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杨一帆

作品数：1 被引量：2H指数：1
供职机构：北京大学更多>>
发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域：生物学轻工技术与工程更多>>

合作作者

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学
  • 1篇轻工技术与工...

主题

  • 1篇英文
  • 1篇原核
  • 1篇原核生物
  • 1篇位点预测
  • 1篇基因
  • 1篇基因预测
  • 1篇翻译起始

机构

  • 1篇北京大学

作者

  • 1篇郑晓斌
  • 1篇余振苏
  • 1篇胡钢清
  • 1篇刘永初
  • 1篇朱怀球
  • 1篇杨一帆

传媒

  • 1篇生物化学与生...

年份

  • 1篇2008
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
原核基因翻译起始位点预测的新方法(英文)被引量：2
2008年
翻译起始位点(TIS,即基因5′端)的精确定位是原核生物基因预测的一个关键问题,而基因组GC含量和翻译起始机制的多样性是影响当前TIS预测水平的重要因素.结合基因组结构的复杂信息(包括GC含量、TIS邻近序列及上游调控信号、序列编码潜能、操纵子结构等),发展刻画翻译起始机制的数学统计模型,据此设计TIS预测的新算法MED-StartPlus.并将MED-StartPlus 与同类方法 RBSfinder、GS-Finder、MED-Start、TiCo 和Hon-yaku等进行系统地比较和评价.测试针对两种数据集进行:当前14个已知的TIS被确认的基因数据集,以及300个物种中功能已知的基因数据集.测试结果表明,MED-StartPlus的预测精度在总体上超过同类方法.尤其是对高GC含量基因组以及具有复杂翻译起始机制的基因组,MED-StartPlus具有明显的优势.
胡钢清刘永初郑晓斌杨一帆余振苏朱怀球
关键词：原核生物基因预测
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共1页<1>
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