杜晓云
- 作品数：15 被引量：86H指数：6
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- 江西柿属种质资源遗传多样性的IRAP标记分析被引量：3
- 2017年
- 利用逆转座子间扩增多态性(Inter-retrotransposon Amplified Polymorphism,IRAP)分子标记对收集的49份江西柿属种质资源进行了遗传多样性分析。从26个IRAP引物中筛选出扩增条带清晰且多态性丰富的10个引物,PCR扩增产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)得到清晰的指纹图谱。将418条清晰条带(多态性100%)转换为0/1矩阵,聚类分析结果表明:供试的江西柿属种质资源的遗传相似系数在0.69~0.92之间,分属柿、油柿、野柿三个种,遗传多样性丰富;明晰了几个分类关系模糊的柿种质资源的种属关系。
- 曾明杜晓云吴美华王彦波
- 关键词：柿属种质资源IRAP
- 内切酶接头引物对柿属SSAP分子标记扩增的影响被引量：1
- 2010年
- SSAP(sequence-specificam plification polymorphism,序列特异扩增多态性)是种质遗传多样性分析和系统进化研究的有力工具之一。根据10个SSAP引物组合对28份柿属基因型的扩增结果探讨内切酶因素对SSAP逆转座子分子标记扩增的影响。结果表明,在以MseI和EcoRI组合消化的SSAP反应系统,且均以3个碱基作为末端选择性碱基的前提下,MseI与逆转座子引物组合的SSAP扩增性能优于EcoRI与逆转座子引物组合。研究结果为有目的和高效选择内切酶引物进行植物种质资源SSAP分析提供参考。
- 杜晓云黄建民张青林罗正荣
- 关键词：逆转座子
- 植物逆转座子引物开发应用中的逆转座子序列分离方法
- 2010年
- 文章介绍了作为植物逆转座子引物开发前提序列的逆转座子序列获得的几种方法:(1)通过同源克隆法获取逆转座子的基因序列以设计逆转座子基因序列特异引物;(2)通过筛选文库、聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)、搜寻核酸数据库、大片段重叠群测序分离全长逆转座子序列以开发逆转座子长末端重复(long terminal repeat,LTR)引物;以及利用(3)磁珠富集、(4)抑制PCR和(5)SiteFinding PCR等方法直接获得逆转座子的LTR序列以开发逆转座子LTR引物。
- 杜晓云张青林黄建民罗正荣
- 关键词：逆转座子引物植物分子标记
- 罗田甜柿Ty1-copia类逆转座子RNaseH-LTR序列的分离和特性分析被引量：14
- 2008年
- 逆转座子序列信息的获得,对了解其在基因组中的行为及系统学研究有重要价值。本试验从罗田甜柿(Diospyros kaki Thunb.‘Luotian-tianshi’)基因组中分离出31个RNaseH-LTR(long terminal repeat,长末端重复)序列,并利用逆转座子间扩增多态性(inter-retrotransposon amplified polymorphism,IRAP)技术对部分序列相应的逆转座子家族在柿属植物中的转座活性及分布情况进行初步探讨。序列分析结果表明,至少有10个Ty1-copia类逆转座子家族得到扩增;其家族间普遍表现高度异质,碱基替换、插入或缺失突变,以及翻译成氨基酸后发生不同程度的终止密码子突变、氨基酸取代和移框突变等,是产生高异质性的原因;此外,其家族内部某些序列间的相似性极高,可能是寄主基因组与逆转座子间互惠关系的体现。应用部分逆转座子引物的IRAP分析结果表明,相应的逆转座子家族在柿属植物中普遍存在,其分布广泛,拷贝数高,转座活性强,具有进一步开发为多种逆转座子分子标记的潜力。
- 杜晓云张青林罗正荣
- 基于IRAP技术的磨盘柿变异单株鉴定被引量：8
- 2011年
- 以已知亲子关系的柿品种、柿近缘种和磨盘柿标准品种为对照,对采自北京市房山区磨盘柿产区的部分变异单株进行了IRAP分析。结果表明,19条逆转座子引物中的4个(rtdk13-f5,rtdk16-r10,rtdk4-p3和rtdk2-p6)可将供试11份变异单株完全区分;供试变异单株间的相似系数在0.90～0.98(平均0.94),与磨盘柿标准品种的相似系数为0.91,大于种间和品种间相似系数,与芽变类型及其母株间的相似系数接近;聚类分析结果表明,变异单株与磨盘柿标准品种紧密相聚,分支模式与种间及品种间明显有别。因此,供试11份变异单株已发生部分遗传物质改变,且可能为磨盘柿芽变。IRAP可区分遗传背景高度相似的种质间的微小变异,可望在果树芽变鉴定中应用。
- 杜晓云张青林李宝冷平张明德黄建民罗正荣
- 关键词：亲缘关系芽变UPGMA
- 利用IRAP技术揭示部分柿属种间遗传关系被引量：5
- 2012年
- 【目的】为了明晰柿属植物种间亲缘关系和探究逆转座子与该属植物倍性进化的相关性,【方法】以16种24份柿属植物为试材,利用IRAP(Inter-Retrotransposon Amplified Polymorphism)技术和UPGMA聚类分析。【结果】采自我国南热带的供试基因型独自成组,与其采集地域相吻合,反映了它们较古老的分类学地位;采自我国北亚热带和温带的基因型独立于南亚热带基因型组,含丰富的染色体倍性,且相互间混聚在一起,无明显地域趋同性,反映了该区域基因型间广泛的基因交流和适应性进化;从UPGMA聚类图反映的不同区域柿属基因型间的相对位置来看,逆转座子活性与其倍性进化及生态适应性间存在明显的相关性。【结论】采自我国南亚热带的柿属植物可能更加古老;逆转座子在柿属种间倍性进化过程中可能发挥了一定的作用。
- 杜晓云宿福园张青林王彦波曾明罗正荣
- 关键词：柿属植物IRAP逆转座子
- 逆转座子分子标记及其在果树上的应用被引量：5
- 2009年
- 基于逆转座子特殊的转座机制及其生物学特性发展的逆转座子分子标记,具有多态性高、基因组覆盖度广、适于高通量分析等特点。就常见逆转座子分子标记的原理、操作及其在果树种质鉴定、遗传多样性检测、亲缘关系重建和遗传图谱构建等方面的应用进展进行简要阐述,以期为此类技术在果树上的应用提供参考。
- 杜晓云张青林罗正荣
- 关键词：果树IRAPREMAPSSAP亲缘关系
- 不同脱涩方法对“赣方1号”柿低温贮藏及果实品质的影响被引量：6
- 2014年
- 为探讨"赣方1号"柿的最佳脱涩方法及其对低温贮藏条件下果实品质的影响,进行了清水脱涩、乙醇脱涩及CO2脱涩前后及贮藏期内相关生理指标变化的研究。结果表明,清水脱涩失重率低,软化速度慢,而且成本较低,更易保持果实硬度,但脱涩后果实风味稍淡,处理时间较长且不易控制;乙醇脱涩完全,水分流失少,易实现批量处理,但脱涩后的果实硬度低,软化、衰老快,不便长期贮藏和运输;CO2脱涩处理耗时较短,柿果脱涩完全,能较好地保持果实硬度,延长贮藏期,但脱涩后失重率较大,成本较高。综合评价来看,CO2对赣方1号的脱涩效果及贮藏品质效果最好。
- 熊宇婷曾明王璠李国权王彦波吴美华杜晓云
- 关键词：脱涩低温贮藏果实品质
- 赣南脐橙非充分灌溉条件下水分需求规律研究被引量：9
- 2010年
- 在大田相对自然状态下,对赣南脐橙进行了不同生长时期的非充分灌溉试验研究,结果表明:土壤水分过高或过低,均不利于赣南脐橙的生长发育及产量和品质的提高;赣南脐橙在萌芽期、枝梢生长期、开花期和果实生长期的最适土壤含水量分别为10.6%、10.6%、7.1%～10.6%和10.6%～14.1%,相当于田间持水量的41.7%、41.7%、28.0%～41.7%和41.7%～55.5%。
- 万水林黄建民吴美华涂娟王业共陈东元邱家洪杜晓云
- 关键词：脐橙非充分灌溉土壤含水量
- ISTR在部分柿属植物种质鉴定和亲缘关系分析中的应用被引量：12
- 2009年
- 利用反向序列标签重复技术(inverse sequence-tagged repeat,ISTR),对柿属7个种,包括柿(Diospyros kaki Thunb.)、君迁子(D.lotus L.)、浙江柿(D.glaucifolia Metc.)、油柿(D.oleifera Cheng.)、金枣柿(D.sp.)、老鸦柿(D.rhombifolia Hemsl.)和美洲柿(D.virginiana L.)共32个基因型进行了种质鉴定和亲缘关系研究。结果表明:ISTR可区分供试柿属植物中的30份;ISTR能够很好地适用于柿属植物亲缘关系分析;供试的中国与日本原产柿种质分别聚类;新发现的中国甜柿变异类型与日本甜柿的亲缘关系较远且存在较丰富的遗传变异,可能是潜在的育种资源。ISTR标记可在柿属植物种质资源鉴定和亲缘关系分析中更广泛地应用。
- 杜晓云张梦思罗正荣张青林
- 关键词：柿属亲缘关系
