王洪明 作品数:2 被引量:6 H指数:2 供职机构: 上海海洋大学食品学院 更多>> 发文基金: 上海市人才发展基金 国家自然科学基金 上海市科学技术委员会资助项目 更多>> 相关领域: 生物学 更多>>
海洋病毒荧光显微计数法的优化与应用 被引量:2 2014年 【目的】建立一种快速、稳定、可靠的海洋病毒计数方法。【方法】海水水样经福尔马林固定后,滤过孔径为0.02μm的Anodisc Al2O3膜。滤膜经SYBR Green I染色后,在相应波长的激发光下进行观察。借助荧光显微镜目镜网格尺,计数视野中的病毒颗粒,换算后获得样品中病毒的浓度。【结果】对具体实验方法进行了优化,可快速、稳定地对海水中的病毒计数。【结论】建立了一种适用于国内实验条件的、可靠的海洋病毒计数方法。 肖劲洲 孙国伟 王洪明 周竞烈 李柏林 潘迎捷 王永杰关键词:I 洋山深水港海域表层海水中古菌多样性特点 被引量:4 2014年 利用DGGE、定量PCR以及16S rRNA基因克隆文库技术对洋山深水港海域表层海水中的古菌多样性组成进行了调查和分析.通过Quantity One软件分析不同样品的DGGE图谱,发现洋山深水港3个不同海域(小洋山港口区、大洋山港口区、中间航道)的古菌群落多样性组成不存在明显的区别;利用定量PCR的方法对3个不同样品中的古菌16S rRNA基因拷贝进行计数,发现3个不同海域的古菌16S rRNA基因拷贝数的数量关系为:大洋山海域((1.69±0.19)×106 copies/mL)<中间航道((2.17±0.20)×106 copies/mL)<小洋山港口区((2.42±0.22)× 106 copies/mL),这说明洋山深水港3个不同海域的古菌群落组成是一致的,只是在数量上略有差异,为对该海域古菌的更深入调查研究提供了便利和数据基础.洋山深水港海域表层海水的古菌16S rRNA基因文库分析表明,古菌由三大门类组成:广古菌门(Euryarchaeota)、泉古菌门(Crenarchaeota)和奇古菌门(Thaumarchaeota).广古菌门所占比例约为26.8%,泉古菌门约为33.0%,奇古菌门约为40.2%.广古菌门含有2个类群,分别是Mathanobacteriales(10.3%)和Marine Group Ⅱ(16.5%);泉古菌门含有1个类群,为Unidentified Crenarchaeotic Group(33.0%);奇古菌门含有1个类群,为Marine Group Ⅰ (40.2%).结果显示,Mathanobacteriales类群和Marine Group Ⅱ类群的比例失调,这可能预示着洋山深水港海域存在油污污染及外来微生物物种入侵的风险. 孙国伟 肖劲洲 陈小兵 王洪明 龚超文 潘迎捷 王永杰关键词:洋山深水港 RRNA基因 古菌 多样性