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聂旋
作品数:
1
被引量:1
H指数:1
供职机构:
河北联合大学
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发文基金:
河北省教育厅项目
国家自然科学基金
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相关领域:
生物学
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合作作者
成婷婷
河北联合大学
黄世栋
河北联合大学
杨艳梅
河北联合大学
王金鹏
河北联合大学
冀洪芳
河北联合大学
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河北联合大学...
年份
1篇
2013
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Lotus japonicus共生固氮基因的比较基因组学
被引量:1
2013年
以模式植物Lotus japonicus基因组为研究对象,首先应用了现有生物信息学软件BLAST程序对Lotus japonicus的全基因组序列进行了比较分析,鉴定两个序列之间的相似性并将其基因筛选出来;其次结合Blastp的数据结果提供的基因同源信息,和基因在染色体上的位置信息,对其全基因组进行共线性分析确定基因组中由WGD产生的重复基因有2197对,以获得Lotus japonicus多倍化发生的规模高达28.05%;再次在NCBI上初步搜索并获得与共生固氮相关的基因序列有12个同时根据获得的共生固氮相关的基因在四个禾本科物种中进行比较分析,并且对其进行了简单的系统进化分析,发现全基因组倍增可能有利于共生固氮相关的基因家族的扩增。
黄世栋
冀洪芳
聂旋
成婷婷
杨艳梅
王金鹏
关键词:
固氮基因
比较基因组学
系统发育树
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