卢丽芳
- 作品数:4 被引量:27H指数:4
- 供职机构:福建农林大学园艺学院更多>>
- 发文基金:福建省属公益类科研院所基本科研专项国家自然科学基金福建省财政专项“福建省农业科学院科技创新团队建设基金”更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 南瓜ISSR-PCR反应体系的建立与优化被引量:8
- 2014年
- 为获得南瓜ISSR最优扩增体系,为后续南瓜的遗传多样性分析和亲缘关系鉴定奠定基础,本研究以‘密本’南瓜为筛选体系材料,采用单因素试验,对ISSR反应体系的Mg2+、dNTP、Taq酶、引物和DNA浓度等5个因素进行优化。研究结果表明,南瓜ISSR 25μL最佳反应体系为:2.5μL 10×Buffer,2.0 mmol/L Mg2+,0.3mmol/LdNTP,1UTaq酶,0.48mmol/L引物,75ng的DNA。在此基础上,对筛选出的12条引物进行退火温度的优化,最终确定每条引物的最佳退火温度。利用该反应体系,选用引物891对85个南瓜品种进行所确立扩增体系的验证,结果显示扩增产物条带清晰明亮、多态性丰富,且特异性强、重复性好,表明本研究所确定的反应体系适用于南瓜的ISSR分子标记。
- 朱海生卢丽芳温庆放林义章
- 关键词:南瓜ISSR分子标记PCR扩增
- 南瓜SRAP反应体系的建立与优化被引量:4
- 2014年
- 以‘密本’南瓜作为筛选体系的材料,通过单因素试验对南瓜20μL SRAP-PCR扩增体系的Mg2+、dNTP、Taq酶、引物及DNA浓度和扩增程序的退火温度与循环次数进行优化,筛选出各组分的最佳浓度、最佳的退火温度和最佳循环次数。试验结果确立南瓜最佳的20μL SRAP体系为:0.2mmol·L-1dNTP,1.5U Taq酶,80ng DNA,0.16μmol·L-1的单条引物,Mg2+1.5mmol·L-1,2μL 10×Buffer;最佳扩增程序为:94℃预变性5min;94℃1min,35℃1min,72℃1min,5个循环;94℃1min,52℃1min,72℃1min 35个循环;最后72℃延伸10min。选用17个南瓜品种对确立扩增体系及扩增程序进行验证,检测结果表现为扩增产物条带清晰明亮、多态性丰富、特异性强、重复性好,表明本试验所确定的反应体系及反应程序适用于南瓜的SRAP分子标记。
- 卢丽芳朱海生温庆放林义章
- 关键词:南瓜分子标记PCR扩增
- 南瓜种质资源遗传多样性的SRAP分析被引量:12
- 2015年
- 本研究应用SRAP分子标记技术对所收集的85份南瓜资源进行亲缘关系分析,从100对引物中挑出17对引物对其进行条带扩增。结果表明:共获得条带200条,差异带有187条,13条条带为所有南瓜品种所共有,多态性比例为93.5%。基于SRAP数据通过Ntsys2.10e软件计算出85份南瓜资源的遗传相似系数在0.450 0~0.985 0。通过聚类分析将所收集的南瓜资源分为3大类:中国南瓜、印度南瓜、美洲南瓜,亲缘关系较近的是中国南瓜与美洲南瓜,二者与印度南瓜的亲缘关系较远。
- 卢丽芳朱海生温庆放林义章
- 关键词:南瓜SRAP亲缘关系聚类分析
- 南瓜种质资源遗传多态性的ISSR分析被引量:7
- 2015年
- 本研究应用ISSR分子标记技术对85份南瓜种质资源进行遗传多样性分析。结果显示:从100条ISSR引物中筛选出12条引物进行PCR扩增,共获得条带125条,多态性占115条,10条条带为所有南瓜品种所共有,平均每个引物的条带数为10.42条,多态性比例为92%。通过Ntsys2.10e软件计算出85份南瓜资源的遗传相似系数0.384 0~1.000 0之间。通过聚类分析将所收集的南瓜品种分为三类:分别是美洲南瓜、中国南瓜和印度南瓜,其中亲缘关系较近的是中国南瓜和美洲南瓜,中国南瓜和美洲南瓜与印度南瓜的亲缘关系均比较远。本研究为南瓜种质资源的保护、利用及新品种的培育提供了科学依据。
- 朱海生卢丽芳陈敏氡林珲王彬温庆放林义章
- 关键词:南瓜ISSR聚类分析