黄建华
- 作品数：1 被引量：4H指数：1
- 供职机构：中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 亚洲玉米螟幼虫酚氧化酶原基因序列的生物信息学分析被引量：4
- 2009年
- 酚氧化酶原PPO是昆虫免疫的关键酶,本文从生物信息学角度对亚洲玉米螟Ostrinia furnacalis Guen啨e幼虫PPO进行分析,为进一步研究其高级结构与功能的关系提供理论依据。利用我们已提交到GenBank的数据,采用在线分析及MEGA4和RasMol软件对亚洲玉米螟酚氧化酶原(Of-PPO)的核苷酸和氨基酸序列、系统发生关系和蛋白质三级结构进行分析。结果表明:Of-PPO全长cDNA序列有2686bp,包含一个2079bp的开放阅读框,其推导的693个氨基酸序列中包含6个组氨酸残基构成的2个铜离子结合位点,以及保守的硫羟酸酯区域。Of-PPO属于PPO2类群,其N端不含信号肽,无跨膜结构域区域,无糖基化位点,44个磷酸化位点均匀分布于整个多肽链中,有2段序列可能形成卷曲螺旋,有5个区域的氨基酸具较强疏水性,其二级结构中α-螺旋占22.54%,随机卷曲占56.79%。同源建模显示其三级结构为"α/β型"中的"滚筒结构",存在一个明显的空位,可能与该酶催化活性有关。本文可为Of-PPO的实验研究和应用开发提供有价值的信息。
- 冯从经陆剑锋黄建华郭晓丽桑守亮
- 关键词：亚洲玉米螟酚氧化酶原生物信息学分析同源建模
