史晓黎
- 作品数:4 被引量:2H指数:1
- 供职机构:北京大学更多>>
- 发文基金:国家重点基础研究发展计划中国科学院知识创新工程国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 籼稻基因组中的tRNA研究被引量:2
- 2002年
- 在籼稻基因组的127551个重叠群中,共发现了596个tRNA基因,其中有3个携带硒代半胱氨酸的tRNA基因和一个抑制型tRNA基因.除了上述4个特殊的tRNA基因外,592个tRNA可按密码子分成45种,Guthrie等人提出的修正摆动假设完全成立.在这些重叠群中,还发现了27个假基因,但未发现trnT-CGU基因,这可能是由于现有序列数据的不完备.在上述592个tRNA基因中,可能存在冗余,而且还可能再有新发现.研究了水稻基因中密码子的使用与tRNA基因的数目之间的关系.从水稻的两个栽培亚种——籼稻和粳稻的叶绿体基因组中,各发现了33个tRNA基因,经多重联配发现,两组tRNA基因完全相同.
- 王希胤史晓黎郝柏林
- 关键词:籼稻基因组TRNA基因叶绿体基因测序
- 水稻基因组中的tRNA和rRNA基因
- 在最近完成测序的水稻籼稻和粳稻两个亚种基因组中,各找到564和519个较为可靠的tRNA基因,进一步证实了于2002年发表的基于基因组序列草图的分析结果.修正的摆动假设,即至少需要46种tRNA基因才能译出61种可能的反...
- 王希胤史晓黎郝柏林
- 关键词:水稻基因组籼稻粳稻
- 文献传递
- 水稻基因组中的tRNA和rRNA基因(英文)
- 2004年
- 在最近完成测序的水稻籼稻和粳稻两个亚种基因组中 ,各找到 5 6 4和 5 19个较为可靠的tRNA基因 ,进一步证实了于 2 0 0 2年发表的基于基因组序列草图的分析结果。修正的摆动假设 ,即至少需要 4 6种tRNA基因才能译出 6 1种可能的反密码子 ,在这两个亚种中均准确成立。在这 4 6种tRNA中 ,有些在籼稻和粳稻中的序列均全同。有 18种水稻tRNA与拟南芥中的相应序列全同。在籼稻基因组序列中还发现了 384个 5SrRNA基因 ,一批 17S和5 .8SrRNA基因以及一个 2 5SrRNA基因。这些rRNA基因的不完备是由于它们通常以串接阵列形式存在于异染色质区域 ,而后者在全基因组霰弹法测序中不易完整测出。在tRNA和rRNA基因序列之间发现了多处互补片段 ,这将有助于研究它们的进化和相互作用。
- 王希胤史晓黎郝柏林
- 关键词:TRNARRNA水稻基因组籼稻粳稻
- 水稻基因组复制片段的发现及两类基因进化速率与形成原因的研究
- 水稻两个栽培亚种Japonica和Indica全基因组序列草图于2002年发布,为探索水稻基因组进化提供了宝贵资源。多倍化是影响被子植物进化的重要机制。研究表明,许多被子植物很可能是由古多倍体祖先演化而来。近年来,对植物...
- 史晓黎
- 关键词:水稻多倍化GC含量自然选择
- 文献传递