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周晓雪
作品数:
2
被引量:1
H指数:1
供职机构:
北京大学化学与分子工程学院化学生物学系
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发文基金:
国家自然科学基金
国家重点基础研究发展计划
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相关领域:
生物学
理学
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合作作者
赵新生
北京大学化学与分子工程学院化学...
尹延东
北京大学化学与分子工程学院化学...
陈旭东
北京大学化学与分子工程学院化学...
李勋
北京大学化学与分子工程学院化学...
曲鹏
北京大学化学与分子工程学院化学...
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寡聚核苷酸中鸟苷对四甲基罗丹明的荧光猝灭
2009年
具有核苷特异性的荧光猝灭技术在生物领域具有广泛应用.为了更好地理解这一过程的机理及其影响因素,研究了核苷对四甲基罗丹明(TMR)染料的分子间猝灭和在同一条寡聚核苷酸链中的分子内猝灭.与以前的研究结果一致,脱氧单磷酸鸟苷(dGMP)可以有效地猝灭TMR,而其他单磷酸腺苷对其的猝灭可以忽略.由斯特恩-沃尔默图获得TMR和dGMP的双分子猝灭常数为Ks=52.3L/mol.将TMR标记在寡聚核苷酸末端,可以观测到其荧光通过光致电子传递有效地被鸟苷猝灭,我们利用荧光相关光谱的方法测定了这一过程的猝灭速率常数.此外,所得的数据还显示鸟苷附近的碱基会对分子内的猝灭过程产生显著的位阻效应.这些结果将有助于设计寡聚核苷酸荧光探针和理解G猝灭过程.
曲鹏
陈旭东
周晓雪
李勋
赵新生
关键词:
鸟苷
荧光
寡聚核苷酸
最大熵法分析寡聚核苷酸链内碰撞的荧光相关光谱(英文)
被引量:1
2010年
准确地由荧光相关光谱(FCS)的实验数据提取动力学信息一直是一个挑战.本文对比了三种主要的方法:依赖于模型的多指数函数法,经验的拓展指数函数法和不依赖于模型的最大熵法.多指数函数法的物理意义直接但在复杂体系中难以应用和解释.拓展指数函数法简单易行但其物理意义含混不清.最大熵法不依赖于具体的物理模型但拟合结果对实验噪音很敏感.经研究我们发现一个好的选择是将最大熵法和多指数函数法结合在一起使用.对寡聚核苷酸链内碰撞荧光相关光谱的研究发现,在单链DNA中可以形成碱基对时,有两个并行的链内碰撞反应.以前的拓展指数函数法分析则不能提供这样的信息.我们建议在荧光相关光谱研究中审慎地使用最大熵法.
尹延东
周晓雪
赵新生
关键词:
寡聚核苷酸
光致电子转移
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