闻芳
- 作品数：8 被引量：297H指数：6
- 供职机构：清华大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划北京市科技计划项目更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术更多>>
- 基于主元分析的对称性检测被引量：28
- 1999年
- 对称性在日常生活中广泛存在，对一般物体镜像和旋转对称性的快速检测一直是计算机视觉的难题，至今未有通用性很好且效率较高的算法．本文提出一种新的方法，把对称性检测问题转化为协方差矩阵的特征值分解问题，文中的３个定理及其证明奠定了理论基础．此外还把这一结论推广到旋转对称性的检测问题．仿真表明：这种方法理论基础扎实，操作简便，非常适合于强镜像对称复杂图像的镜像对称轴方向检测．
- 卢春雨张长水闻芳阎平凡
- 关键词：主元分析镜像计算机视觉
- 基于局部线性映射神经网络和亮度补偿的彩色人脸检测被引量：22
- 1999年
- 人脸识别是一个具有广阔应用前景和极富挑战性的研究课题。作为自动人脸识别系统的第一步，快速有效的人脸检测至关重要。利用颜色信息进行人脸检测，具有直观、简单、快速的特点，非常适用于作为自动人脸识别系统的人脸粗定位环节。该文提出一种基于局部线性映射（ Ｌ Ｌ Ｍ）神经网络和亮度自适应补偿的人脸区域检测算法，根据待检测图像上每点的颜色值判断它属于人体区域还是背景区域，从而框出可能的人脸区域。实验表明，此算法对于实验室背景下的人脸检测取得了较好的效果。一方面可以较好地区分人脸区域和背景区域，甚至与人脸颜色比较相近的背景区域，同时对实验室环境下各种光照条件的变化具有很好的鲁棒性。
- 闻芳周杰张长水李衍达
- 关键词：人脸检测亮度补偿神经网络
- 针对基因选择性剪接的多序列比对算法研究被引量：7
- 2001年
- 为对真核基因的选择性剪接形式进行准确、快速、有效的研究 ,提出了一种启发式多序列比对算法。该算法借助引导树启发序列之间的两两段对段比对 ,通过建立序列相似性估计模型 ,给出了一种由序列间相同词数估计序列相似程度的方法。利用这种方法构造引导树 ,大大缩短了其构造时间。通过采用序列间的段对段比对 ,克服了间隙罚分问题 ,更准确地反映了真核基因的选择性剪接形式。引导树构造方法的改进和快速局部比对算法的采用 ,使得算法运行速度大大高于一般算法。
- 计宏凯周晴闻芳季梁
- 关键词：多序列比对选择性剪接基因
- 基因表达调控与选择性剪接机制研究被引量：7
- 2001年
- 随着人类基因组计划 (HGP)的完成 ,生物信息学的研究进入了后基因组时代 ,用计算方法对基因表达调控和基因功能进行研究成为生物信息学研究的核心内容 .由于在真核基因表达调控中的特殊地位 ,选择性剪接成为研究真核基因表达调控的重要内容之一 .本文从收集选择性剪接基因的数据出发 ,尽可能的收集已知的选择性剪接的基因和它们的各种转录产物 ,并进行了适当的筛选以保证数据的质量和统计分析的可靠性 .对挑选出的 371个人类基因 ,提取各种转录产物的编码区 (codingregions,或简称cds) ,应用一种新的针对选择性剪接的多序列比对程序ASALIGN进行多序列比对来揭示不同cds间的剪接关系 ,提出其中的可变区域与不可变区域 ,并对可变区域与不可变区域的长度分布 ,可变区域在cds中出现的位置 ,由于选择性剪接引起的同一段序列读码框相位的变化以及可变区域与不可变区域及二者边界上的密码子使用频率进行了统计分析 ,得到了一些很有意思的结果 .
- 闻芳李衍达
- 关键词：选择性剪接多序列比对基因结构
- 基于支持向量机(SVM)的剪接位点识别被引量：28
- 1999年
- 剪接位点的识别作为基因识别中的一个重要环节， 一直受到研究人员的关注。考虑到剪接位点附近存在的序列保守性，已有一些基于统计特性的方法被用于剪接位点的识别中，但效果仍有待进一步改进。支持向量机（Ｓｕｐｐｏｒｔ Ｖｅｃｔｏｒ Ｍａｃｈｉｎｅｓ） 作为一种新的基于统计学习理论的学习机，近几年有了很大的发展，已被应用在模式识别的许多问题中。文中将其用于剪接位点的识别中，并针对满足ＧＴ－ ＡＧ 规则的序列样本中虚假剪接位点的样本数远大于真实位点这一特性， 提出了一种基于ＳＶＭ 的平衡取小法以获得更好的识别效果。实验结果表明，应用支持向量机进行剪接位点的识别能更好地提取位点附近保守序列的统计特征，对测试集具有更好的推广能力，并且使用上更加简单。这一结果为剪接位点的识别提供了一种新的方法，同时也为生物大分子研究中结构和位点的识别问题的解决提供了新的线索。
- 闻芳卢欣孙之荣李衍达
- 关键词：基因识别支持向量机剪接位点
- 外显子与内含子序列的分形尺度参数可分性研究被引量：4
- 1999年
- 近年来， 关于ＤＮＡ 序列的分形尺度特性的研究引起了研究者广泛的兴趣， 许多研究表明，ＤＮＡ 序列的外显子和内含子区域具有不同的分形尺度特性，这有可能成为区别外显子和内含子序列的特征之一。文中应用ＷＴＭＭ（ Ｗａｖｅｌｅｔ Ｔｒａｎｓｆｏｒｍ Ｍｏｄｕｌｕｓ Ｍａｘｉｍ） 方法分析ＤＮＡ 序列的分形结构，计算表征分形结构尺度特性的量化参数 Ｈｌｄｅｒ 指数。考虑到外显子序列的三联体编码特性， 计算了ＤＮＡ 序列及三个不同的相位序列分别在三种ＤＮＡ ｗａｌｋ 方式下得到的序列的Ｈｌｄｅｒ 指数，并将每个Ｈｌｄｅｒ 指数作为一维特征，考察外显子与内含子序列的分布。计算结果表明，只按单个分形尺度参数来看，外显子与内含子不具有可分性。在此基础上，从模式识别的角度出发， 将外显子与内含子视为由此构成的多维特征空间中的两个模式类， 由此设计基于ＬＬＭ（ＬｏｃａｌＬｉｎｅａｒ Ｍａｐ） 神经网络的分类器，并对分类器的错误率进行估计，实验结果表明外显子序列与内含子序列在此特征空间中具有聚类特性，从而表明以这一组分形尺度参数作为序列特征，外显子与内含子具有可分性。
- 闻芳卢欣孙之荣李衍达
- 关键词：外显子内含子
- 基于区域特征的快速人脸检测法被引量：207
- 1999年
- 提出一种新的基于区域特征的快速人脸检测方案，相比传统马赛克方法明显改进：重新设计了基于器官的人脸分块策略，使规则制订直观可信；采用块形状自适应技术以提高对不同脸形的适应性，改善了检测算法的适用范围；引入有效的粗检测和层次化局部搜索技术，大大提高了检测速度。仿真表明，这种方法对人脸数目、尺寸、脸形、光照、背景复杂性无限制，适用于不同质量尤其是恶劣质量的图像。
- 卢春雨张长水闻芳阎平凡
- 关键词：人脸识别人脸检测身份鉴别
- 选择性剪接相关问题研究
- 有关选择性剪接的研究是功能基因组时代研究的重要前沿问题之一，这方面的研究不仅具有重要的理论意义，对药物设计、疾病防治等问题也具有重要的实际意义。该论文在整体的、相互联系的观点指导下，运用生物信息学的方法，多层次、多角度地...
- 闻芳
- 关键词：生物信息学选择性剪接
