锋郑文强江京金聪赵夫凯
- 关键词:愈伤组织白光绿原酸