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基于大黄鱼基因组的微卫星标记开发与验证: 2020年; 大黄鱼及其姐妹种小黄鱼属鲈形目,石首鱼科,都是中国沿海重要的经济鱼类。在本研究中,我们从大黄鱼的基因组序列中开发了499,638个微卫星DNA位点,并选取了其中22个四碱基重复的微卫星在大黄鱼(n=21)和小黄鱼(n=3)中评估了基因座的多态性。在大黄鱼中共获得了220个等位基因,每个基因座平均有10±5.58个等位基因(NA)。有效等位基因数(NE),观测杂合度(HO),期望杂合度(HE)和多态信息含量(PIC)分别为5.40±3.68、0.64±0.25、0.71±0.22和0.67±0.22。在小黄鱼中交叉扩增共产生了66个等位基因(NA=3±1.51),每个基因座平均的NE,HO,HE和PIC分别为2.65±1.40、0.52±0.38、0.60±0.34和0.45±0.26。所选微卫星DNA标记可以在2个物种间实现交叉扩增,有助于对大黄鱼和小黄鱼,特别是人工繁育、养殖的杂交后代开展深入的群体遗传学和种群评估研究。此外,这一方法可以进一步促进其他缺乏有效遗传标记的非模式海洋鱼类在基因组水平上开发、研究微卫星标记。; 谢斐昂赵若苹何其MAO Jun-laiWANG Yi-fanJIANG Li-huaSENANAN Wansuk陈永久; 关键词：大黄鱼小黄鱼基因组序列微卫星DNA

黒腹果蝇中嵌合新基因的进化命运和表达模式被引量：3: 2011年; 新基因的起源和进化对基因组多样性的产生具有重要的贡献。新基因起源常常通过外显子重排而形成嵌合的基因结构,以产生具有新功能的蛋白质。该文调查了在黒腹果蝇中的14个新起源的嵌合基因在群体中的多态性,发现其中8个在群体中的核苷酸多态性会引起提前终止子,而其他6个在群体中编码框都完整且其中4个受到负选择。研究结果表明,嵌合新基因起源后可能存在两种命运:积累提前终止子突变而假基因化,或者表现出一定功能而受自然选择固定下来。基因表达的数据显示,与RNA介导外显子重排(逆转座)形成的新基因不一样,这些由DNA水平外显子重排产生的新基因没有精巢或者雄性特异性表达模式,而是表现出更为多样性的时空表达模式,这提示尽管通过DNA水平外显子重排产生的新基因可能正在变成假基因或者非蛋白质编码的RNA基因,但它们依然可能具有进化出广泛的生物学功能的潜力。; 占祖兵张越赵若苹王文

重复元件介导的重组是新嵌合基因形成的一个重要机制被引量：3: 2009年; 先前的研究提示重复元件在产生新的嵌合基因中具有机制性的作用,这与经典的外显子洗牌模型是一致的,它依赖于非同源重组。而近期一些关于染色体异常的研究结果显示,异位的同源重组可能对于产生新基因也非常重要。本项研究通过对8种果蝇的年轻基因进行筛选和分析,从中识别出了17个重复片段,它们是在最近1200万年中通过异位重组形成的。它们中的大多数已具有功能,并进化出多样的表达类型和嵌合结构。这些结果证实,重复元件介导的非等位同源重组在产生新嵌合基因中起到重要作用。; 杨爽J.Roman Arguello李昕丁昀周琦陈英张越赵若苹Frdric Brunet彭立新龙漫远王文; 关键词：嵌合基因新基因

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赵若苹