江宇 作品数:5 被引量:46 H指数:4 供职机构: 中山大学生命科学学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 广东省自然科学基金 中国科学院“百人计划” 更多>> 相关领域: 生物学 更多>>
基于cpDNA trnL-F序列数据分析海南陆均松种群的冰期后扩张 被引量:14 2005年 针对热带树种陆均松Dacrydium pierrei de Laubenfels分布在海南的12个天然种群进行取样,测定了叶绿体DNA(cpDNA)trnL-F非编码区序列。序列长度介于868—876 bp.显示出长度多态性。碱基组成A+T含量较高,百分比值为64.17%-64.95%。通过统计简约算法共鉴定出30个单倍型。根据种群间分化度FST(=0.00)、基因流Nm(介于1.92—2.50)、AMOVA(24.17%的遗传变异发生在种群间,P>0.05)以及邻接树中单倍型的分支式样,发现海南的陆均松种群尚未发生遗传分化。另一方面,依统计简约算法构建的单倍型网图具“星状”特征,而且邻接树中多数单倍型合并于树的顶端。这些基因谱系结果提示海南陆均松种群在近期历史上发生过种群扩张。Tajima的D检验和错配分析结果也支持这种推测。结合地质和古孢粉学证据,认为残存于“避难所”的陆均松种群在全新世时,伴随全球气候转暖,在海南岛内可能实行了扩张。 苏应娟 王艇 陈国培 孙宇飞 江宇 邓锋 王伯荪关键词:CPDNA 遗传分化 种群扩张 深圳塘朗山桫椤孑遗种群的遗传分化研究 被引量:4 2003年 应用RAPD标记分析了深圳塘朗山桫椤孑遗种群全部57个个体的遗传变异和进化关系。50个引物共检测到171个位点,其中多态位点10个,多态位点比率5 85%。基于基因频率的Shannon多样性指数平均值为0 0165,Nei基因多样度指数平均值为0 0094,表明该种群的遗传多样性水平极低。对Jaccard相似性系数矩阵用UPGMA法进行聚类分析显示,57个个体可分为4个亚群。RAPD谱带表型的主成分分析(PCA)支持聚类分析结果。根据研究结果讨论了种群的管理和保护策略。 苏应娟 王艇 李雪雁 陈国培 江宇 欧阳蒲月 郑博关键词:桫椤 种群 RAPD标记 进化 遗传分化 中国特有濒危植物白豆杉的系统发育地理和遗传结构研究 <正> 白豆杉(Pseudotaxus chienii(Cheng)Cheng)是我国特有的单种属植物,隶属于红豆杉科(Taxaceae)白豆杉属(Pseudotaxus)。它是第三纪孑遗种,现被列为国家二级保护濒危植物... 苏应娟 王艇 欧阳蒲月 江宇 孙宇飞 丁炳扬 金孝锋 胡绍庆关键词:白豆杉 文献传递 根据cpDNA trnL-F非编码区序列变异分析黑桫椤海南和广东种群的遗传结构与系统地理 被引量:21 2004年 以黑桫椤分布在海南和广东 9个种群为材料 ,通过 PCR产物直接测序和克隆后再测序的方法测定了叶绿体 DNA(cp DNA) trn L- F非编码区序列。序列长度介于 10 17bp至 10 2 1bp;碱基组成 A+T含量较高 ,百分比值为 6 0 .4 3%~ 6 2 .2 6 %。根据序列的核苷酸变异共鉴定出 15个单倍型。黑桫椤具高水平单倍型多样性 (h=0 .880 )和较高水平核苷酸多样性 (Dij=0 .0 0 342 ) ,其悠长的进化历史可能增加了遗传变异在谱系内的积累。单倍型最小生成网图和邻接树、种群间分化度 (FST=0 .12 6 4 5 )和基因流 (N m=3.4 9)、AMOVA分析 (地区间遗传变异占 11.91% ,p>0 .0 5 )以及 DNA歧义度结果一致显示 ,黑桫椤分布在海南和广东的种群彼此间不存在遗传分化。黑桫椤单倍型的系统发育地理式样具“星状”特征 ,提示种群在历史上曾经发生过扩张 。 苏应娟 王艇 郑博 江宇 欧阳蒲月 陈国培 王伯荪关键词:CPDNA 地理分化 中国特有极度濒危植物猪血木的保护遗传学研究 被引量:12 2005年 应用RAPD标记分析了广东阳春八甲镇猪血木EuryodendronexcelsumH T Chang种群全部14个个体的遗传变异和进化关系。23个引物共检测到156个位点,其中多态位点95个,多态位点比率60 90%。根据所得数据求出的观察等位基因数为1 6090、有效等位基因数为1 3471、Nei基因多样性为0 1993、Shannon多样性指数为0 1534。猪血木还保留有比较丰富的遗传多样性。对Jaccard相似性系数用UPGMA法进行聚类分析表明,猪血木个体明显地分为2个亚群,其中2号个体同其他成员的遗传关系疏远。RAPD谱带表型的主成分分析(PCA)支持聚类分析结果。根据这些结果讨论了种群的管理和保护策略。 王艇 苏应娟 叶华谷 欧阳蒲月 江宇 孙宇飞 陈国培 邓锋 张宏达关键词:种群变异 RAPD标记