王炜
- 作品数:48 被引量:48H指数:4
- 供职机构:浙江省血液中心更多>>
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- HLA-DPB1基因第2和第3外显子测序方法的建立及其多态性分析被引量:1
- 2015年
- 目的建立HLA-DPB1基因第2~3外显子测序方法,并分析其多态性。方法根据HLA-DPB1基因序列,设计位点特异性引物扩增242名浙江汉族人群HLA-DPB1第2~3外显子序列,PCR扩增产物经双酶切后对第2和3外显子进行双向测序分析,采用Assign3.5+SBT分析软件判读HLA-DPB1等位基因型。结果PCR扩增获得特异性的单一目的片段,其产物经直接测序后得到清晰的序列图。242名浙江汉族人群中共检测到18个HLADPB1等位基因,频率超过0.05的等位基因为DPB1*05:01:01/135:0l(0.4112)、DPB1*02:01:02(0.1901)、DPB1*04:01:01(0.1136)以及DPB1*02:02(0.0620),并确认1个新等位基因DPB1*168:01。在第3外显子中发现9个多态性位点,其中517A〉T为本实验新检出的1个多态性位点。结论本实验建立的HLA~DPB1第2~3外显子测序方法是可行的,HLA-DPB1第3外显子存在一定多态性。
- 和艳敏陶苏丹章伟王炜何吉朱发明吕杭军
- 关键词:多态性造血干细胞移植
- 人类白细胞抗原HLA-C*04:01:01G组的区分鉴别
- 研究探讨区分人类白细胞抗原(HLA)-C*04:01:01G组内等位基因,并分析其与HLA-A、-B的连锁情况.收集HLA-C*04:01:01G组标本,采用聚合酶链反应测序分析方法(PCR-SBT)检测其第2-7外显子...
- 王炜章伟陈男英何俊俊韩浙东秦斐董丽娜朱发明吕杭军
- 关键词:人类白细胞抗原等位基因多态性
- 文献传递
- HLA-DPB1表位特异性分型方法(EST在无关供者造血干细胞移植中的应用
- 和艳敏章伟韩浙东王炜陈男英何俊俊朱发明吕杭军
- 该项目针对热点和难点问题进行研究,在项目实施过程中系统该项目建立了HLA-DPB1基因第2和第3外显子测序分型方法并检测了242例标本,共检测出18种等位基因型,发现2个HLA-DPB1新等位基因,并得到WHO命名委员会...
- 关键词:
- 关键词:造血干细胞移植
- 全自动抽提全血基因组DNA及其在HLA分型中的应用
- 目的:探索建立全自动抽提全血基因组DNA方法,并评估其在HLA分型中的应用情况.方法:利用Hamilton Microlab STATlet自动加样平台,选择相应的磁珠法试剂,并优化加样、裂解、洗涤和洗脱的参数.结果:自...
- 章伟韩浙东何俊俊王炜陈男英朱发明吕杭军
- 关键词:人类白细胞抗原脱氧核糖核酸抽提方法
- 文献传递
- 新的HLA-DRB1等位基因DRB11212的核苷酸序列分析被引量:5
- 2006年
- 目的验证一个新的HLA等位基因HLA-DRB11212的序列。方法采用盐析法抽提样本基因组DNA,利用HLA-DRB1组特异性引物PCR扩增先证者HLA-DRB1等位基因的第2外显子,PCR产物经割胶回收后进行测序分析,通过聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针方法验证测序发现突变点。结果先证者有两个HLA-DRB1等位基因,其中一个为HLA-DRB1090102,另一个HLA-DRB1等位基因,经BLAST验证为新的等位基因,新的等位基因序列已递交GenBank(AY899825)。与最接近的DRB1120101等位基因序列相比,新的等位基因仅在第2外显子上有1个核苷酸不同,即第199位A→C,导致第67位氨基酸Ile→Leu。结论该等位基因为新的HLA-DRB1等位基因,被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-DRB11212。
- 朱发明章伟吕沁风何吉王炜韩浙东严力行
- 关键词:人类白细胞抗原-DRB1等位基因测序核苷酸
- 献血者粒细胞血型系统高通量基因诊断技术的建立和抗体筛选
- 何俊俊陶苏丹和艳敏王炜章伟陈男英朱发明严力行
- 该研究建立HNA-1、3、4、5和HNA-2(C42G)基因的测序技术,为最为准确的粒细胞抗原基因分型方法。利用SNaPShot技术建立了在单一检测管内同步检测HNA-1、3、4、5和HNA-2(C42G)系统的高通量分...
- 关键词:
- 关键词:献血基因诊断
- 人类粒细胞抗原系统基因测序方法的建立
- 何俊俊王炜朱发明吕杭军
- HLA-B无效等位基因B*5408N的核苷酸序列分析被引量:4
- 2007年
- 本研究探讨HLA新的等位基因HLA-B*5408N的分子基础。采用商用抽提试剂盒抽提样本DNA,利用单链特异性引物PCR方法扩增先证者HLA-B基因的第2-4外显子,对PCR扩增产物直接进行第2、3、4外显子双向测序分析。结果表明:先证者样本测序得到两个等位基因,其中一个等位基因为HLA-B*1527,另一个经blast验证其为新的等位基因,新的等位基因序列已递交GenBank(DQ295998,DQ295999,DQ296000)。与最接近的HLA-B*5401等位基因序列相比,新的等位基因仅在第3外显子上有1个核苷酸不同,即第553位G→T,这导致第161位氨基酸Glu(GAG)→终止密码(TAG),蛋白质的翻译提前终止。血清学方法未能检出HLA-B54抗原。结论:该等位基因为HLA-B无效表达等位基因,已被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*5408N。
- 吕沁风朱发明章伟何俊俊王炜韩浙东严力行
- 关键词:HLA-B等位基因测序
- HLA-B新等位基因B*9536和B*4612的测序分析和确认被引量:1
- 2009年
- 目的研究人类白细胞抗原(humanleukocyteantigen,HLA)新等位基因HLA-B*9536和B*4612的分子机制。方法采用Invitrogen抽提试剂盒抽提标本DNA,利用单链特异性引物PCR方法扩增样本HL-B基因第2~4外显子,对PCR产物直接进行HLA-B基因第2、3、4外显子双向测序分析。结果先证者标本存在2个HLA-B等位基因,经HLABlast验证均为新的等位基因,新的等位基因序列已递交GenBank(EU081878和EU081879),经世界卫生组织HLA命名委员会正式命名为HLA_B*9536和HLA-B*4612。HLA-B*9536第2~4外显子序列与最接近的B*1505相比,在第3外显子存在一个碱基的不同,即第544位G—A改变,导致第158位氨基酸Ala—Thr;HLA-B*4612第2~4外显子序列与最接近的B*4601相比,在第3外显子存在一个碱基的不同,即第363位G→C导致第97位氨基酸Arg—Set。结论在同一标本中发现两个新的HLA-B等位基因,并被世界卫生组织HLA命名委员会正式命名。
- 和艳敏章伟何俊俊王炜韩浙东陈男英朱发明严力行
- 关键词:人类白细胞抗原等位基因测序
- HLA-B和-DRB1、HLA-DQB1和-DPB1座位基因重组的分析
- 2023年
- 目的:探讨2个家系人类白细胞抗原(HLA)座位的重组情况。方法:采集家系成员的外周血,提取基因组DNA,采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针技术(PCR-SSO)和二代测序技术检测HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1和-DPB1座位,通过家系遗传分析确定个体HLA单体型。结果:家系1中单体型HLA-A*11:01~C*03:04~B*13:01~DRB1*12:02~DQB1*03:01~DPB1*05:01:01G与HLA-A*03:01~C*04:01~B*35:03~DRB1*12:01~DQB1*03:01~DPB1*04:01:01G在HLA-B和HLA-DRB1座位间进行了交换,形成HLA-A*11:01~C*03:04~B*13:01~DRB1*12:01~DQB1*03:01~DPB1*04:01:01G。家系2中单体型HLA-A*02:06~C*03:03~B*35:01~DRB1*08:02~DQB1*04:02~DPB1*13:01:01G与HLA-A*11:01~C*07:02~B*38:02~DRB1*15:02~DQB1*05:01~DPB1*05:01:01G在HLA-DQB1和HLA-DPB1座位间进行了交换,形成HLA-A*02:06~C*03:03~B*35:01~DRB1*08:02~DQB1*04:02~DPB1*05:01:01G。结论:2个中国汉族人群家系分别发生了HLA-B和-DRB1、HLA-DQB1和-DPB1座位间的基因重组。
- 陈晨王炜王炜董丽娜陈男英朱发明
- 关键词:基因重组