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商磊
作品数:
4
被引量:2
H指数:1
供职机构:
浙江大学
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相关领域:
医药卫生
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生物学
电子电信
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合作作者
徐建成
浙江大学沃森基因组科学研究院
杨焕明
浙江大学沃森基因组科学研究院
冯明光
浙江大学生命科学学院微生物研究...
田薇
浙江大学沃森基因组科学研究院
包其郁
温州医学院生命科学学院生物医学...
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温州医学院
作者
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商磊
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齐艳
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包其郁
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田薇
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杨焕明
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徐建成
传媒
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Journa...
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2016
1篇
2006
1篇
2005
共
4
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被引量排序
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SARS冠状病毒的基因组变异与进化研究
在本研究中,我们获取了10株直接来源SARS病人粪便或咽拭子样本及其细胞传代培养物的SARS-CoV全基因组序列,并会同公共数据库中的115株SARS-CoV基因组序列进行了系统地比较分析。以GZ02序列为参照,发现26...
商磊
关键词:
SARS冠状病毒
基因组
单核苷酸多态性
文献传递
SARS病毒基因组的多态性(英文)
被引量:1
2006年
对SARS病人粪便样本直接测序,得到SRAS-CoV BJ202 全基因组序列(AY864806)。应用比较基因组研究方法对GenBank 中公布的 115 株 SARS-CoV 基因组序列以及 BJ202 进行分析。以 GZ02 序列为参照,发现 2 个以上基因组中同时存在单核苷酸多态(SNP)位点共278个。多态位点在SARS-CoV基因组中呈偏态分布,大约一半突变位点(50.4%, 140/278)发生在基因组3′末端1/3区域。编码Orf10-11、Orf3/4、E蛋白、M蛋白和S蛋白区域突变率较高。克隆并测序含有BJ202基因组12个多态位点的11个cDNA以及4个不含已知多态位点的cDNA片段(15个片段总长度为6.0 kb),结果显示:BJ202 特有的 3 个多态位点(13 804、15 031 和 20 792)以及另外 3 个多态位点(26 428、26 477 和 27 243)均检出两种不同核苷酸;位点18 379虽在已公布的115株SARS-CoV基因组中未发现突变,实际上也是多态位点。14个克隆中有8个克隆该位点为A,6个克隆为G。全部116个SARS-CoV基因组中共有18种缺失类型和2种插入类型。大部分缺失发生在编码ORF9和ORF10-11区域(基因组序列27 700-28 000 bp处)。以邻位连接法(Neighbor-Joining)构建了116株SARS-CoV系统发育树,BJ202 与BJ01和LLJ-2004等SARS-CoV的亲缘关系较接近。
商磊
齐艳
包其郁
田薇
徐建成
冯明光
杨焕明
关键词:
SARS相关冠状病毒
基因组
多态性
基于图嵌入方法的慕课推荐系统研究
商磊
基于动作特征的视频监控网络行人识别算法
近年来,随着视频监控技术的发展,有越来越多的摄像头被部署在安防领域,随之也产生了大量的监控视频。现有的视频监控系统只能记录视频,或提供有限的智能监控能力,如人流监测、越界报警、违法行为抓拍等。在案件发生后对特定目标的识别...
商磊
关键词:
视频监控
图像特征
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