宿滨
- 作品数:7 被引量:6H指数:2
- 供职机构:哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院更多>>
- 发文基金:黑龙江省自然科学基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- 系列RNA-seq数据的表达模式聚类方法研究
- 2013年
- 目的转录组测序技术为研究特定组织细胞生理状态和分子水平变化提供有力方法。为了建立分子水平变化和组织细胞生理功能之间的关系并排除随机因素的干扰,需要建立基于系列RNA-seq数据的表达模式分析方法。方法本文提出了一种整合的方法(geneexpressionclustermethod,GECluster)用于对系列样本模式聚类。整合曲线拟合以及信息熵建立模型并提取特征属性,最后按照上面模型提供的特征属性对基因进行层次聚类分析。结果表达趋势一致的基因被很好地聚到一个类别中,功能富集分析发现这些基因具有很强的功能相关性,并与文献报道相吻合。结论GECluster可以更灵活客观对多样本系列RNA—seq数据挖掘共表达基因,为后期功能分析提供了更有效的研究方案。
- 赵辉曹峰林宁尚伟王乐天宿滨李霞
- 关键词:转录组测序信息熵聚类分析
- 东北龙胆Gentiana manshurica Kitagawa菌根的初步研究
- 1990年
- 本文首次报导了东北龙胆具有共生真菌的特点.并对菌根的存在状态、类型及菌根菌侵染过程进行了详细的描述和分析.充实了东北龙胆的生物学知识,并为改进其栽培措施提供了理论依据.
- 宿滨刘鸣远
- 关键词:龙胆菌根共生真菌
- 长爪沙鼠实验动物化研究被引量:2
- 1991年
- 对野生长爪沙鼠进行系列实验动物化研究;用乙醚浅麻醉法解决了交配时的殴斗伤亡问题;肯定了一雄一雌频密繁殖法的优点:测定了心、肝、肾、脾等主要脏器重量,发现野生的略大于驯化的;光、电镜检查发现,肾近端小管曲部的细胞基底有明显的基底纹;还测定了26项血清生化值及13项血液细胞的数据;其T淋巴细胞平均值为63.3±2.0;心电图V导联最典型,S-T段缺如,其电激动过程与人相似。
- 郭丹柳英侠宋世钧葛春芳王敏毕延发宿滨
- 关键词:长爪沙鼠实验动物化
- 兔定位性髂动脉粥样硬化狭窄模型的复制被引量:1
- 1992年
- 用猪油、胆固醇和蛋黄喂饲家兔,配合动脉内皮剥脱术,复制了定位性的髂动脉粥样硬化狭窄模型。经血管造影及光、电镜检查,证实这种模型的复制方法确实、可靠、简便、易行,从而为PTCA研究提供了有利条件。
- 毕延发柳英侠郭丹宿滨孙宝贵付世英黄永麟
- 关键词:胆固醇PTCA
- 致心律失常性右心室心肌病致病蛋白的挖掘被引量:1
- 2012年
- 目的:鉴定疾病蛋白对深入理解致心律失常性右心室心肌病(ARVC)致病机制至关重要。可以采用计算生物学的方法,在ARVC疾病相关网络中挖掘新的潜在的致病蛋白。方法:本文整合HPRD和BioGRID的蛋白质互作数据,获得了较为全面且真实可靠的蛋白质互作数据;通过结合文本挖掘和统计学检验筛选出ARVC种子蛋白,应用最近邻居扩增的方法,构建ARVC蛋白质互作网络(PPIN),并采用PRINCESS法则对网络中每对互作蛋白加权;最后,基于ARVC关联得分策略对网络中的每个蛋白质打分并排秩。结果:分析发现排秩前50的候选蛋白大都与ARVC关系密切,如PRKCA,CDH1,SMAD4,SMAD2,CDH5,CTNNA1,DSC1等在调节心肌收缩、细胞程序性死亡、心脏的发育过程及维持桥粒的完整性方面起重要作用。结论:我们提出的方法为鉴定与ARVC致病机制相关的新致病蛋白提供了有效的途径。
- 崔丹闫玉清李琬陈丽娜李为国太京燮张良才宿滨李心玲
- 关键词:致心律失常性右心室心肌病蛋白质互作网络致病蛋白
- 长爪沙鼠T淋巴细胞参考值的初步探讨
- 1989年
- 用非特异性酸性α-乙酸萘酯酶(ANAE)法测定了30只健康的成龄长爪沙鼠循环血,其T淋巴细胞值为68.3±2.02,可初步作为长瓜沙鼠免疫功能指标,并提出ANAE反应物形态数量、大小等与细胞发育阶段关系的见解。
- 郭丹王衍庆凌秋郑继奎宿滨
- 关键词:长爪沙鼠T细胞参考值
- 干扰素-α对兔离体的卵巢颗粒细胞孕酮生成的影响被引量:2
- 1994年
- 本研究应用离体培养的兔卵巢颗粒细胞观察了IFN-a对孕酮生成的影响。细胞预培养24h后,用IFN-a(50~800U/ml)处理培养的颗粒细胞12b刺激孕酮的生成并呈剂量依赖关系。在IFN-a加入培养细胞后3、12和24h.刺激作用非常明显,但刺激作用的幅度在3和12h较大,分别为对照组的24和20倍。此外,IFN-a刺激离体兔颗粒细胞孕酮生成的作用被同时加钙螫合剂EGTA(1mmol/L)或钙通道阻断剂异搏定(ver)20和200μmol/L所抑制。本研究结果表明,IFN-a刺激离体兔卵巢颗粒细胞孕酮的生成,其作用依赖于细胞外的Ca2+浓度。
- 宿滨王启发姜良马青年姚兰春
- 关键词:干扰素颗粒细胞孕酮