潘海涛
- 作品数：4 被引量：58H指数：2
- 供职机构：山东农业大学农学院作物生物学国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金山东省农业良种产业化开发项目国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 小麦大粒突变体的SSH文库构建及分析被引量：1
- 2010年
- 为了获得控制小麦籽粒大小的相关基因,本研究以小麦大粒突变体8008和烟农15为材料,利用抑制消减杂交技术,构建抑制消减cDNA文库。在双向库中随机挑取20个阳性克隆进行测序,共获得24条EST序列。在GenBank数据库中进行Blast比对和功能分析,12条EST与已知功能基因高度同源,主要包括光合作用相关基因、物质代谢相关基因、RNA功能相关基因等;5条EST序列与未知功能的禾本科作物cDNA片段高度同源,7条EST未能找到同源性匹配。
- 汪俊君王盈盈潘海涛李斯深
- 关键词：小麦突变体
- 小麦EST-SSR标记的开发和苗期养分吸收QTL定位
- 微卫星或简单重复序列/(simple sequence repeats, SSR/)存在于表达序列标签/(expressed sequence tags, ESTs/)中。为利用小麦EST序列数据库开发EST-SSR标记...
- 潘海涛
- 关键词：小麦EST-SSRRIL
- 文献传递
- 小麦EST-SSR标记的开发和遗传作图被引量：43
- 2010年
- 【目的】利用小麦EST序列数据库开发EST-SSR标记。【方法】对GenBank/dbEST注册的普通小麦EST序列(2006.4.18—2007.2.4)进行SSR查找,采用Primer5.0软件设计EST-SSR引物,选用3个小麦品种进行有效性检测,利用RIL群体和Mapmaker/Exp3.0软件进行遗传作图。【结果】在265362条普通小麦EST序列中,共发现6314个SSR,占整个EST数据库的2.38%。其中二核苷酸、三核苷酸重复序列最多,分别为2237(35.43%)和2084(33.01%)个。二核苷酸重复中,以GA/CT和AG/TC出现频率最高、分别占SSR总数的17.85%和10.37%,其次是CA/GT(4.07%)和AC/TG(2.53%);三核苷酸重复中,CAA/GTT(3.93%)、CGG/GCC(3.83%)、CGC/GCG(3.36%)、GGC/CCG(3.14%)、CTT/GAA(2.53%)、TGC/ACG(2.27%)以较高的频率出现。根据筛选得到的微卫星序列共设计了596个EST-SSR引物对,选择其中95分以上的194个合成。PCR检测表明,165个引物对(85%)可以扩增出稳定清晰的带型;在RIL群体中检测到21个EST-SSR引物26个位点有多态性,将其中的23个位点整合到已有的小麦遗传图谱上。【结论】开发了165个小麦EST-SSR新标记,EST序列是小麦SSR标记的重要来源。
- 潘海涛汪俊君王盈盈齐照良李斯深
- 关键词：小麦分子标记RIL
- 62个小麦品种基于EST-SSR标记的遗传多样性分析被引量：14
- 2008年
- 为了解从匈牙利、捷克引进的39个欧洲小麦品种的遗传多样性，以23个中国黄淮冬麦区小麦品种为对照，利用55个多态性EST-SSR标记检测参试材料的遗传多态性。结果表明，55个标记在62个小麦品种中检测到213条差异带，能够将所有品种区分开来；单个引物扩增差异带数目为1-9条，平均为3.87条；多态性信息指数（PIC）为0-0.87，平均为0.53；品种间遗传相似系数为0.48-0.94，平均为0.70。引进品种平均等位变异数高于国内品种，而相似系数却低于国内品种，表明引进品种遗传变异基础大于本研究中的国内品种。聚类分析在相似系数0.69处将62个品种聚为两类，第Ⅰ类包含匈牙利的2个品种，其他60个品种聚为第Ⅱ类。第Ⅱ类又分为四个亚类，其中，第一（Ⅱ-1）和第三亚类（Ⅱ-3）包含了引进和国内品种，而第二亚类（Ⅱ-2）全部为国内品种，第四亚类（Ⅱ-4）全部为引进的品种。
- 王盈盈刘玉新汪俊君潘海涛齐照良李斯深
- 关键词：小麦EST-SSR聚类分析
