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郭晓红: 作品数：197 被引量：531H指数：13; 供职机构：山西农业大学更多>>; 发文基金：国家自然科学基金山西省科技攻关计划项目山西省青年科技研究基金更多>>; 相关领域：农业科学生物学医药卫生文化科学更多>>

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仔猪不同发育阶段结肠微生物菌群特征分析被引量：17: 2019年; 旨在通过高通量测序技术比较马身猪与晋汾白猪不同生长发育阶段结肠微生物菌群结构与特征的差异。本研究以马身猪和晋汾白猪为试验对象,分别在仔猪1、28和70日龄3个阶段随机挑选体重相近的3头公猪,采用16S rRNA高通量测序技术对结肠微生物多样性进行研究。通过菌群分类学分析发现,两个品种仔猪肠道微生物分布于15个门、28个纲、59个目、100个科、290个属。厚壁菌门和拟杆菌门为优势菌门,平均所占比例分别为49.03%、31.94%。仔猪刚出生时品种间肠道微生物多样性差异不显著,随着仔猪生长发育,各品种微生物多样性出现极显著升高,在晋汾白猪仔猪保育阶段(28~70 d)基本趋于稳定。两品种仔猪不同阶段的特异菌群随着日龄增加出现显著差异。关联分析发现,肠道菌群与血清中内毒素(LPS)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素-6(IL-6)浓度之间存在显著相关性(P<0.05),而与二胺氧化酶(DAO)和D-乳酸(D-LA)浓度相关性不显著(P>0.05)。不同品种间,与LPS、TNF-α、IL-6显著相关的结肠微生物菌群存在差异。综上表明,仔猪结肠微生物菌群结构与组成在不同品种、不同生长发育阶段均存在显著差异,对仔猪免疫性能具有重要作用。; 郭晓红郭玉龙刘亚丹刘娟史文倩董磊蔡春波曹果清李步高高鹏飞; 关键词：结肠

猪肌源性前体脂肪细胞的分离培养和成脂诱导分化研究被引量：11: 2018年; 本研究旨在建立猪肌源性前体脂肪细胞的体外培养体系,并探究成脂诱导分化过程中相关基因的表达,为进一步研究调控猪肌内脂肪沉积的分子机制提供试验材料。采集15日龄仔猪的背最长肌组织,使用Ⅱ型胶原酶进行消化,分离获得前体脂肪细胞,进行原代、传代培养以及成脂诱导,观察细胞形态、测定生长曲线、油红O染色鉴定以及检测成脂关键基因PPARγ、FABP4、C/EBPα、C/EBPβ、ZFP423、SREBP1、PRDM16和HSL在诱导分化过程中的表达量。结果表明,分离的猪肌源性前体脂肪细胞在6～7 h,发现少量细胞开始贴壁,贴壁的细胞呈似圆型、小梭型以及其它不规则形状,经传代后细胞形态均一,呈典型的成纤维细胞样,细胞的生长曲线呈S型。添加分化培养基进行诱导后,所有基因在细胞分化的早期均有表达,FABP4、C/EBPα、SREBP1与PPARγ基因在分化早期表达量极显著升高(P <0. 01),在后期表达量极显著下降(P <0. 01),C/EBPβ、ZFP423和PRMD16基因的表达量在分化过程中未见显著变化,HSL的表达量随着分化进行极显著降低(P <0. 01)。在诱导分化12 d左右,油红O染色呈现红色。综上表明,本研究成功建立了猪肌源性前体脂肪细胞的分离与培养体系,进行成脂诱导分化,揭示分化过程中关键基因的表达规律,为进一步研究猪肌内脂肪沉积的分子机制和改善肉质品质奠定基础。; 张宁芳成志敏乐宝玉秦本源王媛媛王鹤洁高鹏飞郭晓红李步高曹果清; 关键词：肌内脂肪成脂分化

一种用于鉴别晋汾白猪的SNP位点组合及其应用: 本发明涉及分子生物学技术领域，尤其涉及一种用于鉴别晋汾白猪的SNP位点组合及其应用。本发明研究得到包含有26个SNP位点的SNP位点组合，基于这些SNP位点可以实现晋汾白猪的品种鉴定。本发明提供的SNP位点组合可以准确、...; 李步高曹果清崔子旭高新宇蔡春波杨阳郭晓红贠红梅杨冠青高鹏飞路畅李萌魏强利

一种猪肌组织发育相关基因MYH7的表达检测方法: 本发明提供了一种猪肌组织发育相关基因MYH7的表达检测方法，包括引物设计与合成、RNA的提取、cDNA的合成、实时荧光定量PCR反应、PCR产物的鉴定，所述引物设计与合成以18S为内参基因，根据NCBI genebank...; 王海珍高鹏飞郭晓红曹果清李步高; 文献传递

5个猪种CAST基因第二内含子微卫星标记的遗传多态性分析被引量：1: 2013年; 猪CAST基因第2内含子中存在以GT为核心序列的微卫星座位。分析了长白猪、大白猪、杜洛克猪、马身猪和山西黑猪等5个猪种227个个体在该座位的遗传变异,检测到4个等位基因,分别是A(171bp)、B(179bp)、C(185bp)和D(191bp)。在山西黑猪和杜洛克猪中,等位基因D的频率较高,分别为0.6389和0.5143;在马身猪群体中,等位基因B的频率较高,为0.6310;在大白猪和长白猪群体中,4种等位基因的频率相近,分别介于0.1389～0.3889之间和0.1417～0.3500之间。在所检测的群体中,共有10种基因型,在长白猪和大白猪群体中,纯合子所占比例较高,其遗传纯合度分别为0.6667和0.7037,而在山西黑猪和马身猪中,杂合子比例较高,其遗传杂合度分别为0.6111和0.5476。由于CAST基因是影响猪肉质品质的候选基因之一,推测该微卫星座位可能对肉质品质有一定影响。; 赵先萍张燕青梁琳何永梅高鹏飞郭晓红李步高曹果清; 关键词：CAST基因微卫星遗传多态性

小尾寒羊高繁殖力候选基因RBP4的研究被引量：29: 2006年; 以视黄醇结合蛋白4(retinol binding protein 4,RBP4)基因为候选基因,采用PCR-SSCP技术分析了RBP4基因在高繁殖力绵羊品种(小尾寒羊、湖羊)以及低繁殖力绵羊品种(多赛特羊、萨福克羊)中的单核苷酸多态性,同时研究这个基因对小尾寒羊高繁殖力的影响。结果表明:RBP4基因扩增片段在4个绵羊品种中存在PCR-SSCP多态性。BB基因型只出现在高繁殖力绵羊品种中,而低繁殖力绵羊品种则没有BB基因型;AB基因型频率随着绵羊繁殖力的降低而升高;AA基因型只出现在小尾寒羊、多赛特羊中。BB基因型小尾寒羊产羔数分别比AA和AB基因型多0.52只(P<0.05)和0.67只(P<0.05),AA和AB基因型小尾寒羊产羔数没有显著差异(P>0.05)。本研究检测的绵羊RBP4基因座位与小尾寒羊高繁殖力相关。; 何远清郭晓红王金玉储明星方丽叶素成周忠孝; 关键词：小尾寒羊高繁殖力 PCR-SSCP

脂联素抗消化系统肿瘤的研究进展被引量：1: 2015年; 脂联素是主要由白色脂肪组织合成和分泌的脂肪细胞因子。大量临床试验和基础研究表明,脂联素不但在糖脂代谢过程中起着重要的调节作用,而且也与肥胖相关的生殖、消化和内分泌系统恶性肿瘤的发生发展密切相关,具有重要的抗肿瘤效应。; 郭晓红张军林吴明煜; 关键词：脂联素肿瘤

马身猪MEF2A基因4种可变剪接体的克隆和生物信息学分析被引量：1: 2017年; 本研究旨在克隆马身猪肌细胞增强因子2A(myocyte enhancer factor 2A,MEF2A)基因的不同剪接体类型。依据转录组测序对可变剪接的预测结果,试验扩增MEF2A基因第5~8外显子之间的编码区,用生物信息学软件分析了马身猪MEF2A基因不同剪接体的序列特性,预测保守结构域,构建系统进化树,比对不同物种MEF2A的氨基酸同源性。结果显示,获得了4个MEF2A基因的剪接体,MEF2A1的第5~8外显子正常剪接;MEF2A2缺失了第5外显子,第6外显子的5′端多出138bp,第7外显子的3′端多出102bp;MEF2A3缺失了第5外显子,第6外显子的5′端多出138bp;MEF2A4第7外显子的3′端多出102bp。插入的138bp序列编码的蛋白质中存在1个保守结构域HJURP_C,这可能与MEF2A参与肝细胞纤维化作用有关。MEF2A1和MEF2A4与猪MEF2A1(GenBank登录号:NP_001090890.1)同属于一个亚群,同源性高达98.9%,MEF2A2和MEF2A3与猪MEF2A2(GenBank登录号:NP_001093168.1)同属于一个亚群,同源性分别为98.2%和98.9%。本试验成功克隆了4个MEF2A基因的剪接体,为进一步研究其蛋白功能奠定基础。; 张旗郭晓红高鹏飞靳玉舒李萌成志敏张宁芳乐宝玉曹果清李步高; 关键词：可变剪接生物信息学

基于全基因组重测序对晋汾白猪单核苷酸多态性位点鉴定和筛选: 2023年; 旨在鉴定晋汾白猪单核苷酸多态性位点(SNP)并分析其特征,筛选特异性SNPs。本研究对30头晋汾白猪(9头公猪和21头母猪)耳组织DNA进行全基因组重测序,利用GATK和VEP软件检测变异位点和进行注释分类。整合晋汾白猪与其亲本的基因组重测序数据,基于等位基因频率检测晋汾白猪特异SNPs位点,并进行功能富集分析。经测序以及数据过滤后共获得约1761.73 Gb的Clean reads,Q30均值为91.77%,平均比对率为75.61%,平均覆盖度为14.7 X。去冗余后共得到14680807个SNPs,大部分SNPs位于1号染色体和基因非编码区。基于等位基因频率筛选到87366个晋汾白猪特异SNPs,主要分布于2号染色体和内含子区。此外,外显子区的错义突变SNPs位点分布于343个基因,这些基因显著富集于细胞器和细胞器组分等GO生物学过程,以及肠道免疫、脂肪酸降解等KEGG信号通路。利用全基因组重测序和生物信息学技术分析了晋汾白猪SNPs与其特征,并筛选了87366个特异SNPs位点,将为晋汾白猪分子标记开发、种质鉴定、分子育种等工作奠定研究基础。; 路畅董磊张万锋高鹏飞郭晓红蔡春波曹果清李步高; 关键词：单核苷酸多态性

一种与猪骨骼肌卫星细胞增殖相关的lncRNA标志物及其应用: 本发明属于分子遗传学技术领域，具体为一种与猪骨骼肌卫星细胞增殖相关的lncRNA标志物及其应用，所述lncRNA标志物为lnc‑88672，核苷酸序列为SEQ ID NO.1。本发明首次发现lnc‑88672表达与猪骨骼...; 吴怡琦曹果清秦本源杨阳杨帅蔡春波高鹏飞郭晓红李步高路畅; 文献传递

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