宋芹芹
- 作品数：37 被引量：40H指数：4
- 供职机构：中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所更多>>
- 发文基金：艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项国家科技重大专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学文化科学生物学更多>>
- BSL-2实验室开展SARS-CoV-2核酸检测过程中的生物安全管理被引量：5
- 2021年
- 目的:总结生物安全二级(bio-safety level 2,BSL-2)实验室开展新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)核酸检测过程中的生物安全管理经验与效果。方法:检测样本来源于2020年2月21日到2020年11月5日送达中国疾控中心病毒病预防控制所病毒资源中心科室的人体咽拭子、鼻拭子、痰液、尿液、便液等。在遵循常规生物安全管理要求的基础上,在检测过程中积极进行人员、岗位、标本、过程、安全巡视等生物安全管理。结果:共开展了27692人次样本的SARS-CoV-2核酸检测,平均每天检测(2.32±0.11)批样本,每批平均检测(87.22±6.83)件样本,BSL-2实验室平均每天工作时间(3.43±0.23)h。在检测过程中未出现任何生物安全问题。结论:BSL-2实验室在长时间的SARS-CoV-2核酸检测过程中,要积极从多方面加强生物安全管理,从而保障检测工作安全有序进行。
- 夏志强杜海军夏冬梅国勇王文军王瑞芳宋芹芹宋娟王衍海韩俊
- 关键词：核酸检测
- 指环病毒6实时荧光定量PCR检测体系的建立与验证被引量：1
- 2019年
- 目的 建立指环病毒(Torque teno virus,TTV)6实时荧光定量PCR检测体系,并验证检测体系的敏感性与特异性。方法 根据GenBank中登录的TTV6基因序列设计引物与FAM-Eclipse探针,建立基于FAM-Eclipse探针法的实时荧光定量PCR检测方法,建立标准曲线并进行敏感性与特异性分析。结果 建立了能够特异检测TTV6的荧光定量PCR检测方法,标准曲线方程为y=-3.0921x + 28.36,扩增效率和R2分别为99.6%和1.000。该方法检测TTV6的敏感度为1.0×10拷贝/μl,与其他病毒无交叉反应。在临床呼吸道感染人群56份咽拭子样本中检出1例TTV6阳性。结论 基于FAM-Eclipse探针建立的检测TTV6实时荧光定量PCR检测体系具有特异性强与灵敏度高等优点,可为临床上TTV6的检出与定量病毒含量提供了一种有效的手段。
- 夏志强宋娟刘宓宋芹芹刘一瑾郝鑫昊韩俊
- 关键词：实时荧光定量PCR敏感性特异性
- CVB32A蛋白酶抑制帽样结构依赖的蛋白翻译
- 2013年
- 目的探讨CVB3的蛋白酶2A对真核细胞帽样蛋白翻译和内部核糖体进入位点（IRES）翻译机制的影响。方法构建表达载体pcDNA3．1—2A，将此表达载体分别与pEGFP—N1、pGL3（F-luc）以及pIRES-GFP载体共转染细胞后，荧光显微镜观察绿色荧光蛋白（GFP）的表达，检测荧光素酶蛋白的表达。WesternBlot检测CVB3病毒和pcDNA3．1-2A对真核生物翻译起始因子4GI（eIF4GI）及多聚A尾结合蛋白（PABP）的影响。结果pcDNA3．1之A可以减少帽样依赖的GFP和荧光素酶蛋白的表达，但可以促进IRES依赖的GFP表达。CVB32A基因质粒转染和CVB3感染后，均可发现细胞内elF4G的切割现象；同时CVB3对PABP也有降解作用，而CVB32A基因转染对PABP无明显作用。结论CVB3的蛋白酶2A抑制真核细胞帽样途径蛋白翻译，促进IRES途径的翻译。
- 卢明枝宋娟孙鹏宋芹芹盛琳君王宝栋迟苗苗姚海兰李朝品韩俊
- 关键词：柯萨奇病毒感染蛋白激酶类核糖体
- 2021-2022年绵阳地区流感样病例样本中的鼻病毒特征分析
- 2024年
- 目的了解绵阳地区的流感样病例患者的鼻病毒(human rhinovirus,HRV)流行情况及病原特征。方法收集2021—2022年绵阳地区哨点医院呼吸道感染且诊断为流感样病例(influenza-like illness,ILIs)患者的咽拭子,采用实时荧光定量PCR技术对16种常见病原体进行检测。巢氏PCR扩增HRV阳性样本的VP4/VP2编码区基因。从GenBank数据库下载国内外各血清型代表株进行系统发育、一致性及氨基酸变异分析。结果共采集绵阳地区ILIs样本332例,病毒检出率为58.73%(195/332)。其中HRV阳性样本23例,检出率为6.92%(23/332),成功扩增出18条HRV流行株序列。经比对发现绵阳地区ILIs病例流行的HRV涉及13种血清型,分属于HRV-A(12种)、HRV-B(5种)和HRV-C(1种)3种基因型。同源性分析表明其核苷酸和氨基酸相对保守,但与参考株相比,HRV-A型和HRV-B型存在多处变异。结论HRV是2021—2022年绵阳地区ILI感染的病原体之一,以HRV-A型为主。
- 宫悦潘明陈果宋芹芹王衍海高晨夏志强王璐璐程迁宗可鑫韩俊
- 关键词：流感样病例鼻病毒病原特征遗传进化
- 肠道病毒71型抵抗I型干扰素诱导的抗病毒作用被引量：6
- 2012年
- 目的研究肠道病毒71型（EV71）抵抗I型干扰素（interferon，IFN）诱导的抗病毒作用。方法将1000U／ml的I型干扰素（α，β）加入HeLa细胞后，去除上清中的干扰素，感染带有GFP的重组单纯疱疹病毒（HSV-1）和EV71，观察GFP的表达和PCR检测HSV-1核酸，判断I型干扰素对HSV，1的作用。通过RT—PCR方法检测EV712A基因的表达从而判断EV71病毒的复制能力。结果I型干扰素（α，β）诱导HeLa细胞产生抗病毒蛋白而有效地抑制重组HSV-1GFP的表达和核酸扩增。而EV712A的RT—PCR结果证实EV71可在I型干扰素（α，β）作用后的HeLa细胞中有效增殖。结论I型干扰素（α，β）诱导产生抗病毒蛋白；EV71可在I型干扰素（α，β）诱导产生抗病毒蛋白的HeLa细胞中有效增殖。
- 崔雨宋娟宋芹芹孙鹏甘星李公启王克霞韩俊
- 关键词：肠道病毒属干扰素I型
- 《人间传染的病原微生物目录》中病毒部分的解读
- 2023年
- 为了更好的落实《中华人民共和国生物安全法》和《病原微生物实验室生物安全管理条例》相关规定,2023年8月国家卫生健康委发布通告国卫科教发〔2023〕24号,正式印发了《人间传染的病原微生物目录》(以下简称《目录》)。随着新的病原微生物不断出现,对现有病原微生物认识不断更新,以及实验室生物安全研究不断深入,原有的《人间传染的病原微生物名录》已不能够满足需求,因此颁布了《目录》。本文旨在详细解读《目录》中病毒部分,包括制定背景、原则、过程以及主要内容,以便更好的了解和认识《目录》。
- 高晨宋芹芹宋娟韩俊
- 关键词：病原微生物生物安全
- 2015-2021年江苏省徐州市住院儿童严重急性呼吸道感染病例鼻病毒感染分析
- 2023年
- 目的了解2015—2021年江苏省徐州市住院儿童严重急性呼吸道感染(SARI)病例中病毒谱的构成,进一步探究人鼻病毒(hRV)的分子流行病学特征。方法使用实时荧光定量聚合酶链式反应技术(RT-PCR)对咽拭子标本中的常见呼吸道病毒进行检测。巢式PCR法扩增hRV阳性样本的VP4/VP2区基因序列,构建系统发育树,并进行同源性分析。结果1663份标本中呼吸道病毒检出阳性641份(38.54%)。hRV的检出率位居第1位,为13.95%(232/1663)。2018年hRV的检出率明显较高(28.08%);呈现夏秋高峰的季节性流行特征。2020年后,hRV在1—6月的检出率明显降低,但7月后检出率迅速回升,且在3~6岁年龄组中明显上升,≥6岁组中明显下降。hRV的VP4/VP2区序列比对分析发现涉及29种血清型,以hRV-A组为主。结论hRV是2015—2021年徐州市住院儿童SARI病例中主要流行的呼吸道病毒,以hRV-A组为主要流行,血清型具有多样性。hRV的流行在2020年受到了短暂的抑制之后迅速回升,提示需要对hRV感染进行持续监测。
- 曹润冬朱人和宋娟夏冬宋芹芹夏志强刘宓杜海军韩俊高晨
- 关键词：呼吸道病毒鼻病毒系统发育分析同源性分析
- 柯萨奇病毒B3蛋白酶2A干扰核因子κB p65的二聚体形成和核转移
- 2014年
- 为探讨柯萨奇病毒B3(CVB3)蛋白酶2A是否通过干扰核因子κB(NF-κB)的核定位而影响细胞因子表达,构建CVB3蛋白酶2A的表达载体pcDNA3.1-2A。将此表达载体与核转录因子NF-κB基因启动子荧光素酶报告基因载体pGL3-NF-κB promotor-Luc共转染细胞,经肿瘤坏死因子α(TNF-α)刺激,检测荧光素酶表达;通过免疫荧光和蛋白免疫印迹检测CVB3蛋白酶2A对NF-κB核定位和二聚体形成的影响。结果显示,CVB3蛋白酶2A可减少NF-κB二聚体形成,并干扰其核转移。本研究证实,CVB3蛋白酶2A可通过干扰NF-κB二聚体形成和核转移而影响细胞因子分泌。
- 盛琳君宋芹芹卢明枝宋娟孙鹏王宝栋迟苗苗韩俊
- 关键词：柯萨奇病毒B3核因子ΚB
- CVB3诱导Th17/Treg失衡导致小鼠病毒性胰腺炎
- 2023年
- 目的构建CVB3诱导的小鼠胰腺炎模型,观察胰腺组织病理学损伤和浸润Th17/Treg细胞的占比变化。方法BALB/c小鼠腹腔注射CVB3构建急性病毒性胰腺炎模型,通过HE染色观察胰腺病理学改变;q-PCR检测胰腺组织病毒核酸载量和细胞因子(IFN-γ、IL-6和IL-17)mRNA的相对表达量;流式细胞术检测胰腺组织浸润细胞CD45+CD3+T细胞、CD4+和CD8+T细胞、Th17和Treg细胞占比。结果CVB3感染第3天胰腺组织病毒核酸载量为0.96±0.18,且随感染时间点推移而逐渐降低;与3dpi组相比,7dpi组胰腺组织病毒核酸载量有降低趋势(0.96±0.18 vs.0.62±0.14),但无统计学差异。胰腺组织炎症细胞浸润在7dpi后明显增加,损伤评分>2;浸润的Th17细胞(1.05±0.21 vs.22.13±5.79)和Treg细胞(3.11±0.78 vs.8.25±1.30)在CD4+T细胞中占比在感染后7天同时升高(P<0.05),且Th17/Treg比值也明显增高(P<0.01)。与对照组相比,CVB3感染第7天,胰腺组织IFN-γ(1.05±0.23 vs.672.6±47.67)、IL-6(1.00±0.38 vs.68.28±4.57)、IL-17(1.01±0.11 vs.54.15±7.94)的mRNA相对表达量明显升高(P<0.01)。结论CVB3诱导小鼠病毒性胰腺炎,胰腺组织浸润Th17/Treg及其相关细胞因子IL-6和IL-17上调,促进疾病进展。
- 王瑞芳宗可鑫宋芹芹夏冬杜海军刘宓夏志强韩俊宋娟
- 关键词：CVB3炎性浸润TH17TREG
- 2015-2021年徐州市呼吸道合胞病毒感染与气象因素的关联分析与预测
- 2023年
- 目的分析呼吸道合胞病毒感染与气象因素的关联,预测并解释其变化趋势。方法收集2015—2021年徐州市住院儿童的严重急性呼吸道感染病例。通过实时荧光聚合酶链式反应检测呼吸道合胞病毒(RSV),使用SPSS 26.0软件对结果进行统计分析。使用2015—2019年数据构建负二项回归模型,探究对RSV感染有影响的气象因素。使用多变量时间序列模型预测2020—2021年RSV检出率。结果2015—2021年共收集1663例严重急性呼吸道感染患儿样本,其中RSV检出阳性样本218例(13.1%)。RSV季节效应明显,以1年为周期出现冬季(12月至次年2月)为高峰,夏季(6—8月)为低谷。负二项回归分析表明,月平均气温、月平均相对湿度和月总日照时数可能是本地区RSV感染的影响因素。以日照时数为协变量的时间序列模型预测结果表明,2020年预测效果较好,实际值与预测值接近。2021年的预测变化趋势一致,但实际值高于预测值。结论月平均气温降低、月平均相对湿度升高或月总日照时数延长可能是本地区儿童中RSV感染增加的影响因素。可以使用2015—2019年数据建立预测模型,其中2021年预测值的偏差,体现了疾病的流行是多因素相关,提示未来RSV的流行趋势可能会上升。
- 曹润冬夏冬宋芹芹宋娟夏志强刘宓杜海军朱人和韩俊高晨
- 关键词：呼吸道合胞病毒气象时间序列分析
